张鲁嘉
- 作品数：34 被引量：84H指数：4
- 供职机构：华东理工大学生物工程学院生物反应器工程国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金江苏省高技术研究计划项目更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程生物学化学工程理学更多>>
- 蛋白质结构建模的后期优化策略被引量：2
- 2008年
- 以Lip8为研究对象,以分级开放式优化和组合优化为优化策略,分别采取四种不同的优化手段对相同的初始模型进行了优化,同时比较了含水体系与不含水体系的优化过程,最终获得8个相应优化后的蛋白模型.采用Procheck,Errat,Profile 3D及Ramachandran图等方法对上述8个模型进行评估.通过比较各项评估结果,研究了不同优化方法对最终模型准确性的影响,结果表明,优化过程中采用分级开放式策略,同时考虑显性溶剂(水)体系和加入分子动力学优化的优化方法可以获得相对最优结构.
- 张鲁嘉徐涛袁佩青魏东芝
- 关键词：同源建模分子动力学
- 利用Pichia pastoris生产S-腺苷甲硫氨酸的发酵工艺被引量：7
- 2008年
- 在摇瓶中考察了重组Pichia pastoris发酵的诱导剂量,L-甲硫氨酸,以及pH对腺苷甲硫氨酸产量的影响。放大到3.7 L发酵罐和30 L发酵罐后,研究了重组细胞的发酵过程变化,对S-腺苷甲硫氨酸初步纯化。摇瓶中优化后的发酵条件是:每天添加1%甲醇诱导,L-甲硫氨酸为50mmol/L,培养基pH 5.0。培养144 h后SAM产量达到2.32 g/L。3.7 L发酵罐中发酵251 h后细胞浓度为120 g/L,SAM总量为15.18 g。放大到30 L发酵罐中,发酵225.5 h后细胞浓度约为120 g/L,SAM总量为145.05 g。纯化后SAM的纯度为93.5%,回收率为84.5%。
- 张建国王学东张鲁嘉周英魏东芝李军
- 关键词：PICHIAPASTORIS腺苷甲硫氨酸发酵工艺
- 反相高效液相色谱法对大鼠体内菲达司他的药代分析
- 2008年
- 建立反相高效液相色谱（RP—HPLC）测定大鼠血浆中菲达司他浓度的方法，在此基础上对菲达司他在大鼠体内的药代动力学进行初步研究。菲达司他的血浆样品利用乙酸乙酯提取法进行处理，色谱检测条件为用安捷伦Zorbax Eclipse XDB C18色谱柱，紫外检测波长200nm，流动相中v（水）：v（甲醇）为72．28，流速1mL／min，柱温30℃。建立的RP—HPLC法线性范围为0．8～400ug／mL（R=0．9997）。提取回收率大于95％，日内、日间精密度相对标准差（RSD）小于2％。本法简便、准确，适用于菲达司他药代动力学的研究；菲达司他在大鼠体内的药代动力学过程二室模型．
- 汪吉忠任宇红欧伶张鲁嘉魏东芝
- 关键词：反相高效液相色谱法药代动力学
- 通过分析来自Pyrococcus abyssi的腈水解酶中带电基团位置变化探讨蛋白耐热机制
- 2012年
- 蛋白含带电侧链基团的氨基酸的位置对蛋白质的热稳定性有很大的影响,目前,往往采用蛋白质结构模型"静态"分析这一影响。本文以1株耐热的腈水解酶作为研究对象,构建并异源表达了该酶,对其酶学性质进行初步分析。利用Discovery Studio对该酶进行同源建模,得到空间结构。将此空间结构利用Gromacs软件在不同温度下进行分子动力学(MD)模拟,使用Macrodox软件计算蛋白质所有带电氨基酸残基的包埋率与溶剂可接触性面积(SA),发现在不同温度下,部分氨基酸带电基团的SA值会发生显著变化。说明通过静态分析并不一定能够得到非常准确的结果,而应进行动态分析。
- 汤晓芒张鲁嘉崔东冰姚志强王学东魏东芝
- 关键词：同源建模分子动力学腈水解酶热稳定性
- 一种具有抗氧化活性的大菱鲆鱼皮发酵产物
- 本发明提供一种具有抗氧化活性的大菱鲆鱼皮发酵产物，是用米曲霉发酵大菱鲆鱼皮匀浆液制成的。本发明可以有效的降解鱼皮蛋白，具有工艺简单，成本消耗低，容易产业化的优点，为深入利用大菱鲆鱼皮提高其附加值提供了新途径。同时，获得水...
