聂勇
- 作品数：33 被引量：8H指数：2
- 供职机构：北京大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国石油天然气股份有限公司科学研究与技术开发项目更多>>
- 相关领域：石油与天然气工程轻工技术与工程环境科学与工程生物学更多>>
- 细菌Dietzia sp.DQ12-45-1b中两种长链烷烃羟化酶基因的鉴定被引量：2
- 2015年
- 细菌Dietzia sp.DQ12-45-1b是一株高效石油降解菌,从中已经鉴定了编码膜整合烷烃羟化酶(Alk B)和细胞色素P450类CYP153烷烃羟化酶的基因alk W1和CYP153,该菌能产生不同的表面活性剂以降解不同碳链长度的烷烃,但在不同时期对不同碳源进行降解的机制仍不清楚.通过以二十八烷(C28)为单一碳源培养alk W1缺陷的突变株M 5-5,发现alk W1缺陷降低了菌株对C28的降解能力,但仍具有降解C28的能力.通过对DQ12-45-1b菌株全基因组信息分析,并运用实时荧光定量PCR(real-time PCR)技术,鉴定了两种长链烷烃羟化酶基因,其中G1的氨基酸序列与Acinetobacter sp.DSM17874 alm A的相似性是50%,G2的氨基酸序列与Geobacillus thermodenitrifi cans NG80-2 lad A的相似性是48%.同时,发现Dietzia sp.E1存在基因G1的同源基因(G1α)和G2的同源基因(G2α和G2β),其中基因G1α与G1的相似性是71%,基因G2α、G2β与G2的相似性分别是34%、87%.Real-time PCR分析表明,在Dietzia sp.DQ12-45-1b及突变株M 5-5中,基因G1和G2的转录水平均因C28的诱导而显著上调.上述对alm A和lad A同源基因的鉴定表明,Dietzia sp.DQ12-45-1b具有独特的烷烃降解多酶体系,是目前报道的烷烃羟化酶最多的细菌之一.
- 马冬玲聂勇吴晓磊刘立明
- 关键词：长链烷烃LADA生物降解
- Dietzia菌随机插入突变体文库的构建及功能基因筛选被引量：2
- 2020年
- Dietzia属菌具有很好的烃类降解和良好的高盐、高碱耐受能力.为研究Dietzia属降解烷烃和耐受盐碱的分子机制,以Dietzia sp.DQ12-45-1b为研究菌株,利用双质粒系统p Tip-istAB-sacB和pRTSK-sacB,成功构建库容为30720的随机突变体文库.随机挑选的突变克隆及突变克隆传代20次后的Southern blot结果表明:转座序列插入的随机性较好,均为单插入突变,并且具有较好的遗传稳定性,可用于长期筛选功能基因.在此基础上,分别以高盐培养和正十六烷为单一碳源培养,利用高通量基因筛选,成功获得了一个耐盐突变体M9G和5个降解利用正十六烷相关突变株M6A、M6B、M7A、M9A、M81C.与野生型相比,5个降解利用正十六烷相关突变株的降解率下降范围为16.67%-84.35%.插入位点分析结果显示,M9G、M6A、M6B、M7A、M9A和M81C的插入基因分别预测为丝氨酸蛋白酶、铁氧化还原蛋白、假定蛋白、铁氧化还原蛋白还原酶、ABC转运蛋白和细胞色素P450类CYP153烷烃羟化酶.其中除了预测假定蛋白外,有些基因与传统上确定的功能存在差异,暗示着其可能具有新的功能.Dietzia菌随机插入突变体文库的构建及筛选可为研究Dietzia菌的抗逆和烷烃降解机制奠定基础.(图6表3参28)
- 郑鑫王蒙许子牧黄晓雨王淼啸黄婷方源聂勇吴晓磊汪家权
- 关键词：耐盐
- 2012年度国家自然科学基金微生物学学科项目资助情况分析
- 2013年
- 本文介绍了2012年度国家自然科学基金委员会生命科学部微生物学学科项目申请、受理和资助的概况,简单分析了各分支学科和各项目类别申请的特点和存在的问题,说明了学科相关的鼓励政策,希望为今后科研人员的项目申请提供有益的参考。
