杨林静
- 作品数：12 被引量：61H指数：2
- 供职机构：中国科学院化学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：生物学理学一般工业技术电气工程更多>>
- 三链DNA结构研究的新进展
- 1997年
- 本文详细总结了近年来三螺旋ＤＮＡ的结构和应用研究方面的进展，分析了各种因素（例如ｐＨ、抗衡离子、温度等）对三螺旋稳定性的影响。
- 杨林静刘次全白春礼
- 关键词：DNA三链DNA
- 溴代胞嘧啶分子内三螺旋DNA的理论研究
- 1998年
- 运用分子力学方法研究了 3个含溴代胞嘧啶的分子内三螺旋及相应的未溴代分子内三螺旋DNA .理论结果表明 :当分子内三螺旋Hoogsteen嘧啶链的胞嘧啶被溴代胞嘧啶取代后其稳定性最强 ;而当分子内三螺旋 2条嘧啶链的胞嘧啶同时被溴代后 ,其稳定性最差 .从分子力学计算得到 ,4种分子内三螺旋的碱基以C3′ endo糖环构象为主 .在三螺旋YTCY( 2条嘧啶链中的胞嘧啶均被溴代胞嘧啶取代 )中 ,也含有一定数量的C2′ endo糖环构象 .因此 ,分子内三螺旋YTCY是A DNA和B DNA的综合体 ,而其他 3种三螺旋则是典型的A DNA .
- 杨林静刘峁子李清王琛白春礼
- 关键词：分子力学DNA
- 液晶吸附结构的STM形貌研究
- 1998年
- 在室温下 ,利用扫描隧道显微镜 (STM )对 4 戊基 4′ 甲氧基苯甲酸苯酯吸附在石墨基底上的结构进行了研究 ,结果表明分子为单层且有一定位错的头 (甲氧基 )对头、尾 (烷基 )对尾排列 ;理论计算表明 :外加偏压产生的电场对分子轨道能级及其极化率具有一定的影响 ;由于分子的HOMO ,LUMO能级与石墨费米能级之间的能量差值较大 ,低偏压下不利于STM成象 ,因此 ,分子的极化率对石墨基底功函数的影响可能是形成该液晶分子STM形貌的主要因素 .
- 徐庆敏谭忠印王琛马金杨林静李清朱传凤王乃新白春礼
- 关键词：液晶扫描隧道显微镜分子模拟
- Loop环对分子内三螺旋DNA稳定性的影响被引量：1
- 1998年
- 用分子力学方法研究了 4个分子内三螺旋DNA ( 5′ d(TC) 6 d(T) m d(CT) 6 d(C) n d(AG) 6,m ,n分别为 4,3)的稳定性 ,并与相应的分子间三螺旋d(TC) 6 d(AG) 6·d(CT) 6进行了比较 .结果表明 :Loop环对分子内三螺旋的稳定性影响较小 ,但是Loop上碱基和糖环构象的变化依赖于Loop环的长度 .Loop使分子内三螺旋DNA嘌呤链的碱基堆积作用降低 ,链长增加 .三螺旋DNA的糖环构象大部分是S型 ,同时也存在N型以及其他构象 .
- 杨林静白春礼李任植汪新文王琛
- 关键词：DNA稳定性三螺旋DNA
- 溴代胞嘧啶对三螺旋DNA稳定性的影响
- 1999年
- 研究了三螺旋ＤＮＡ中胞嘧啶被５－溴胞嘧啶取代后的稳定性问题。通过建立ＣＧＣ，ＣＧＢｒＣ，ＢｒＣＧＣ和ＢｒＣＧＢｒＣ４种模型，并采用ＩｎｓｉｇｈｔⅡ软件包中的Ｄｉｓｃｏｖｅｒ程序进行计算模拟，发现用５－溴胞嘧啶取代三螺旋ＤＮＡ分子中的胞嘧啶后，整个分子的稳定性有所降低。同时，当用５－溴胞嘧啶取代三螺旋ＤＮＡ不同链上的胞嘧啶时，被取代链的碱基堆积能显著增高，导致分子链内稳定性降低，但被取代链和相邻链间相互作用能有所降低，使得链间作用趋向稳定。
- 李清白春礼ImshikLee杨林静邓文礼王琛王乃新刘次全
- 关键词：三螺旋DNADNA稳定性胞嘧啶
- 三链核酸结构的理论研究
- 该论文主要研究了两个方面的内容.首先,研究了一些结构和环境因素如Loop环、水分子和碱基取代等三螺旋稳定性的影响;其次研究了双螺旋DNA与配体分子相互作用的方式.在三螺旋DNA中,第三条核苷酸链是以Hoogsteen或H...
