周红
- 作品数：20 被引量：107H指数：7
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 铁皮石斛的完整叶绿体基因组序列
- [背景与目的]铁皮石斛具有很高的药用和经济价值,因价格昂贵,市场上常有以次充好、以假乱真的现象.本研究为石斛属植物的DNA条形码筛选、物种进化和叶绿体基因组工程研究提供依据.[材料与方法]选取铁皮石斛的幼嫩叶片,运用改良...
- 杨培周红钱俊徐海滨邵清松李永华姚辉
- 基于ITS2序列鉴定谷物芽类药材及其混伪品被引量：5
- 2014年
- 目的:应用ITS2序列对2010版《中国药典》谷物芽类药材稻芽、谷芽、麦芽及其混伪品进行分子鉴定,以保证药材质量和临床疗效。方法:提取稻芽、谷芽和麦芽药材DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其ITS2序列并双向测序,应用Codon Code Aligner软件对测序峰图进行校对拼接,并去除低质量序列及引物区,得到ITS2序列。用MEGA6.0软件对所有10个物种74条序列计算种内和种间K2P(Kimura 2-Parameter)遗传距离,分析变异位点并构建邻接(NJ)树。结果:稻芽、谷芽和麦芽的基原植物稻、粟和大麦的种内最大K2P遗传距离均远小于其与混伪品之间的种间最小K2P遗传遗传距离;NJ树结果显示稻、粟和大麦各自聚为一支,均与混伪品明显区分开,各混伪品物种也单独聚为一支。结论:ITS2序列能准确鉴别稻芽、谷芽、麦芽药材及其混伪品,该研究为保障谷物芽类药材临床准确用药提供了新的技术手段。
- 熊超周红贺海波胡志刚刘合刚
- 关键词：混伪品
- ITS2序列鉴定“功劳叶”药材及其近缘混伪品被引量：6
- 2014年
- 目的:中药材同名异物现象对临床安全用药造成了潜在的威胁。本研究对两种"功劳叶"药材及其近缘混伪品进行分子鉴定,以确保临床准确用药。方法:本实验收集枸骨、阔叶十大功劳和细叶十大功劳及其近缘混伪品共9个物种45份实验样品,用改良的CTAB法提取总DNA,扩增ITS2序列并双向测序,采用Condon Code Aligner V 4.2.4对测序峰图进行拼接,应用MEGA 6.0进行序列变异分析,计算种内种间Kimura 2-Parameter(K2P)遗传距离,构建系统邻接(NJ)树。结果:基于ITS2序列的序列变异、最近距离法和系统邻接树分析结果均表明,冬青属枸骨以及十大功劳属阔叶十大功劳和细叶十大功劳均能与其混伪品很好地区分开。结论:ITS2序列可有效区分两种"功劳叶"药材及其近缘混伪品,为临床准确用药提供依据。
- 夏叶周红向丽张秀桥胡志刚
- 关键词：枸骨叶功劳叶分子鉴定
- 鸦胆子药材及其混伪品的ITS2序列分子鉴定研究被引量：1
- 2015年
- 目的:通过分析鸦胆子及其混伪品的ITS2序列,探究鉴定鸦胆子药材及其混伪品的新方法。方法:采用改良的CTAB法提取鸦胆子及其混伪品的基因组DNA,PCR扩增ITS2片段。对其进行双向测序,应用MEGA6.0软件进行序列分析,计算种内、种间遗传距离,构建邻接树。结果:鸦胆子药材ITS2序列长度为230 bp,种内最大K2P遗传距离为0.018,小于其与混伪品的种间平均K2P遗传距离0.493。NJ树结果表明鸦胆子序列和柔毛鸦胆子序列聚为一支,与其他混伪品可明显区分。鸦胆子与柔毛鸦胆子在35位点处有一变异位点,利用此位点能将鸦胆子与柔毛鸦胆子区别开来。结论:ITS2可作为鸦胆子药材及其混伪品鉴定的DNA条形码序列,为保障临床用药安全提供了新的技术手段。
- 马双姣杨培周红孙伟姚辉李永华
- 关键词：鸦胆子ITS2DNA条形码混伪品
- 滇鸡血藤药材分子身份证
- 本发明公开了滇鸡血藤药材DNA条形码标准序列和滇鸡血藤药材快速分子鉴定的方法，其特征在于所述DNA条形码标准检测基因为叶绿体trnH-psbA基因，具有基因序列SEQ ID NO.1。该方法可以为滇鸡血藤药材提供分子身份...