- 毛相朝方波欢孙建安张鲁嘉李钰金
- 文献传递
- 基于QMMM计算的腈水解酶主/副产物精准切换
- 腈水解酶(EC 3.5.5.1)直接将腈转化成相应的羧酸和NH3,因其高化学特异性和对映体选择性,在精细化学品和药物中间体生产中已经被广泛认为化学催化剂的优良替代品,受到越来越多关注。研究发现腈水解酶能够催化底物腈生成主...
- 姜水琴张鲁嘉魏东芝
- 关键词：腈水解酶
- 文献传递
- 4-戊基苯酚单克隆抗体的制备及其可变区的同源建模被引量：2
- 2017年
- 目的制备4-戊基苯酚(4-AP)单克隆抗体(mAb),通过分子生物学方法对其可变区cDNA克隆和同源建模,为4-AP单链抗体制备及抗体分子层面改造奠定基础,同时为4-AP的免疫学检测提供一种新方法。方法将免疫小鼠脾脏细胞与Sp2/0细胞融合,筛选出F10阳性单抗细胞株。通过其mRNA的抽提,克隆出可变区cDNA序列,利用生物软件进行同源建模和分子对接。结果在最适条件下,其间接竞争ELISA(ic-ELISA)公式为y=A_2+(A_1-A_2)/(1+(x/x_0)~p)(A_1=1.28;A_2=-0.07;x_0=12 560.75;p=0.74),相关系数(R^2)为0.997,其最低检测限为0.65μg/mL。mAb重链和轻链分别属于IgG1型和Kappa型,其与4-AP的结合力为氢键和疏水作用。结论成功制备出1株稳定分泌的4-AP mAb的杂交瘤细胞株。通过同源建模对抗体可变区空间结构进行深入研究,为单链抗体及抗体改造提供参考,同时为4-AP含量检测提供新方法。
- 成磊吴海珍费静张鲁嘉叶江张惠展
- 关键词：单克隆抗体同源建模
- γ-谷氨酰转肽酶的制备、酶学性质及其在小肽合成中应用的研究
- γ-谷氨酰转肽酶(γ-glutamyltranspeptidase,γ-GTP)可以催化γ-谷氨酰基化合物中谷氨酰基的水解并把它转移到其他氨基酸或小肽上,具有非常广阔的工业应用前景.国外已经对γ-GTP的性质及其在小肽合...
- 张鲁嘉
- 关键词：Γ-谷氨酰转肽酶酶促反应水解纯化酶学性质
- 文献传递
- 一种酶固定化方法及其应用
- 本发明提供一种酶固定化方法及其应用。该固定化方法利用磁感应蛋白与靶蛋白的直接融合，然后通过融合蛋白对纳米铁珠的吸附，从而实现酶的固定化。该方法可提高固定化酶的热稳定性和更强的pH耐受性，所制备的固定化酶在重复利用15次后...
- 高蓓魏东芝张鲁嘉王风清江敏刘国松
- 文献传递
- 一种毕赤酵母基因工程菌发酵生产S－腺苷甲硫氨酸的方法
- 本发明公开了一种由毕赤酵母基因工程菌发酵生产S－腺苷甲硫氨酸的方法，包括将整合了外源表达基因S－腺苷甲硫氨酸合成酶基因的毕赤酵母基因工程菌种子液接种到发酵培养基中进行发酵培养，其特征在于：所述的毕赤酵母基因工程菌种子液接...
- 张鲁嘉张建国王学东魏东芝
- 文献传递
