张栋
- 作品数:23 被引量:76H指数:5
- 供职机构:北京协和医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金北京市科技新星计划艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学自动化与计算机技术农业科学更多>>
- PCR-核酸飞行时间质谱系统检测新型冠状病毒方法的建立及应用研究被引量:12
- 2020年
- 背景新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在全球暴发,实验室检测结果是疾病诊断的重要依据,检测方法的灵敏度和特异度是影响实验结果的关键因素,现实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)核酸检测方法是COVID-19确诊的通用方法,但其检测灵敏度有方法局限性,依赖标本病毒含量。通过对PCR-核酸飞行时间质谱检测方法的优化,从而提高对低新型冠状病毒(SARS-CoV-2)含量病例检测的灵敏度,可为现有方法做有效补充。目的应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)原理,在Clin-ToFⅡ飞行时间质谱系统上,建立PCR-核酸飞行时间质谱(PCR-TOF MS)系统检测SARS-CoV-2的方法,并评估其实际应用价值。方法2020年2—3月于上海市临床检验中心室间质评阳性样本40份、阴性样本7份,国家卫生健康委员会室间质评阳性样本41份、阴性样本33份,本实验室购买阳性质粒及稀释样本32份,健康人样本28份,空白对照超纯水5份,共186份样本作为建立PCR-TOF MS系统数据。于2020年1—2月收集安徽省内临床送检到安徽省疾病预防控制中心的疑似COVID-19患者上呼吸道样本80份(咽拭子样本55份、痰液样本25份)及健康人群样本20份(均为咽拭子样本)作为评估PCR-TOF MS系统效果的数据。建立PCR-TOF MS系统试验体系步骤,包括PCR扩增、虾碱性磷酸酶(SAP)消化、单碱基延伸和质谱检测;并基于阳性质粒优化模版量,根据186份样本检测质谱峰的信噪比(SNP)确定该方法在SARS-CoV-2检测时的判读标准。对80份疑似SARS-CoV-2样本和20份健康人群样本进行检测分析,并与实时荧光定量PCR法进行对比。结果通过对PCR-TOF MS模板条件的优化,模版量6μl时,扩增产物可获得典型的质谱峰图。建立的PCR-TOF MS反应体系可以对SARS-CoV-2核酸的开放读码框1ab(ORF1ab)基因和核壳蛋白(N)基因进行有效扩增检测。本研究PCR-TOF MS方法对临床疑似病例样本的检出率为9
- 王俊张栋陈晴晴俞俊岭杨奕乔亮孙永
- 关键词:新型冠状病毒基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱核酸检测
- 苯扎托品对大鼠非动脉炎性前部缺血性视神经病变模型神经保护作用初探被引量:6
- 2019年
- 目的观察并初步探讨苯扎托品对大鼠非动脉炎性前部缺血性视神经病变(rNAION)模型RGC死亡及视神经损伤的保护作用。方法Sprague-Dawley大鼠25只,以右眼为实验眼。采用光动力方法建立rNAION模型并随机分为苯扎托品干预组和PBS对照组,分别为13、12只大鼠;左眼为正常对照组。大鼠按体重10 mg/kg的剂量腹腔注射苯扎托品溶液0.2 ml,PBS对照组大鼠腹腔注射等体积PBS;1次/d,连续21 d。建模后1、3、7 d直接检眼镜检查观察大鼠视盘改变。建模后28 d,透射电子显微镜观察三组大鼠视神经髓鞘、轴突损伤情况;经上丘荧光金逆行标记及荧光显微镜照相,观察苯扎托品干预组和PBS对照组大鼠RGC密度,计算RGC存活率。两组大鼠RGC密度及存活率比较采用单因素方差分析。结果建模后1、3 d,rNAION模型组大鼠视盘水肿,边界欠清晰;建模后7 d,视盘水肿较建模后3 d时减退,边界模糊。建模后28 d,荧光显微镜观察发现,苯扎托品干预组、PBS对照组大鼠RGC密度分别为(1173±868)、(308± 194)个/mm^2;两组间差异有统计学意义(F=7.552,P=0.015)。RGC存活率分别为47.6%、13.7%;两组间差异有统计学意义(F=8.184,P=0.012)。透射电子显微镜观察发现,正常对照组大鼠视神经纤维束结构完整,可见大小不等的轴突规则排列,髓鞘明显。PBS对照组大鼠视神经髓鞘解体,轴突消失,可见"洋葱样"小体、胶质增生;苯扎托品干预组大鼠多数轴突和髓鞘结构基本完整,破坏程度较PBS组明显减轻。结论苯扎托品干预组大鼠RGC存活率和视神经轴突、髓鞘破坏较对照组明显改善,具有潜在的神经保护价值。
- 干霖洋崔建涛丑玉宇汪宇涵杜虹李东辉戴威张宏张栋马瑾钟勇
- 关键词:视网膜神经节细胞
- 生食感染广州管圆线虫蜗牛引起嗜酸性粒细胞增多性脑膜炎1例
- 2024年