- 姚辉周红陈士林宋经元辛天怡
- 文献传递
- 基于ITS2条形码序列鉴定中药材佩兰及其混伪品被引量：8
- 2013年
- 目的:对中药材佩兰及其混伪品进行ITS2条形码鉴定,以确保该药材的质量以及临床疗效。方法:提取佩兰的DNA,利用PCR技术扩增其ITS2序列,双向测序,所得序列经过CodonCodeAligner拼接后,用软件MEGA5进行相关数据分析,计算其种内、种间遗传距离,并构建系统发育树。结果:佩兰药材的ITS2序列长度为218 bp;佩兰种内最大K2P距离为0.009,与混伪品种间最小K2P距离为0.024。ITS2序列的NJ系统聚类树可明显区分佩兰药材及其混伪品,表现出良好的单系性。结论:ITS2条形码序列能够成功鉴定中药材佩兰与其混伪品,为保障临床安全用药提供了新的技术方法。
- 邬兰陈科力孙伟胡志刚凃媛马孝熙林韵涵周红
- 关键词：混伪品
- 鸡血藤、滇鸡血藤、大血藤等血藤类药材的psbA-trnH条形码分子鉴定被引量：6
- 2016年
- 目的:中国药典收载的鸡血藤、大血藤、滇鸡血藤及相关物种均有"血藤"之称,其各自的来源不同,功效主治不同,不能混用。为确保其临床用药的安全、有效,本研究应用DNA条形码序列psbA-trnH对鸡血藤、大血藤、滇鸡血藤及其混伪品进行鉴定研究。方法:通过对样本进行基因组DNA提取,PCR扩增psbA-trnH序列。所得序列经拼接后,用MEGA5.0和DNAMAN进行种内种间序列分析,构建NJ树,对psbA-trnH序列在血藤类药材中的鉴定能力进行评估。结果:鸡血藤、大血藤和滇鸡血藤序列长度和GC含量各不相同,psbA-rrnH种内序列相似度高,均高于它们与混伪品间的序列相似性。鸡血藤、大血藤、滇鸡血藤与其他非药典收载的血藤类药材的种间最小K2P距离分别为0.137、0.426和0.003,均大于其种内最大遗传距离0.014、0.004和0。在NJ树中,鸡血藤、大血藤均单独聚为一支,能明显的与其他混伪品区分开,滇鸡血藤与异形南五味子聚为一支。结论:psbA-trnH序列能准确鉴定鸡血藤、滇鸡血藤、大血藤药材及其混伪品,该条形码分子鉴定方法可作为传统鉴定方法的有效补充。
- 周红马双姣陈贝贝韩正洲姚辉
- 关键词：PSBA-TRNH鸡血藤大血藤DNA条形码
- 基于ITS2序列鉴别前胡和紫花前胡药材及其混伪品被引量：8
- 2014年
- 为应用ITS2序列对前胡、紫花前胡药材及其混伪品进行DNA条形码鉴定研究,该文依据国家药典委员会公布的《中药材DNA条形码分子鉴定指导原则》,PCR扩增前胡、紫花前胡及其混伪品的ITS2序列并进行双向测序。经CodonCode Aligner V 3.7.1对测序峰图进行校对拼接,采用MEGA5.0软件分析相关数据。结果表明：前胡药材的ITS2序列长度为229~230 bp,种内变异较小,平均K2P遗传距离为0.005。紫花前胡药材的ITS2序列长度为227 bp,种内无变异。前胡、紫花前胡药材与其混伪品的种间平均K2P遗传距离分别为0.044,0.065。紫花前胡的种间最小K2P遗传距离明显大于其种内的最大K2P遗传距离。最小距离法和NJ树鉴定结果表明前胡、紫花前胡均能与其混伪品明显区分。因此,ITS2序列可有效鉴别前胡、紫花前胡药材及其混伪品。
- 侯典云宋经元杨培周红辛天怡姚辉
- 关键词：前胡紫花前胡混伪品ITS2
- 黄精属药用植物DNA条形码鉴定研究被引量：21
- 2015年
- 目的:评价DNA条形码候选序列对黄精属药用植物的鉴定能力。方法:对44份黄精属样品应用通用引物扩增其叶绿体rbc L、mat K、psb A-trn H及核ITS2和ITS序列,分析其种内种间变异和barcoding gap,应用BLAST和Nearest Distance方法计算物种鉴定效率。结果:ITS2和ITS序列通用引物扩增效率低,叶绿体mat K序列获得率最低,rbc L最高,三条序列种内与种间变异均较小,无明显的barcoding gap。基于BLAST和Nearest Distance方法计算,三条叶绿体序列对黄精属药用植物的鉴定效率均较低。结论:DNA条形码候选序列psb A-trn H、mat K及rbc L不适用于黄精属药用植物的鉴定,叶绿体全序列或通过叶绿体全序列筛选合适的DNA片段可能是该属药用植物分子鉴定的方向。
- 杨培周红辛天怡马双姣段宝忠姚辉
- 关键词：黄精属分子鉴定DNA条形码
- 基于DNA序列的石斛属药用植物鉴定研究进展被引量：4
- 2015年
- 本文从核基因组、线粒体基因组和叶绿体基因组三方面,综述了目前常用DNA序列在石斛属药用植物的分子鉴定和物种分类研究中的进展。文献显示,目前用于石斛属物种分子鉴定研究的DNA序列主要有核ITS/ITS2、LEAFY,叶绿体rbc L、mat K、trn H-psb A、rpo B、rpo C1、trn L-F、rbl16、trnl intron和线粒体基因组nad1 intron2,这些DNA序列均对石斛属药用植物鉴定具有借鉴意义。笔者对叶绿体全基因组序列作为"超级条形码"在石斛属植物中应用的可行性进行了展望,以期为石斛属药用植物的鉴定研究提供参考。
- 周红马双姣杨培姚辉
- 关键词：石斛属DNA序列分子鉴定核基因组叶绿体基因组线粒体基因组
