顾颖
- 作品数：12 被引量：115H指数：7
- 供职机构：中国水产科学研究院黑龙江水产研究所更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 镜鲤与建鲤生长性状共享QTL标记及优势基因型被引量：6
- 2015年
- 本研究以1个镜鲤(Cyprinus carpio L.)全同胞家系(190个个体)构建的微卫星遗传图谱(992个标记)为基础,从体重、体长、体高和体厚的QTL区间内发掘了54个标记,其与性状具有显著相关性,进而通过对不同基因型性状间的比较,筛选出83个优势基因型。在此基础上,用54个镜鲤QTL标记分析了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)作图群体,其中40个标记在建鲤中表现出多态性,比例为74.07%;相关性分析结果显示,其中22个标记与建鲤家系的体重、体长、体高或体厚性状具有显著相关性(P<0.05),占多态标记的55.00%;镜鲤与建鲤共享的22个QTL标记中,18个标记与至少1个相同的性状具有显著相关性(P<0.05),从中筛选出建鲤性状具有优势的基因型30个,可用于指导建鲤的选育。品种间共享QTL的发掘能够扩展QTL标记的使用空间,减少新品种重新构建图谱进行QTL标记定位的工作量和成本。
- 鲁翠云顾颖李超郑先虎程磊曹顶臣俞菊华何立川孙效文
- 关键词：镜鲤建鲤
- 建鲤(Cyprinus carpio var. Jian)微卫星DNA亲权鉴定被引量：19
- 2012年
- 利用16个微卫星座位对建鲤10个全同胞家系647个子代进行亲权鉴定。Cervus3.0分析表明,16个微卫星位点的平均多态信息含量为0.7025,平均等位基因数为6.63,期望杂合度平均为0.7405。当双亲未知时,累积排除概率为0.999225,已知单亲时的累积排除概率为0.999996,置信度为95%。进一步模拟分析表明,要达到亲权鉴定的要求在双亲未知时通常需要8～12个微卫星位点,已知单亲时需要5～8个微卫星位点。在双亲均未知的情况下进行亲权鉴定,94.6%的后裔找到了其父母本,真实鉴定率低于模拟分析预测值,分析可能是与候选亲本间存在亲缘关系、无效等位基因的存在以及分型错误等因素有关。9个建鲤全同胞家系的鉴定,为今后的遗传图谱构建、QTL定位及分子标记辅助育种研究奠定了基础。
- 顾颖李超鲁翠云郑先虎俞菊华孙效文
- 关键词：建鲤亲权鉴定微卫星
- 鲤与生长性状相关的EST-SSRs标记筛选被引量：24
- 2009年
- 以大头鲤(Cyprinus pellegrini Tchang)(母本)与荷包红鲤(Cyprinus carpio wuyuanensis)抗寒品系(父本)杂交产生的F1作为亲本,以其自交F2作为分离群体,结合"拟测交"策略,用EST-SSRs标记对其中92个个体进行基因型检测。利用Windows Map Manager2.0的标记回归法对符合拟测交分离的70个EST-SSRs标记进行单标记回归分析,检测出8个与鲤体长、体高、体厚性状相关的标记。对同一标记不同基因型个体间生长性状进行显著性比较,通过t检验,找到与生长性状相关的基因型。将上述8个EST序列与GenBank数据库进行BLAST比对,有3条EST序列与蛋白库中已知功能的序列高度同源。其中HLJE225与编码斑马鱼(Denio rerio)冷诱导基因RNA结合蛋白的基因同源性水平高达97%,HLJE222与编码斑马鱼DAZ相关蛋白1基因同源性水平也高达97%,HLJE599与编码斑点叉尾(Ictalurus punctatus)核糖体蛋白L6基因的同源水平为87%。本研究鉴定的与鲤生长性状相关的功能基因及有利用价值的基因型,为鲤重要生长性状的QTL(数量性状基因座)定位和分子标记辅助育种提供了一定的依据。
- 顾颖曹顶臣张研常玉梅李鸥张晓峰鲁翠云孙效文
- 关键词：EST-SSRS生长性状BLAST
- 建鲤生长性状QTL区间及其与镜鲤同源性比对被引量：4
- 2013年
