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心力衰竭相关基因和蛋白质数据库的初构被引量：9: 2002年; 目的 :构建心力衰竭相关基因和蛋白质的数据库 ,为心血管疾病分子生物学研究提供信息服务。方法 :以美国国立生物技术信息中心、欧洲分子生物信息学实验室、美国国立图书馆等知名生物信息组织提供的数据库集群作为信息数据来源 ;根据心力衰竭的特点设计数据库的结构 ;编写软件从上述信息资源中自动获取数据 ,进行分类整理 ,存入数据库 ,利用软件的管理和查询功能对于本地数据进行管理和检索。结果 :经过对现有基因和蛋白质数据库的检索 ,目前确定了 4 0 7条与心衰相关的基因 ,4 0 4 6条相关核酸序列和蛋白质序列 ;建立心力衰竭相关基因和蛋白质数据库 ,并对其内容进行初步分析。实现了网上发布和查询。结论 :通过整合现有相关信息 ,建立了一个与心衰相关基因和蛋白质的二级数据库。; 张其鹏张丹刘贝朱晓华卢铭陈光慧尚彤汤健; 关键词：充血性心力衰竭数据库基因库

高血压相关基因和蛋白质数据库的初构被引量：5: 2002年; 目的 :构建高血压相关基因和蛋白质数据库 ,以促进高血压医学生物信息学的研究。方法 :以GenBank、LocusLink、GDB、GenCard、Proteome等数据库作为信息数据来源 ;根据高血压相关信息的内容将数据库设计为基因、蛋白质和功能 3部分 ;编写软件从上述信息资源中获取数据 ,分类整理 ,存入数据库 ,利用软件的管理和查询功能对于本地数据进行管理和检索。结果 :经过OMIM、文献和相关数据库的检索 ,目前确定了 431个高血压的相关基因 ,379个蛋白质 ;建立高血压相关基因和蛋白质数据库 ,并对其内容进行初步分析。最终实现了网上发布和查询。结论 :通过整合现有相关信息 ,建立一个种类繁多、内容齐全与高血压相关的二级数据库 ,为高血压和心血管的研究提供一个新的便捷的生物信息查询的工具。; 张其鹏张丹刘贝朱晓华卢铭陈光慧尚彤汤建; 关键词：高血压基因蛋白质数据库生物信息学

蛋白质、核酸序列信息的获取、管理和发布被引量：9: 2002年; 目的 :建立通用的蛋白质、核酸序列信息数据类型和数据库结构 ,为建立专用的生物医学信息数据库奠定基础。设计自动获取数据的软件 ,彻底改变手动获取数据的方式。方法 :以美国国立生物技术信息中心 (NCBI)建立的GenBank数据库和欧洲分子生物信息学实验室 (EBI)维护的Swiss Prot数据库分别作为一级和二级数据库的信息来源 ;通过分析 ,设计新的数据模型 ;建立本地数据库。编写了专用软件从网上获取数据 ,并且进行分类整理 ,存入数据库 ,同时利用软件的管理和查询功能对于本地数据进行管理和检索。结果 :建立核酸、蛋白质常用信息数据库 ,设计相关信息获取、管理软件。以心衰相关基因数据库为例 ,利用所设计系统实现专业生物信息数据库。提出网上发布的方案。结论 :结合生物技术研究的需要 ,设计软件获取网上的生物信息数据 ,可以大大地提高效率。将不同的数据库数据结合起来 ,建立新的数据类型和数据分类 ,可以改进查询方式。; 尚彤刘贝张其鹏张丹谭耀麟; 关键词：文献型数据库生物医学工程蛋白质核酸序列信息存贮

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张丹