- 本文报道1例生食蜗牛10 d后出现持续发热和中枢神经系统症状的男性病例。结合临床表现、流行病史及病原学检测结果,诊断为广州管圆线虫病。予以阿苯达唑驱虫、地塞米松抗炎治疗后康复。本文梳理该患者的诊疗历程,并结合文献复习,以期为临床诊疗提供参考。
- 户梦婷张栋贾沛瑶陆旻雅周梦兰郭佳钰苏慧婷高羿席婧媛朱华栋杨启文
- 关键词:广州管圆线虫寄生虫
- 一种麻醉方法对实验小型猪的效果观察被引量:3
- 2008年
- 目的探讨戊巴比妥钠和地西泮肌肉注射与戊巴比妥钠静脉麻醉对实验小型猪的麻醉效果。方法对16头实验小型猪进行戊巴比妥钠诱导麻醉加地西泮肌肉注射配合戊巴比妥钠静脉滴注麻醉控制效果进行观察并分析。结果成功麻醉16例,占100%。结论采用戊巴比妥钠肌肉注射诱导麻醉配合静脉滴注麻醉效果好,麻醉过程平稳,肌肉松弛效果显著,生命体征稳定,手术后苏醒快。
- 张栋郁佩华刘天云
- 关键词:麻醉
- 成人呼吸道感染病原诊断核酸检测技术临床应用专家共识(2023)被引量:13
- 2023年
- 呼吸道感染性疾病在临床中极为常见,病原体的快速检测和精准诊断是其有效治疗的前提。传统微生物学及免疫学技术对呼吸道病原体检测的灵敏度偏低,核酸检测技术的发展和临床应用大幅提高了呼吸道病原体的诊断能力。如何基于患者基础疾病、呼吸道感染类型及病原谱合理选择核酸检测技术并正确理解其临床应用价值,成为重要的临床问题。为此,中华检验医学培训工程专家委员会联合中华医学会呼吸病学分会组织我国多学科专家共同撰写了《成人呼吸道感染病原诊断核酸检测技术临床应用专家共识(2023)》。该共识参考国内外指南及文献,分析了实时荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)技术、等温扩增技术、数字PCR技术、核酸即时检测技术和病原体高通量测序技术的临床应用场景、技术特点和性能验证要求,以及该类技术在成人急性上呼吸道感染、气管支气管炎、社区获得性肺炎、医院获得性肺炎/呼吸机相关性肺炎、慢性阻塞性肺疾病急性加重、肺结核和免疫功能受损人群呼吸道感染中的应用,以供临床参考借鉴。
- 中华检验医学培训工程专家委员会中华医学会呼吸病学分会徐英春瞿介明陈新飞沈宁苏欣吴文娟王瑶王一民奕巧莲张栋张静周华周敏
- 关键词:呼吸道感染成人病原诊断核酸检测
- 一种一次性心电图用棉棒包
- 本实用新型涉及一种一次性心电图用棉棒包,包括:棉棍袋,一端呈开口状设置;棉棍封口袋,连接所述棉棍袋的开口处,且所述棉棍封口袋与所述棉棍袋的连接处一侧形成有撕开部;挂置片,形成于所述棉棍封口袋远离所述棉棍袋的一端,该挂置片...
- 左玲燕郭燕宏张栋
- 精准医学检验:现状与挑战
- 自从2015年前美国总统奥巴马提出"精准医学计划"以来,精准医学的研究成为炙手可热的医学研究方向之一。精准医学的研究发展离不开精准的医学检验技术,其中,二代测序是目前研究最多,应用前景最开阔的新技术。然而,目前为止,除了...
- 张栋
- 宏基因组高通量测序技术在中枢神经系统感染性疾病中的临床价值分析被引量:5
- 2023年
- 目的 探讨宏基因组高通量测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)技术在中枢神经系统感染性疾病诊断中的临床价值。方法 依托中国医学科学院北京协和医院感染性疾病宏基因组检测平台,回顾性分析2022年4—12月临床诊断为中枢神经系统感染性疾病患者的临床信息、常规实验室检测结果及mNGS结果等相关资料,评价mNGS技术在中枢神经系统感染性疾病诊断中的价值。结果 在39例临床诊断为中枢神经系统感染性疾病的患者中,29例(74.4%)检出疑似致病病原体特异性序列,其中11例(37.9%)检出细菌,13例(44.8%)检出病毒,3例(10.3%)检出真菌,1例(3.5%)检出细菌及病毒,1例(3.5%)检出真菌及病毒,真阳性率为74.4%。10例报告阴性结果,假阴性率为25.6%。mNGS技术的阳性率明显高于临床常规病原学检查(包括脑脊液涂片、培养、病原体抗原及核酸聚合酶链式反应)的阳性率(74.4%比23.7%)。结论 相较于现有的临床常规病原学检查手段,mNGS技术在中枢神经系统感染性疾病诊断中具有更高的真阳性率,可能有助于中枢神经系统感染性疾病的早期诊断。
- 陆旻雅郭佳钰张栋苏慧婷高弈赵颖杨启文徐英春
- 关键词:中枢神经系统脑脊液
- 一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备
- 本发明提供了一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备,涉及基因技术领域,该方法包括:获取待测样本的测序数据;对测序数据进行预处理,获得目标测序数据;将目标测序数据与物种数据库进行比对,获得目标物种序列数据集,对目标...
- 张栋杜斌徐英春彭劲民杨启文刘瑞婷赵颖奕巧莲张戈李瑞琳拔素苹
- 一种动物术后护理箱
- 本实用新型实施例提供的一种动物术后护理箱,在箱体内部设置有水床,该水床内部设置有电热丝,该电热丝用于加热存储在水床中的水,当加热到预定温度后,控制器控制电热丝断电,进而水床停止加热,此时,将小动物置于水床上,闭合箱体,使...
- 张栋左玲燕