刘运
- 作品数：6 被引量：9H指数：2
- 供职机构：四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划成都大熊猫繁育研究基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学化学工程更多>>
- 新霉素的创制与应用研究
- 开展了农用抗生素新霉素的创制研究。离体活性表明新霉素对白菜软腐病菌、柑橘溃疡病菌、生姜姜瘟病菌和水稻白叶枯病菌有明显抑制作用，MIC分别为0.5，2.0，2.0和O.25μg/ml，浓度为200μg/ml时，体外防效分别...
- 陶科张新刚崔文华史冠莹刘运贺燕侯太平
- 关键词：新霉素抑菌活性稳定性分析安全性评价发酵动力学
- 文献传递
- 从头组装豚鹿血液转录组揭示雌雄基因表达差异
- 2022年
- 豚鹿Axis porcinus是国家一级重点保护野生动物,为理解其基因表达上的基本特征,本研究采用RNA-seq技术对16个豚鹿血液样本进行了测序和从头组装,一共得到615548条unigenes,Contig N50为803 bp。将组装的转录本进行同源序列比对注释,发现豚鹿血液在信号转导、抗病毒感染和免疫系统等通路上表达的基因最丰富。通过比较雌雄豚鹿的差异表达基因(DEGs),鉴定了1781个在雄性中显著上调和14个显著下调的性别差异表达基因,雄性的高表达DEGs远多于雌性,且主要富集在精子形成、睾丸功能和自身免疫相关通路,暗示雌雄豚鹿在生殖发育和自身免疫方面存在较大差异。部分可能与鹿角生长相关的基因(Rela、ADAMTS2、OLIG1、Snai1、PTH1R、TGFBI、MMP9)均在雄性豚鹿中显著高表达。本研究为丰富豚鹿转录表达提供了基础数据,为进一步深入挖掘豚鹿功能基因、分子标记开发以及鹿角形成机制提供了参考。
- 刘运柳方圆余建秋牛李丽刘选珍李静
- 三种方法对草地贪夜蛾基因组转座子的注释
- 2021年
- 【目的】转座子(Transposable element,TE)是昆虫基因组的重要组成,不同昆虫类群的TE组成、基因组占比及转座活性等基本特征存在巨大差异。本研究旨在探究不同方法对于草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda TE的注释效果,并在基因组水平阐明草地贪夜蛾TE的基本特征。【方法】采用3种方法对草地贪夜蛾基因组TE进行预测,包括基于数据库Repbase、ArTEdb进行同源预测,基于重复序列的特性和结构进行从头预测。【结果】ArTEdb方法和从头预测方法鉴定的TE分别占基因组21.48%和27.26%,其中LINE元件无论是拷贝数还是分布密度都最高;其次是DNA元件。2种方法预测的TE分歧率分布峰值约10%,而分歧率<10%的TE主要是DNA转座子和LINE。比较3种方法的预测结果,Repbase方法灵敏度低,预测的TE远少于其他2种方法。ArTEdb方法能注释出更多的TE,但该方法对于已知超家族鉴定效果不佳。而从头预测注释出的TE数量多,且能划分到不同超家族,甚至能鉴定不包含在Repbase鳞翅目库的TE超家族。【结论】草地贪夜蛾基因组最主要的TE类型是LINE和DNA元件,基因组存在大量年轻的转座子,草地贪夜蛾在TE家族的组成上与其它鳞翅目物种存在差异。从头预测的方法对草地贪夜蛾基因组TE注释效果较其它2种方法更好。这一研究结果为深入研究转座子的功能及其对草地贪夜蛾基因组多样性奠定了基础。
- 张春辉王磊刘运彭长军岳碧松李静
- 关键词：转座子
- 费氏链霉菌中子辐射诱变菌株对新霉素的生物转化被引量：2
- 2010年
- 对新霉素产生菌费氏链霉菌进行中子辐射诱变和突变株筛选,获得不产新霉素的突变株。以突变株为转化菌种,以新霉素为底物,对转化发酵液进行高效液相色谱分析,研究了不同转化条件对新霉素转化的影响。结果表明,底物浓度、底物添加时间、底物添加方式、接种量、培养基装量、转化时间、碳源、氮源、pH、温度对新霉素转化具有不同程度的影响。以转化条件优化参数进行转化大量培养,转化液经4步离子交换层析进行分离纯化,薄层层析检测纯化样品为单一斑点。采用薄层生物自显影对获得的4个转化产物分离样品做生物活性检测,发现4个样品对金黄色葡萄球菌和姜青枯假单孢杆菌都具有抑制活性,1个样品对大白菜软腐病菌具有明显的抑制活性。
- 马林达娃刘运史冠莹杨茜杨从军杨凌云张新刚陶科侯太平
- 关键词：新霉素生物转化辐射诱变离子交换层析抑菌活性
- Sanglifehrin A产生菌Streptomyces flaveolus DSM 9954遗传转化系统的建立被引量：1
- 2011年
- Sanglifehrin A的产生菌淡黄色链霉菌Streptomyces flaveolus DSM 9954,通过筛选,得到其菌丝培养基为TSB,生孢培养基为ISP-4,抗性实验显示淡黄色链霉菌Streptomycesflaveolus DSM 9954对所选抗生素都较敏感.利用原生质体转化和接合转移都成功地构建了两种遗传转移系统,并且从接合转移成功的链霉菌转化子中回收质粒pKC 1139,经EcoRⅠ单酶切电泳,验证了质粒确实通过接合转移从大肠杆菌转移至宿主链霉菌,这为研究Sanglifehrin A的生物合成机制和结构改造奠定了基础.
- 刘运陶科史冠莹瞿旭东侯太平
- 关键词：原生质体转化
- 费氏链霉菌HTP6分批发酵动力学被引量：6
- 2009年
- 对费氏链霉菌HTP6产新霉素的分批发酵动力学进行了研究,并建立了动力学模型。对数生长期最大比生长速率μm为0.0866h-1,产物合成期最大合成速率qp为1.1867×10-4g/(mL·h)。对实验数据与模型模拟值进行拟合检验,表现出很好的适用性,实验平均相对偏差小于5%。表明该动力学模型对费氏链霉菌产新霉素的发酵生产具有实际意义。
- 张新刚史冠莹陶科滕云崔文华刘运全鑫侯太平
- 关键词：新霉素发酵动力学模型