- 杨林静
- 关键词：三螺旋DNAMRNA
- DNA分子结构的多态性研究 (Ⅱ) 吖啶橙凝聚体变化诱导的质粒DNA大分子构象的研究被引量：8
- 1999年
- 利用吸收光谱和荧光光谱方法，研究了吖啶橙（ＡＯ）与质粒ＤＮＡ水溶液、以及含胶束介质的吖啶橙与质粒ＤＮＡ溶液体系的相互结合作用及减色效应。结果表明：吖啶橙对质粒ＤＮＡ的吸收光谱有减色效应；含十二烷基硫酸钠（ＳＤＳ）的ＡＯ水溶液体系中，随着ＳＤＳ浓度的增加，其光谱结果表现为由凝聚态向单体的转化。而在含十二烷基硫酸钠（ＳＤＳ）的ＡＯ与质粒ＤＮＡ溶液体系中，吖啶橙凝聚态随ＳＤＳ浓度的增加，对ＡＯ与质粒ＤＮＡ相互结合产生协同的减色效应，使质粒ＤＮＡ空间结构发生缩拢。进一步采用电泳法研究了ＡＯ凝聚态可能对质粒ＤＮＡ构象的影响，结果表明：在ＡＯ与质粒ＤＮＡ溶液体系中，ＡＯ浓度的增加对质粒ＤＮＡ构象未产生影响；而在含有ＳＤＳ的ＡＯ与质粒ＤＮＡ的溶液体系中，由于ＳＤＳ对ＡＯ凝聚态的解聚作用，以及ＳＤＳ对质粒ＤＮＡ减色效应的协同作用，使得质粒ＤＮＡ的构象发生变化。
- 冯喜增林璋杨林静李清王琛白春礼
- 关键词：吖啶橙质粒DNA超螺旋
- 三链核酸的结构研究，核酸凝聚现象与生物大分子精细结构的SPM研究
- 白春礼王琛汪新文邓文礼杨林静李建伟朱传凤田芳林璋周纯青许博吴际
- 该项目围绕三链核酸的结构和性质展开了一系列的实验和理论研究，在已有的研究基础上取得了明显进步，逐步形成实验和理论研究互相配合，互相促进的良好局面。在利用化学及生物方法诱导核酸分子的有序凝聚研究之中，采用扫描探针显微方法探...
- 关键词：
- 关键词：三链核酸
- 大分子结构多态性及扫描探针显微镜研究
- 白春礼曹恩华刘次全王琛张平城邓文礼冯喜增杨林静林璋商广义裘晓辉王乃新李清朱传凤石秀凡王莹张健秦静芬
- 该项目在1996-2000执行年度期间，围绕核酸的多态结构开展了较为深入的理论和实验研究，采用生化方法并充分利用扫描探针显微技术的分析能力，取得了一系列研究结果。1998年12月项目顺利通过了中期评估，取得几项具有较高水...
- 关键词：
- 关键词：大分子结构多态性
- loop序列对双分子三螺旋DNA稳定性的影响
- 1998年
- 运用分子力学方法研究了 2 0个双分子三螺旋DNA ,其嘧啶链序列是 5′ dTTCTTTTC L1TTTL5 CTTTTCTT 3′,划线的 5个核苷酸组成loop环 ,L1和L5可以是任意的核苷酸 ;嘌呤链的序列是 5′ GAAAAGAA 3′和 5′ AAGAAAAG 3′ ;2条链方向相反 .对 2 0个不同loop序列双分子三螺旋DNA稳定性的研究结果表明 ,5′ loop三螺旋比相应的 3′ loop三螺旋更稳定 ,嘌呤比嘧啶与相邻碱基的堆积作用大 .2
- 杨林静李任植王琛刘峁子苏明白春礼
- 关键词：稳定性DNA
