郑和斌
- 作品数：5 被引量：101H指数：5
- 供职机构：华中农业大学植物科学技术学院应用真菌研究所更多>>
- 发文基金：湖北省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 美味侧耳ITS序列直接测序与克隆测序比较分析被引量：15
- 2005年
- 用CTAB法提取美味侧耳基因组DNA,利用引物ITS1和ITS4扩增其核糖体DNA的ITS片段,凝胶回收试剂盒纯化目的片段。通过PCR产物双向直接测序和克隆测序分别获得其rDNAITS序列,对两种测序方法所得序列及GenBank中美味侧耳ITS片段的序列进行比较分析。结果显示,三条序列的差异非常小,两种测序方法所得序列仅在两端出现差异,序列内部完全一致。
- 郑和斌王作仁吕作舟余知和
- 关键词：直接测序ITS序列克隆测序侧耳CTAB法
- ISSR标记在侧耳属菌株分类学中的初步应用被引量：42
- 2006年
- 基于重复序列（TATG），设计了7条引物P0-P6，对侧耳属的22个菌株和1株双孢蘑菇菌株的基因组DNA进行重复序列间区序列（ISSR）PCR扩增。引物P0、P1在23个菌株上扩增共得到120条带。聚类分析结果显示，在0．71水平将以上侧耳菌株分为5组：阿魏蘑、白阿魏蘑、杂交阿魏蘑位于第2组；凤尾831、16号秀珍菇位于第3组；鲍鱼菇位于第4组；其他供武菌株位于第1组。利用引物P1对17号日本秀珍菇扩增得到了1条约1．3kh片段，经克隆和测序分析，验证了重复序列（TATG）4的存在，并达到了微卫星基序的最低重复次数。
- 马志刚吕作舟郑和斌王卓仁
- 关键词：ISSR侧耳
- 阿魏蘑、白灵菇及杏鲍菇亲缘关系的研究被引量：15
- 2005年
- 利用PCR产物克隆测序测定了阿魏蘑、白灵菇与杏鲍菇rDNA内转录间隔区(ITS)的序列,并对所测序列进行分析。结果表明,阿魏蘑、白灵菇和杏鲍菇三者之间具有较近的亲缘关系,白灵菇与杏鲍菇具有非常近的亲缘关系,但阿魏蘑、白灵菇和杏鲍菇为3个不同的种。
- 郑和斌李晓宇吕作舟肖毅云
- 关键词：亲缘关系
- 核rDNA ITS序列在侧耳属分子分类学上的应用
- 侧耳属是一类广为分布的且具有食/(药/)用价值的木腐生真菌,种类较多,分类较为混乱。本文利用PCR产物克隆测序测定了侧耳属7个种和中国各地区栽培的11个侧耳品种以及外群黑木耳的核rDNA ITS/(内转录间隔区/)序列,...
- 郑和斌
- 关键词：侧耳属PCRITS亲缘关系
- 文献传递
- 基于ITS序列分析对我国主要栽培的侧耳品种的鉴定及评价被引量：36
- 2006年
- 利用PCR产物克隆测序测定了20个我国主要栽培的侧耳品种的ITS序列,另外从GenBank获得侧耳属15个种25条ITS序列及亚侧耳属2个种的ITS序列。以Hohenbueheliagrisea和H.tremula为外群,运用PAUP软件中的简约分析法(parsimonyanalysis)构建的系统发育树表明:侧耳属Pleurotus是单起源的,20个主要栽培的侧耳品种分别聚在三个组,即Ostreatus-eryngii-populinus复合组、Pulmonarius组、Citrinopileatus-cornucopiae组。Ostreatus-eryngii-populinus组含刺芹侧耳Pleurotuseryngii、白灵侧耳P.nebrodensis、香侧耳Pleurotussp.、阿魏侧耳P.eryngiivar.ferulae、平963-1Pleurotussp.及糙皮侧耳P.ostreatus、日本秀珍Pleurotussp.、平802Pleurotussp.、姬菇Pleurotussp.、灰白侧耳P.spodoleucus、缘刺侧耳Pleurotussp.、凤尾菇P.sajor-caju;Pulmonarius组含肺形侧耳P.pulmonarius、小白平菇Pleurotussp.、平8804Pleurotussp.、平侧5Pleurotussp.、美味侧耳P.sapidus;Citrinopileatus-cornucopiae组含黄白侧耳P.cornucopiae、金顶侧耳P.citrinopileatus、鸡汁菌Pleurotussp.。系统树还显示黄白侧耳与金顶侧耳、白灵侧耳与刺芹侧耳亲缘关系密切,而凤尾菇与肺形侧耳分属于不同的组,属于两个不同的种。基于ITS序列分析,本文还针对目前我国栽培的主要侧耳品种在名称使用上的混淆和混乱进行了初步的评价和讨论。
- 郑和斌马志刚吕作舟余知和
- 关键词：核糖体RNA亲缘关系系统发育树