- 以建鲤（Cyprinus carpio var．jian）F．群体的94尾个体为材料，利用254个微卫星标记构建了建鲤的遗传图谱，并对体长、体高和体厚性状进行了QTL定位，共检测到17个生长相关性状QTL，分布在10个连锁群上，解释表型变异为10．8％～35．2％。以相同的分子标记，构建建鲤与镜鲤（Cyprinus carpio L．）的比较图谱，分析了建鲤和镜鲤群体生长性状QTL的同源性关系。结果表明，建鲤与镜鲤图谱具有广泛的共线性或同线性关系，建鲤每个连锁群在镜鲤图谱中均找到了对应的同源连锁群，其中建鲤10个生长性状QTL与镜鲤13个相同性状QTL具有同源性，同源比例高达58．8％。同时发现，建鲤QTL置信区间相对较大，与之同源的镜鲤QTL置信区间较小，通常位于建鲤QTL子区间内，定位结果更精细。此外，建鲤与镜鲤连锁群上都存在QTL的富集区域，而这些富集区域常常存在于同源连锁群的共线性区域，可作为标记辅助选择的重点区域。鲤通用QTL的发掘，为分子标记辅助育种和更进一步的精细定位打下基础。
- 顾颖鲁翠云张晓峰李超俞菊华孙效文
- 关键词：建鲤镜鲤生长性状共线性QTL
- 8种鲤养殖品种线粒体Cyt b基因的遗传多样性和系统进化分析被引量：7
- 2013年
- 对8种鲤养殖品种的线粒体Cyt b基因部分序列进行测定,并比较分析其遗传多样性和系统进化关系,结果获得425 bp的Cyt b序列,其中T、C、A、G的平均含量分别为26.8%、29.0%、29.7%、14.5%,A+T含量(56.5%)高于G+C含量(43.5%),翻译为141个氨基酸,其中突变多数存在于缬氨酸和异亮氨酸之间(两个氨基酸都为不带电荷的疏水性氨基酸),其变异不影响Cyt b的功能,说明该蛋白是一个进化缓慢的蛋白,适合用于遗传进化分析。140个个体中共检测到4个单倍型,其中75.5%的个体属于单倍型Hap 2,而单倍型Hap 1主要分布在3种表现型为镜鲤的品种。AMOVA分析结果和利用Kimura 2-parameter模型分析的系统发育关系结果表明,德国镜鲤、散磷镜鲤和松浦红镜鲤亲缘关系较近,而蓝鳞鲤、荷包红鲤抗寒品系和高寒鲤亲缘关系较近。
- 肖同乾鲁翠云李超张明昭顾颖孙效文
- 关键词：细胞色素B
- 福瑞鲤与豫选黄河鲤选育群体的遗传结构及亲本间遗传距离分布被引量：10
- 2016年
- 用微卫星标记分析了鲤鱼（Cyprinus carpio L．）的2个品种福瑞鲤和豫选黄河鲤选育群体的遗传结构，并揭示了雌雄个体间遗传距离的分布规律。结果表明，23个微卫星标记在福瑞鲤（FR，n=192）和豫选黄河鲤（YX，n=96）中各检测到160个和131个等位基因。福瑞鲤的平均有效等位基因数（Ne）、观测杂合度（Ho）、期望杂合度（矾）和多态信息含量（PIC）分别为4．559、0．695、0．741和0．702，群体处于高度多态水平（PIC≥0．5）；豫选黄河鲤的4项遗传多样性参数分别为3．620、0．665、0．642和0．600。虽然豫选黄河鲤同样处于高度多态水平（PIC≥0．5），但是Ne、风和PIC均极显著低于福瑞鲤（P〈0．01），说明福瑞鲤的杂交选育背景决定了其较系统选育的豫选黄河鲤具有较多的来源于不同亲本的等位基因；而两者风差异不显著（P〉0．05），说明豫选黄河鲤种内也保持了较高的遗传杂合度。分别统计福瑞鲤与豫选黄河鲤雌雄个体间的遗传距离，结果表明两两雌雄个体间遗传距离呈正态分布。福瑞鲤个体间遗传距离的中间值位于0．8～1．0，占37．39％；而豫选黄河鲤个体间遗传距离中间值位于0．5-0．7，占49．33％0建议福瑞鲤和豫选黄河鲤在家系配组时，选择亲本间遗传距离阈值范围在0．8-1．0和0．5-0．7为宜。
- 鲁翠云张晓丽顾颖李超董在杰冯建新程磊孙效文
- 关键词：微卫星
- 基于线粒体COI基因序列的5种鲤养殖品种遗传多样性研究被引量：15
- 2013年
- 本研究通过对5个鲤养殖品种即高寒鲤（Cyprinus carpio Frigid carp）、松浦鲤（Cyprinus carpio Songpu carp）、蓝鳞鲤（Cyprinus carpio blue var）、松浦镜鲤（Cyprinus carpio Songpu mirror carp）和红镜鲤（Cyprinus carpio Red mirror carp）的线粒体COI基因部分序列的测定, 比较并分析了其遗传多样性和系统进化关系。在5个鲤品种共100个样本的线粒体COI序列中检测到8种单倍型, 其中5个单倍型（H1、H2、H4、H5、H6）涵盖样本较多, 占总样本数的94.06%。蓝鳞鲤的单倍型数最少, 仅有1个, 红镜鲤单倍型数为2个, 其余3个品种的单倍型数均为5个。5个品种单倍型多样性（Hd）在0.160±0.070-0.811±0.055, 其中, 遗传多样性最高的为高寒鲤。