宋沁馨
- 作品数：56 被引量：273H指数：8
- 供职机构：中国药科大学药学院药物质量与安全预警教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省基础研究计划教育部重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学理学自动化与计算机技术更多>>
- ALM-ASA法鉴别人参和西洋参ITS及5．8s基因上单核苷酸多态性位点被引量：6
- 2008年
- 目的:查找并发现参类药材的单核苷酸多态性(SNP)位点,利用SNP的准确测定来鉴别人参和西洋参。方法:根据ITS及5.8s基因上人参和西洋参的SNP位点设计特异性引物,利用适配器连接介导的等位基因特异性扩增法(ALM-ASA)进行检测。结果:PCR反应体系优化后,能在同一反应中同时鉴别人参、西洋参。根据凝胶电泳中扩增片段的大小判断SNP的类型,出现294bp条带的为人参,111bp条带的为西洋参。结论:ALM-ASA法极大提高了PCR反应的特异性,结果准确,可同时测定多个SNP位点。采用该方法测定ITS及5.8s基因上的SNP位点能有效地对参类品种进行鉴别和质量控制。
- 宋沁馨张心悦卜莹周国华冯芳
- 关键词：人参西洋参
- 多重环介导等温扩增技术研究进展被引量：29
- 2015年
- 环介导等温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)因其扩增速度快、灵敏度和特异性高、仪器要求低等优点而被广泛应用于核酸诊断领域。为充分利用LAMP技术优势、提高诊断检测的效率与可靠性、扩展其应用范围,同时节约试剂成本,近年来多重LAMP技术的研究成为一大热点。常规的LAMP扩增产物检测方法多数以聚合反应的双链DNA产物或其副产物为基础,只能判断有无扩增反应发生,而难以识别多重扩增产物的靶标来源及其特异性。为实现多重扩增产物的高特异检测,各国学者通过对该技术巧妙的改进或与其他技术相偶联,发展了一系列多重LAMP扩增检测技术。然而上述狭义的多重LAMP技术依然存在因引物间相互干扰、扩增效率存在差异而引发歧视性扩增的局限,限制了多重扩增的重数。近年研究活跃的微型扩增技术以其实现多个平行、互不干扰的小体积单重扩增的技术优势打破了这一局限,由此产生了新型的广义多重LAMP扩增技术。这些技术还具有试剂消耗少、自动化程度较高、交叉污染风险更小以及更适合对较多靶标进行现场快速检测等优势。本文分别从狭义多重LAMP的方法原理及其扩增反应体系优化、广义多重LAMP的方法原理以及多重LAMP技术在诊断检测中的应用等方面对近年来多重LAMP技术的研究进展进行了综述。
- 林文慧邹秉杰宋沁馨周国华
- 关键词：微流控芯片
- 玻璃化技术及其应用研究进展
- 2021年
- 近年来关于玻璃化技术的介绍局限于辅助生殖领域,其在多门学科中的发展及应用未有阐述,文章将结合有关玻璃化技术的研究性论文等成果,讲述此技术的特点与应用,并为相关制品能够用于低成本的室温储存提供思路。玻璃化技术是将物质转变为玻璃样无定形体的过程,玻璃化制品的分子几乎无运动与扩散,这避免了受扩散控制的不良反应的发生,提高了生物制品的储存稳定性。文章对应用于各领域的玻璃化技术研究成果进行介绍。对于玻璃化制品,储存温度的要求低于或等于玻璃化转变温度,若将制品的玻璃化转变温度提高至室温以上时,则有望将制品于室温下稳定储存,这对于依靠冷链、储存期短、易失活的产品来说极大地改善了它们的存放条件,对降低生物制品到资源有限地区的运输条件方面也提供了新思路。文章对玻璃化技术及其特点进行了介绍,探讨了影响玻璃化技术的因素主要有冷冻保护剂的种类,玻璃化过程中降温速率、复温时升温速率,玻璃化载体等方面,并且在生物药物、辅助生殖、食品领域的应用进行了阐述和展望。玻璃化技术长时间以来应用广泛,对影响玻璃化过程的因素进行优化,可获得多种便于运输的玻璃态生物制品,且玻璃化技术有望用于生物制品的室温储存,有着十分良好的应用前景。
