朱静
- 作品数：6 被引量：7H指数：2
- 供职机构：云南农业大学植物保护学院农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：公益性行业(农业)科研专项高层次科技人才培引工程国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 同步检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法
- 本发明涉及一种同步检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法，属植物保护领域。通过分别设计合成TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA正反向引物，CTAB法提取染病植物组织或传毒介体昆...
- 李凡刘芳陈海如谭冠林兰平秀王海宁李晓静朱静吴德喜蔡红
- 文献传递
- 三七Y病毒部分ci基因和cp基因的克隆及序列分析被引量：2
- 2016年
- 对云南文山地区三七上获得的三七Y病毒（Panax virus Y,PnVY）不同分离物进行了部分ci基因和cp基因的克隆及序列分析,获得的部分ci基因长657 nt,编码219个氨基酸;获得的部分cp基因长834 nt,编码278个氨基酸。所获得的11个PnVY分离物的ci基因之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为80.8%～99.8%和91.3%～100%,与其他PnVY分离物的同源性分别为80.8%～98.8%和92.7%～99.5%。所获得的18个PnVY分离物的cp基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为91.8%～99.9%和93.9%～100%,与其他PnVY分离物的同源性分别为92.0%～100%和95.7%～100%。系统进化树分析表明,基于ci基因可以将PnVY分为2个大组,第Ⅱ组分离物之间的差异相比第Ⅰ组的复杂;基于cp基因可以将PnVY分为3个大组,第Ⅲ组分离物之间差异最大。基于ci基因和cp基因的分析结果均表明,PnVY不同种群间存在较为丰富的遗传多样性,但尚不清楚PnVY的分子变异是否与PnVY引起的多种症状类型有关。
- 李梅蓉李晓静包改丽朱静杨馨谭冠林兰平秀李凡
- 关键词：CP基因分子变异
- 南方水稻黑条矮缩病毒S9片段基因编码产物的生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 预测南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)S9片段编码蛋白的功能,为进一步深入分析相关基因编码产物的功能提供理论依据。应用RT-PCR克隆了SRBSDV云南芒市分离物(SRBSDV-YNMShi)的S9片段,测定其全序列,并对S9及其编码蛋白进行生物信息学分析。结果表明,S9片段全长1900nt,编码P9-1和P9-22个蛋白。S9核苷酸序列与广东、海南、湖北分离物的同源性分别为99.5%、99.1%和98.7%。系统进化分析再次印证了SRBSDV是斐济病毒属的成员,SRBSDV-YNMShi与广东、越南分离物聚成一枝,与海南分离物有一定的进化分离趋势。P9-1为一个不稳定疏水蛋白,亚细胞定位于细胞核内,无规则卷曲是该蛋白质的主要结构元件,与其亲缘关系最近的水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)有着类似结构。P9-2是有2个跨膜结构域的亲水性稳定蛋白,亚细胞定位于质膜,α-螺旋是其主要结构元件,有1个保守的G蛋白偶联受体。P9-1可能为SRBSDV复制的关键因子,P9-2可能为膜蛋白,具有转运的功能。
- 胡秀弟朱静吴文斗任国敏李凡
- 关键词：南方水稻黑条矮缩病毒生物信息学分析
- 云南番木瓜环斑病毒部分ci基因的克隆及序列分析
- 2013年
- 对云南昆明、楚雄、保山、德宏、临沧、玉溪、红河等地番木瓜、南瓜和罗汉果上获得的番木瓜环斑病毒（Papayaringspotvirus，PRSV）不同分离物进行了部分ci基因的克隆和序列分析，获得的部分ci基因长666nt，编码221个氨基酸。关于13个PRSV云南分离物部分ci基因核苷酸序列的同源性为80％。98％，氨基酸同源性为92％-100％。选取本文具有代表性的9个PRSV分离物与国内外12个PRSV分离物相比，核苷酸序列的同源性为79％-93％，氨基酸序列同源性为92％-99％。运用MEGA软件绘制的基于部分ci基因核苷酸序列的系统进化树表明，这些PRSV病毒可以分为两个大组，本文获得的9个云南分离物中的8个分离物与印度分离物（India—W—EU475877）聚为第1组，第Ⅱ组成员比较复杂，包括大部分的亚洲分离物及全部美洲分离物。
- 朱静谭冠林李晓静刘芳包改丽李凡
- 关键词：番木瓜环斑病毒克隆
- 同步检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法
- 本发明涉及一种同步检测TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法，属植物保护领域。通过分别设计合成TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA正反向引物，CTAB法提取染病植物组织或传毒介体昆...
- 李凡刘芳陈海如谭冠林兰平秀王海宁李晓静朱静吴德喜蔡红
- 云南番木瓜环斑病毒的发生及遗传多样性被引量：5
- 2014年
- 【目的】明确云南省番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)发生情况,并对其进行遗传多样性分析。【方法】利用RT-PCR技术,于2011-2012年对采自云南省昆明市、楚雄州、保山市、德宏州、西双版纳州、临沧市、玉溪市、红河州、文山州等地的24个番木瓜、南瓜和罗汉果疑似病样进行扩增、测序,对样品中获得的940 bp PRSV部分cp基因及3′端非编码区的序列应用分子生物学软件MEGA 5进行系统发育分析。【结果】从17个样品中检测到了PRSV,检出率为70.8%,表明该病毒在云南的发生较为普遍。云南PRSV不同分离物间的核苷酸序列变异较大,与其他已报道的PRSV分离物之间的基因组3′端核苷酸序列一致性为81.7%-100%。基于PRSV的CP部分氨基酸序列及基因组3′端核苷酸的系统进化分析结果表明,来自亚洲、北美洲、南美洲和大洋洲的PRSV分离物可以分为2个组,其中第Ⅰ组均为来自中国的分离物,包括了大部分的PRSV云南分离物,第Ⅰ组内分离物间的差异较第Ⅱ组大;第Ⅱ组的分离物来源较为复杂,亚洲、北美洲、南美洲和大洋洲均有分布。基于PRSV CP部分氨基酸序列构建的系统进化树中,各分离物之间没有明显的地理和寄主相关性,而基于PRSV基因组3′端核苷酸序列构建的系统进化树中,除中国大陆分离物和印度分离物外,其他地区的PRSV在进化上与其地理来源有明显的相关性。【结论】PRSV在云南的昆明市、楚雄州、保山市、德宏州、西双版纳州、临沧市、玉溪市、红河州和文山州等地都有不同程度发生,且为害寄主植物涉及番木瓜、南瓜及罗汉果,PRSV侵染罗汉果为云南首次发现。云南PRSV分离物的分子变异很大,但是关于PRSV的分子变异是否与其地理分布及症状表现有关,以及P型和W型的分子区分特征还有待进一步研究。
- 朱静谭冠林包改丽刘芳李晓静吴祖建李凡
- 关键词：番木瓜环斑病毒CP基因分子变异