AMOVA结果表明, 品种间变异（50.28%）略高于品种内变异（49.72%）, 各品种间的FST值在0.711 4-0.831 2, 其中蓝鳞鲤与其他群体之间差异最大。用MEGA4.0软件构建的基于遗传距离的进化树表明, 5个养殖品种中, 高寒鲤和红镜鲤的遗传距离最近（D=0.31）, 聚为一支; 松浦镜鲤和松浦鲤的遗传距离较近（D=0.33）, 聚为一支; 蓝鳞鲤与其他品种存在较大遗传差异, 单独形成一个分支。除蓝鳞鲤外, 其余4个养殖品种间均存在共享的单倍型（H2、H4、H5、H6）, 可能是由于其在选育过程中亲本的遗传背景存在交叉, 同时也证明DNA条码在分析种内品种间遗传关系时具有可行性但具有一定的局限性。
- 单云晶鲁翠云李超张明昭顾颖孙效文
- 关键词：DNA条形码COI基因
- 大菱鲆微卫星标记的分离及其多态性位点检测被引量：9
- 2009年
- 以生物素标记的（CA）12为探针进行杂交，借助磁珠筛选出含微卫星的Mbo I酶切片段，构建了大菱鲆Scophthalmus maximus微卫星富集文库，用同位素γ-^23P标记的探针（CA）12进行二次筛选，获得1600个阳性克隆，占59．3％。测序347个序列，得到335个（96．54％）含有微卫星序列的克隆，其中含有微卫星座位378个。完美型的微卫星序列有236个（62．4％），非完美型的有121个（32．0％），复合型的有21个（5．6％），从所得序列中分离和鉴定了32对微卫星标记。利用31尾大菱鲆养殖个体评价微卫星位点，分析表明，10个位点具有多态性。不同位点等位基因数目为3～11不等，期望杂合度（He）和多态信息含量（PIC）变动范围分别为0．5061—0．8995和0．4133～0．8742。本研究中开发的微卫星多态性较高，将为大菱鲆养殖品系的优化、遗传多样性的检测及遗传图谱的构建等打下基础。
- 顾颖郭忠宝谷晶晶毛瑞鑫鲁翠云孙效文
- 关键词：大菱鲆微卫星多态性磁珠
- 利用EST-SSR分子标记研究鲤的饲料转化率性状被引量：21
- 2009年
- 饲料转化率是重要的经济性状,通过QTL定位获得的紧密连锁标记以及相关基因,是遗传育种的重要工具。本文利用70个鲤的EST-SSR,对鲤全同胞家系92个体的基因组DNA进行扫描,得到符合1∶1孟德尔分离类型的位点48个,3∶1孟德尔分离类型的位点22个。采用拟回交策略对符合1∶1分离的标记与鲤饲料转化率性状进行单标记回归分析。结果表明:HLJE335、HLJE253、HLE547、HLJE92、HLJE203、HLJE231等6个标记与饲料转化率性状相关(P<0.05)。其中,HLJE547和HLJE203两个标记与饲料转化率相关性达极显著水平(P<0.001),分别解释了表型变异的11.00%、11.00%。应用NCB I数据库,分别对与性状极显著相关的2个EST-SSR标记进行同源性比对,发现标记HLJE547与斑马鱼基因组中编码ATPase,H+transporting,lysosomal的核酸序列同源(同源性为74%),与斑马鱼编码的ATPase,H+transporting,lysosomal的蛋白序列同源(同源性为92%)。推测ATPase可能通过影响鲤消化与吸收等生物学机制,从而影响鲤的饲料转化效率。
- 李鸥曹顶臣张研顾颖张晓峰鲁翠云孙效文
- 关键词：饲料转化率
- 鲤和斑马鱼HOX基因家族同义密码子使用偏性的分析被引量：6
- 2013年
- 运用Codon W程序计算和统计分析了鲤和斑马鱼HOX基因家族密码子组成、同义密码子使用频率。结果表明,鲤和斑马鱼HOX基因家族的最优密码子分别为6和9种。鲤和斑马鱼以A或U结尾的密码子发生强烈偏向;最优密码子的使用频率(Fop)与密码子适应指数(CAI)、密码子偏爱指数(CBI)、基因的G+C含量(GC),尤其是第三位密码子的G+C百分含量(GC3S)之间呈极显著的正相关(鲤和斑马鱼的相关系数分别为r=0.5946和0.7884、0.9772和0.9616、0.3356和0.5380、0.5424和0.8144),而与有效等位基因数ENc存在显著负相关(相关系数r=-0.1241和0.3987)。实验表明:同义密码子第三位密码子碱基含量和组成直接影响着最优密码子使用偏性,基因的表达水平越高,对密码子的使用偏性越强。
- 周丹薛仁余张晓峰杜科马吉敏顾颖孙效文
- 关键词：鲤鱼斑马鱼GC含量
