李宁
- 作品数：7 被引量：55H指数：3
- 供职机构：军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划北京市科技计划项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 非限制翻译后修饰鉴定方法的研究进展被引量：1
- 2013年
- 蛋白质翻译后修饰在真核生物细胞内广泛存在,对蛋白质的结构和功能有着十分重要的影响.串联质谱技术的快速发展为翻译后修饰鉴定提供了高通量、高灵敏度和高分辨率的分析平台,但传统搜索引擎鉴定修饰的方法无法满足数据分析的需求,非限制翻译后修饰鉴定已成为目前蛋白质组修饰分析的重要手段之一.非限制翻译后修饰鉴定不需要在分析前指定修饰类型,可以直接从样品中找出大量已知或未知的修饰,对提高质谱图谱解析率以及揭示蛋白质的生物学功能具有十分重要的意义.本文首先介绍了非限制翻译后修饰鉴定的定义和发展历程,然后从序列匹配和谱图匹配两个方面详细综述了目前非限制翻译后修饰鉴定的主流算法,分析了非限制翻译后修饰鉴定的质量控制问题,最后结合非限制翻译后修饰鉴定的实际应用讨论了修饰鉴定算法的不足和发展方向.
- 张成普李宁马洁吴松锋朱云平
- 关键词：串联质谱蛋白质翻译后修饰生物信息学蛋白质组学
- 荨麻属植物的化学成分和药理作用研究进展被引量：21
- 2007年
- 荨麻属植物是常用草药,含有黄酮、萜、木脂素、脂类、有机酸、挥发油、蛋白质、微量元素等类型化合物。它具有广泛的药理作用,如抑制良性前列腺增生(BPH)、降血糖、免疫调节作用、降血压、降血脂、抗凝血、抑制炎症反应等。现对荨麻属植物的化学成分和药理作用研究进展进行综述。
- 李宁张庆林
- 关键词：荨麻化学成分药理学作用
- 鼠妇的镇痛、抗炎作用及化学成分研究
- 鼠妇为鼠妇科动物平甲虫(Armadillidium Vulgar)的干燥全体,又称潮虫、地虱、西瓜虫、平甲虫。鼠妇分布广,河北、山东、江苏、浙江等地都有发现。鼠妇主要含蛋白质、蚁酸,具有平喘、通经利尿、解毒止痛作用。国内...
- 李宁
- 关键词：鼠妇镇痛抗炎化学成分
- 文献传递
- 基于串联质谱数据的肽序列鉴定、翻译后修饰鉴定和蛋白质装配的质量控制研究
- 质谱技术的发展使高通量、快速的蛋白质组鉴定成为可能,鸟枪法蛋白质组鉴定策略因其高通量、自动化等特点被广泛采用,其流程分为实验和计算两部分,实验部分产出串联质谱数据,计算部分一般通过搜索蛋白质数据库给出可靠的肽段鉴定结果,...
- 李宁
- 关键词：蛋白质组学生物信息学
- 文献传递
- 中国蛋白质组学研究进展——以人类肝脏蛋白质组计划和蛋白质组学技术发展为主题被引量：1
- 2014年
- 蛋白质组学是对细胞或生物体全部蛋白质的系统鉴定、定量并阐释其生物学功能的学科.自21世纪初期开始,随着高精度、高灵敏度和快速扫描质谱仪的出现和快速发展以及微量蛋白质组样品高效分离技术的进步,蛋白质组学获得了快速发展,并在生理过程与病理机制研究等几乎所有生命科学研究领域得到了广泛的应用.过去10年,中国蛋白质组学研究在政府的支持和广大蛋白质组学研究人员的努力下呈现出腾飞式的发展态势.本文综述了人类肝脏蛋白质组计划和2010-2013年中国蛋白质组学技术的发展.
- 李衍常李宁徐忠伟翟琳辉樊锋旭常乘张成普郑俊杰徐平贺福初
- 关键词：蛋白质组学蛋白质相互作用蛋白质翻译后修饰生物信息学
- 鸟枪法蛋白质鉴定质量控制方法研究进展被引量：11
- 2009年
- 鸟枪法串联质谱蛋白质鉴定策略由于其高可靠和高效率而被广泛应用于蛋白质组学研究中,这种方法直接对蛋白质混合物进行酶切,以肽段为鉴定单元,继而推导真实的样品蛋白质.由于利用质谱图推导肽段存在一定的假阳性率,而且直接对蛋白质混合物的酶切也导致了肽段和蛋白质之间关联信息的丢失,所鉴定的蛋白质难免存在部分不可靠结果.因此,蛋白质鉴定的质量控制在蛋白质组学研究中极为重要.蛋白质鉴定的质量控制包含两大类主要方法,其一为利用肽段进行蛋白质组装,当前最常用也被证明最有效的方法是使用简约原则,即用最少的蛋白质解释所有鉴定肽段,现有的方法可以分为布尔型和概率型,其二为鉴定蛋白质的可靠性评估,包括单个蛋白质鉴定置信度和蛋白质鉴定整体水平的假阳性率计算.综合各种可辅助蛋白质鉴定的先验信息,构建普适的概率统计模型,是目前蛋白质鉴定质量控制方法的发展趋势.
- 李宁吴松锋朱云平杨晓明
- 关键词：串联质谱蛋白质鉴定鸟枪法
- 鼠妇乙醇提取物镇痛抗炎作用及化学成分研究被引量：19
- 2008年
- 目的:研究鼠妇乙醇提取物的镇痛和抗炎作用,并对其化学成分进行初步分离鉴定。方法:通过小鼠醋酸扭体法镇痛实验和环氧化酶抑制剂体外检测,研究鼠妇乙醇提取物的镇痛抗炎作用;通过色谱方法对鼠妇乙醇提取物化学成分进行分离纯化,并用各种理化及波谱技术鉴定其化学结构。结果:鼠妇乙醇提取物能明显延缓小鼠开始扭体反应的时间,减少小鼠的扭体次数;鼠妇乙醇提取物对环氧化酶-1(COX-1)、环氧化酶-2(COX-2)均有抑制作用;从鼠妇乙醇提取物中分离得到7个化合物,分别为β-谷甾醇、5-烯-3β-胆甾醇、麦角甾醇、7α-羟基胆甾醇、7β-羟基胆甾醇、正十八酸、顺式9-十八烯酸。结论:鼠妇乙醇提取物具有明显的镇痛和抗炎作用。
- 李宁匡岩巍陈明友张庆林
- 关键词：鼠妇乙醇提取物镇痛抗炎化学成分
