曲妮妮 作品数:9 被引量:55 H指数:4 供职机构: 中国水产科学研究院南海水产研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省科技计划工业攻关项目 国家科技支撑计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
企鹅珍珠贝热休克蛋白70基因的克隆与序列比较分析 采用同源克隆和锚定 PCR 技术,从企鹅珍珠贝(Pteria penguin)中克隆到热休克蛋白 hsp70基因的 cDNA 全序列。cDNA 全长2 308 bp,3′非编码区域(UTR)为234 bp,5′UTR 为... 黄桂菊 喻达辉 曲妮妮 郭奕慧 李莉好 杜博 童馨关键词:企鹅珍珠贝 HSP 氨基酸 热休克蛋白 文献传递 合浦珠母贝良种选育技术 喻达辉 黄桂菊 谷龙春 成书营 曲妮妮 张希 刘建业 吴开畅 李有宁 邢孔武 李金碧 陈明强 郭奕惠 该成果采用双列杂交方法,构建了广东、广西和海南3地的合浦珠母贝双列杂交家系90个,在该基础上构建第二代家系49个,利用三亚、徐闻亲本新建第二批家系45个;通过选育,10个家系壳长生长速度提高了15.4-17.8%,获得家...关键词:关键词:合浦珠母贝 良种选育 基于FIASCO技术的合浦珠母贝微卫星标记分离与筛选研究 被引量:14 2010年 用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了合浦珠母贝Pinctada fucata基因组微卫星标记的分离与筛选研究。合浦珠母贝基因组DNA经限制性内切酶MseI酶切后与接头连接,用生物素标记的(CA)15探针与其杂交,然后用磁珠富集、洗脱获得单链目的片段,经PCR扩增后形成双链,最后进行克隆转化,构建微卫星富集文库。挑选克隆用探针引物(CA)15和载体引物进行第2次筛选,获得阳性克隆357个,测序结果表明,297个克隆(83.2%)含有微卫星序列,包括479个微卫星DNA结构域。其中完美型微卫星有370个(77.3%),非完美型95个(19.8%),复合型14个(2.9%)。合成引物49对,有31对(63%)扩增出目的产物,其中9对在种群中(n=32)具有扩增多态性,其多态信息含量PIC值在0.375―0.809之间,平均为0.536;等位基因数在2―9个之间,平均为4.889个;观测杂合度介于0.200―0.600之间,平均为0.415;期望杂合度的变化范围为0.454―0.844,平均为0.598。表明FIASCO技术适合于合浦珠母贝微卫星标记的分离与筛选。 曲妮妮 龚世园 黄桂菊 童金苟 喻达辉关键词:微卫星标记 合浦珠母贝热休克蛋白hsp70基因的克隆与表达分析 采用同源克隆和 RT-PCR 技术对合浦珠母贝(Pinctada fucata)热休克蛋白 hsp70基因进行了克隆和表达分析。获得 cDNA 全长序列2 365 bp,其中3′非编码区域(UTR)为318 bp, 5′... 黄桂菊 曲妮妮 喻达辉 李莉好关键词:合浦珠母贝 HSP70 外套膜 热休克蛋白 文献传递 企鹅珍珠贝热休克蛋白70基因的克隆与序列比较分析 被引量:14 2008年 采用同源克隆和锚定PCR技术,从企鹅珍珠贝Pteria penguin中克隆到热休克蛋白hsp70基因的cDNA全序列。cDNA全长2 308 bp,3’非编码区域(UTR)为234 bp,5’UTR为118 bp,开放阅读框(ORF)为1 956 bp,编码651个氨基酸,分子量为70.97 kd,理论等电点为5.24,有2个糖基化位点:NKSI和NVSA,并含有HSP70家族的3个签名序列:IDLGTTYS,DLGGGTFD和IVLVGGSTRIPKIQK,以及C末端的保守序列EE-VD。