- 邢思熙梁硕徐晓筱邹秉杰宋沁馨周国华
- 关键词：玻璃化技术冷冻保护剂生物药物酶类辅助生殖
- 多西他赛的临床应用进展被引量：22
- 2001年
- 多西他赛是新型紫杉类抗肿瘤药物 ,用于乳腺癌、非小细胞肺癌、胰腺癌、软组织肉瘤、头颈癌、胃癌、卵巢癌和前列腺癌等 ,单独用药和联合用药均有显著疗效。
- 宋沁馨于立洁
- 关键词：多西他赛抗肿瘤药物
- 基于克隆测序技术的人类白细胞抗原基因高分辨率分型方法的建立被引量：3
- 2014年
- 运用优化的扩增和克隆测序技术,建立了人类白细胞抗原(HLA-B)基因的高分辨率分型方法。针对HLA-B基因保守区序列设计引物进行等位基因扩增,基于质粒不相容原理将杂合型等位基因有效克隆入质粒DNA中,经细菌培养后进行Sanger测序,根据测序结果经ClustalX2软件分析和IMTG/HLA数据库的BLAST比对即可完成HLA-B基因的高分辨率分型。利用建立的方法对7例临床样本进行了HLA-B基因分型,并且与第三方直接碱基序列分析基因分型技术(PCR-SBT)进行比对,结果完全一致。本方法无需专业分型软件,准确度高,成本低;采用通用引物进行等位基因的扩增和测序,无需传统方法中繁琐的引物设计和过程优化,实现了HLA-B基因的高分辨率分型。
- 邢晓清初亚男项铮宋沁馨周国华
- 5种试剂盒对血浆游离DNA提取效果的比较被引量：1
- 2018年
- 目的筛选一种操作简单、快捷、成本低、提取效率高、易富集到短片段的血浆游离DNA(cell-free DNA,cf DNA)提取试剂盒。方法向健康人血浆中投入一定量的6种长度各异的非人源DNA,经5种试剂盒提取后,使用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,q PCR)定量,比较5种试剂盒提取回收率的差异。用上述试剂盒提取乳腺癌患者血浆cf DNA,并对其中6种不同长度的Kras基因片段进行定量,比较5种试剂盒对cf DNA提取效率的差异。结合提取成本、耗时等综合评价,最终筛选出最优试剂盒。结果试剂盒1对>157 bp的片段回收率最高(75.5%~87.4%),提取总cf DNA含量最高[(154.0±10.1)copies·μL-1血浆)],每个样本提取成本为274元、耗时73 min,但提取过程需要真空泵。试剂盒2对<157 bp的片段回收率在5个试剂盒中最高(31.8%~33.7%),对<145 bp的cf DNA提取效率最高[(81.7±6.2)copies·μL-1血浆)],提取总cf DNA含量[(137.1±13.9)copies·μL-1血浆)]仅次于试剂盒1,每个样本提取成本为15.6元、耗时43 min,无需特殊仪器。结论试剂盒1提取的cf DNA总量最高,但成本较高;对于提取片段分布<150 bp的cf DNA,宜选用试剂盒2,且性价比最高。
- 李雪莲齐谢敏邹秉杰黄青宋沁馨周国华
- 关键词：试剂盒血浆游离DNA实时荧光定量PCR
- 抗生素筛选方法被引量：3
- 2010年
