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刘宝山

作品数：3 被引量：5H指数：2
供职机构：山东师范大学更多>>
发文基金：山东省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
相关领域：理学更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 3篇理学

主题

  • 2篇动力学
  • 2篇分子
  • 2篇分子动力学
  • 1篇电势
  • 1篇抑制剂
  • 1篇制剂
  • 1篇配体
  • 1篇配体结合
  • 1篇氢键
  • 1篇量子
  • 1篇量子力学
  • 1篇静电
  • 1篇静电势
  • 1篇分子静电势
  • 1篇ABT
  • 1篇MM-PBS...
  • 1篇MM

机构

  • 3篇山东师范大学

作者

  • 3篇刘宝山
  • 2篇张少龙
  • 2篇张庆刚
  • 1篇刘新国
  • 1篇扈国栋
  • 1篇孙善书

传媒

  • 2篇山东师范大学...

年份

  • 1篇2009
  • 2篇2008
共 3 条 记 录，以下是 1-3
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排序方式：
PDB结构中结晶水分子在蛋白质与配体结合中作用的量子计算研究
生物大分子的动力学研究越来越受到人们的重视。飞速发展的计算机技术使计算分子模拟在化学、生物化学以及分子生物学领域成为十分重要和活跃的前沿课题。分子动力学/(Molecular Dynamics, MD/)模拟通过力场能够...
刘宝山
关键词：分子动力学分子静电势氢键
文献传递
W301水分子在HIV-1蛋白酶和配体ABT-538结合中作用的QM/MM研究被引量：4
2008年
结晶水分子W301在几乎所有的HIV-1蛋白酶(HIV-1PR)和配体的晶体结构中出现.在HIV-1PR中A链天门冬氨酸残基Asp25质子化状态或B链Asp25质子化状态下,QM/MM模拟后MM-GBSA方法计算得到W301水分子在HIV-1PR/ABT-538结合中的自由能贡献分别为-16.88kJ/mol、-17.63kJ/mol,W301水分子在HIV-1PR/ABT-538的结合中起到了关键的作用.进一步分析发现W301水分子与HIV-1PR和ABT-538分别形成了两个、四个氢键.
刘宝山张少龙张庆刚
FKBP12与其抑制剂作用的结合自由能计算被引量：2
2008年
FKBP12(FK506-binding proteins-12)是一种具有神经保护和促神经再生作用的蛋白.文中采用分子动力学模拟取样,运用MM-PBSA方法计算了FKBP12-TST复合物的绝对结合自由能.通过能量分解的方法考察了FKBP12分子主要残基与配体TST之间的相互作用.
扈国栋张少龙张庆刚刘新国刘宝山孙善书
关键词：分子动力学MM-PBSA抑制剂
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