- 温明章郭亦然赵凯聂勇周敏方泽民
- 关键词：国家自然科学基金微生物学学科
- Dietzia菌中铁氧还蛋白及其还原酶在正十六烷降解中的关键作用被引量：1
- 2023年
- 微生物降解烷烃作为一种经济高效的方式,在环境修复和石油开采等方面起到了重要作用.在烃降解过程中主要通过红素氧还蛋白(Rd)和红素氧还蛋白还原酶(RdR)的电子传递链为中长链烷烃羟化酶AlkB提供能量;然而许多依赖于AlkB的烷烃降解菌,如Dietzia菌,其基因组中未发现已知的RdR的蛋白编码基因,因而其如何发挥AlkB的功能依然未知.以Dietzia sp.DQ12-45-1b作为模式菌株,前期研究发现铁氧还蛋白(Fd)与铁氧还蛋白还原酶(FdR)编码基因的缺失会导致菌株对正十六烷代谢的缺陷.通过构建Fd、FdR及其所在的细胞色素P450类烷烃羟化酶CYP153基因簇的敲除与回补突变株,对比野生型菌株生长表型,发现在Fd或FdR的编码基因缺失的情况下会导致菌株丧失对正十六烷的代谢能力,确定了该基因簇中Fd及FdR基因是Dietzia sp.DQ12-45-1b正十六烷降解的必需基因.此外还发现烷烃羟化酶CYP153基因的缺失并不影响菌株对正十六烷的降解利用.上述结果暗示FdR在降解过程中可能存在与其他烷烃羟化酶如AlkW等的电子传递关系,有助于进一步探索Dietzia菌的烃代谢降解过程机制.(图6表2参20)
- 范裕昭秦晓宇聂勇吴晓磊许子牧
- 关键词：电子传递
- F52-2蛋白及其编码基因及水解木聚糖的应用
- 本发明公开了F52-2蛋白及其编码基因及水解木聚糖的应用。本发明提供了一种蛋白，是如下1)或2)的蛋白质：1)由序列表中序列2所示的氨基酸残基组成的蛋白质；2)将序列表中序列2的氨基酸序列残基序列经过一个或几个氨基酸残基...
- 吴晓磊王蒙来国莉聂勇耿爽
- F175-3蛋白及其编码基因及水解纤维素的应用
- 本发明公开了F175-3蛋白及其编码基因及水解纤维素的应用。本发明提供了一种蛋白，是如下1)或2)的蛋白质：1)由序列表中序列2所示的氨基酸残基组成的蛋白质；2)将序列表中序列2的氨基酸序列残基序列经过一个或几个氨基酸残...
- 吴晓磊王蒙来国莉聂勇耿爽
- 一种指导微生物配伍的“相似相容”原则及其提高外源投加微生物功能与效率的配伍方法
- 本发明公开了一种指导微生物的配伍的“相似相容”原则及其微生物的配伍的“相似相容”原则以及提高外源投加微生物功能与效率的配伍方法。本发明提出的“相似相容”配伍方法如下：首先是对目标环境中的群落结构进行解析，筛选出其中的主要...
- 吴晓磊汤岳琴聂勇王健伟
- 文献传递
- 微生物石油环境适应性初步分析
- 利用室温培养等提高微生物可培养性的措施，从石油环境中分类培养了细菌菌种约18000株，初步分析了可培养微生物的多样性与生物地理学分布。在此基础上，对4类细菌30个菌株的全基因组进行了测序。生物信息学研究表明，这些微生物基...
- 汤岳琴聂勇方卉梁洁良赵桂芳谭燕吴晓磊
- 关键词：石油基因组代谢调控
- 典型油田微生物资源开发与微生物群落调控的基础研究
- 吴晓磊汤岳琴聂勇伍晓林孙纪全房宝财
- 石油是不可再生的能源，直接关系到国家的自主发展战略.在中国，大多数陆上主力油田已进入中后期开发阶段，而代表最高技术水平的化学驱油技术对中国大多数陆相沉积特征油藏并不适用，开发与之相适应的石油采收技术迫在眉睫.微生物采油技...
- 关键词：
- 关键词：油田开发微生物采油基因组学
- 通过改变微生物运动性强化微生物采油的方法
- 本发明公开了利用改变微生物运动性强化微生物采油的方法。本发明提供了一种鉴定待测种属微生物是否为改变目的种属微生物运动性质种属的方法的方法，包括如下步骤：1)将目的种属微生物与待测种属微生物共培养，2)检测培养过程中所述目...
- 吴晓磊聂勇王淼啸耿爽王健伟
- 文献传递