- 细菌耐药性发生率的升高,激励着人们去寻找更多的筛选抗生素的策略,进而发现了更多的抗生素作用机制。靶向策略、高通量筛选等方法已经被用于检测有潜力的抗生素。细菌的DNA复制、细胞分裂和蛋白合成的中间步骤已经成为了筛选的新靶点,双组分信号传递系统也成为了较为重要的药物新筛选靶点。微生物基因组学的发展,给新抗生素的发现带来了更大的希望,使人们可以发现更多的新作用靶点。
- 马寅姣宋沁馨顾觉奋
- 关键词：抗生素基因组
- 基于荧光素酶生物发光检测方法的研究及其应用进展
- 2023年
- 生物发光现象广泛存在于自然界中,不管是在陆地或是海洋都有发光生物的踪迹。其中基于荧光素酶的生物发光系统被广泛研究,启发着人类在基因、表观遗传等方面进行探索,并且开发出一系列相关的检测方法,用于体内体外各方面研究。本文从生物发光系统、荧光素酶的种类以及荧光素酶生物发光检测方法的开发与应用这几个方面进行总结,简要概括近年来基于荧光素酶生物发光检测的研究进展。
- 刘琳胡婷婷王梦灵聂耀张惟杰王琛邹秉杰邹秉杰宋沁馨
- 关键词：荧光素荧光素酶
- Tm值差异型不对称PCR方法的建立及其在分子诊断中的应用
- 2016年
- 多数分子诊断方法对靶基因的检测都是以单链DNA为基础的,如何获得大量和高质量的单链靶DNA分子一直是研究热点.以包含BRCA1基因上3个单核苷酸多态性(SNP)的DNA片段为研究对象,通过调整不对称扩增引物碱基序列组成(5′-端引入错配或加入锁核苷酸(locked nucleic acid,LNA)),使用相差10倍浓度来增加不对称引物间Tm值差异,改进扩增条件(添加增强剂的扩增缓冲液,不同退火温度的二阶循环扩增程序)后,进行不对称扩增来产生大量单链靶DNA产物.结果表明Tm差异型不对称PCR(Tm difference asymmetric PCR,TDA-PCR)可有效提高单链DNA分子产率,降低引物设计难度,也扩大了模板序列的适用范围.此外,还针对禽流感病毒H5N1的血凝素(haemagglutinin)HA基因保守序列进行不对称扩增,用获得的单链DNA为模板进行焦磷酸测序检测,所得结果与参考序列一致且无明显干扰信号.因此,采用Tm值差异型不对称PCR可使焦磷酸测序等分子诊断流程更为简便,成本更低,效率更高,具有很好的通用性和实用性.
- 饶华春滕继云刁勇宋沁馨王立强杨会勇周国华
- 关键词：焦磷酸测序禽流感病毒
- 全血改进线性指数聚合酶链式反应用于焦磷酸测序检测基因多态性被引量：3
- 2015年
- 焦磷酸测序是目前基因多态性检测的主要方法之一,但是其前期的样本制备工作较为繁琐,限制了其在临床检测中的应用。为了简化焦磷酸测序的流程,本研究根据不对称PCR原理,改进了线性指数聚合酶链式反应(LATE-PCR)的引物设计方法,增加过量引物的长度和浓度,并结合全血直接扩增技术,建立了基于普通r Taq聚合酶和高p H缓冲液(Hp H Buffer)的全血改进LATE-PCR(Improved LATE-PCR,im LATE-PCR)方法。考察了方法的最优扩增体系、血液抗凝剂对其影响以及全血模板量。采用单管、一步法直接扩增出单链测序模板,成功地对24例临床血样的乙醇脱氢酶基因多态性进行了检测,检测结果可用于指导临床个体化用药。24例样本的基因型分别为ADH1B位点AA纯合6例、AG杂合14例、GG纯合4例;ADH1C位点GG纯合20例、AG杂合4例、AA纯合0例。
- 项铮刘云龙邢晓清初亚男宋沁馨周国华
- 关键词：焦磷酸测序基因多态性酒精代谢