结合BLAST分析的结果,可以确认获得的cDNA序列为企鹅珍珠贝HSP70的编码序列。与合浦珠母贝Pinctada fucata hsp70的氨基酸序列相比,企鹅珍珠贝多1个糖基化位点NVSA,少1个氨基酸,包括1个氨基酸插入和2个缺失。两者的氨基酸序列一致性高达92%,突变位点52个;两者的核苷酸序列一致性高达79%,突变位点416个。系统发育分析表明两者的亲缘关系最近,与传统分类相符,然后与太平洋牡蛎等聚合在一起。该基因的克隆和比较分析为进一步深入研究珍珠贝类的抗逆机理、抗性育种及其进化具有重要意义。 黄桂菊 喻达辉 曲妮妮 郭奕慧 李莉好 杜博 童馨关键词:PENGUIN CDNA克隆 合浦珠母贝热休克蛋白hsp70基因的克隆与表达分析 被引量:22 2007年 采用同源克隆和RT-PCR技术对合浦珠母贝(Pinctada fucata)热休克蛋白hsp70基因进行了克隆和表达分析。获得cDNA全长序列2 365 bp,其中3’非编码区域(UTR)为318 bp,5’UTR为88 bp,开放阅读框(ORF)为1 959 bp,编码652个氨基酸,分子量约为71.39 kD,理论等电点为5.22,并含有3个HSP70家族的签名序列IDLGTTYS、DLGGGTFD和EEVD。同源性分析表明,合浦珠母贝HSP70的氨基酸序列与太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)等双壳贝类的相似性高达86%以上,基于氨基酸序列的聚类分析表明,合浦珠母贝与牡蛎属种类亲缘关系最近。高温、高盐刺激后,半定量RT-PCR检测发现hsp70基因的表达明显增加,高温刺激的表达量高于高盐刺激,高温刺激组不同组织的表达量由大到小依次为鳃、消化腺、外套膜、肌肉、性腺,高盐刺激组不同组织的表达量由大到小依次为鳃、外套膜、肌肉、消化腺、性腺,表明HSP70参与了机体对刺激的应答过程。该基因的克隆为进一步深入研究合浦珠母贝的抗逆机理及其遗传改良奠定了重要基础。 黄桂菊 曲妮妮 喻达辉 李莉好关键词:合浦珠母贝 同源克隆 合浦珠母贝微卫星DNA标记分离与遗传多样性研究 合浦珠母贝广泛分布于中国、日本、印度、澳大利亚等国的热带和亚热带海区,是生产海水珍珠的主要贝类,具有极高的经济价值。本研究利用FIASCO法构建了合浦珠母贝的基因组微卫星富集文库,并设计引物进行PCR筛选,获得9个多态位... 曲妮妮关键词:合浦珠母贝 微卫星 文献传递 合浦珠母贝基因组微卫星的分离及其序列特征分析 采用(CA)_n生物素标记探针以及磁珠富集法构建了合浦珠母贝(Pinctada fucata)的基因组微卫星富集文库。随机挑选1289个克隆,用载体通用引物和探针引物进行 PCR 筛选,最终确定候选克隆357个(27.6... 曲妮妮 黄桂菊 喻达辉关键词:合浦珠母贝 微卫星 基因组 文献传递 合浦珠母贝3个养殖群体遗传多样性的微卫星分析 被引量:12 2009年 采用微卫星分子标记对我国广东大亚湾、广西北海、海南三亚的合浦珠母贝养殖群体进行了遗传多样性分析。从49对引物中筛选出31对有效扩增引物,种群扩增获得9个多态位点,多态位点比例为29.03%。它们在3个群体共96个个体中产生了44个等位基因,平均每个位点产生4.889个。3个群体的平均期望杂合度分别为0.590、0.600、0.615;平均观察杂合度分别是0.393、0.425、0.325;平均多态信息含量PIC值分别是0.530、0.551、0.556。表明3个群体的遗传多样性处于较高水平。平均遗传偏离指数分别为-0.324、-0.336、-0.304;哈代-温伯格平衡检测发现,3个群体27个位点中21个位点偏离平衡状态。遗传分化和遗传距离分析表明,海南群体与广东群体之间的亲缘关系较近,而与广西群体的亲缘关系较远。 曲妮妮 龚世园 黄桂菊 喻达辉关键词:合浦珠母贝 养殖群体 微卫星