李艳妮
- 作品数:43 被引量:77H指数:4
- 供职机构:天津大学化工学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金天津市自然科学基金更多>>
- 相关领域:轻工技术与工程生物学理学医药卫生更多>>
- 新烟碱类化合物药效构象的分子对接研究被引量:1
- 2007年
- 从烟碱型乙酰胆碱受体(nACHR)-烟碱(nicotine)复合体晶体模型出发,采用SYBYL6.92软件包中FlexX分子对接模块对新烟碱类化合物的3种已上市化合物吡虫啉、噻虫啉、烯啶虫胺和3种吡虫啉的结构衍生物同受体蛋白作用的精确模型进行了研究.通过全局搜索方法构建配体的构象库进行对接,依据构象间RMS值对结果进行分类结合CScore打分函数数据对对接结果进行筛选,最终给出合理的新烟碱类化合物-烟碱型乙酰胆碱受体的药效作用构象模型:配体吡啶环上氮原子通过水分子同受体Leu102,Met114形成氢键并且咪唑环或噻唑环上亲水侧链同受体CYS187或SER186形成氢键,疏水侧链同疏水部位A(TYR164,TRP53,TYR89以及TYR185残基),或疏水部位B(TYR132,CYS187和CYS188)相互作用.此模型同早先有关文献报道的试验结果部分吻合,充分表明了其合理性.同时依据本构象模型,在新烟碱类化合物结构方面提出了一些改良建议并为研究其高选择性指出方向.
- 王振兴李艳妮孙艳华乔建军
- 关键词:分子对接FLEXX
- 乳酸乳球菌乳亚种YF11的非编码小RNAs015
- 本发明公开了一种乳酸乳球菌乳亚种YF11的非编码小RNA s015及应用,乳酸乳球菌YF11的非编码小RNA s015,其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.1所示;或与序列表SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列具...
- 朱宏吉乔建军齐佳琨赵秀丽李艳妮财音青格乐王斌斌
- Discodermolide及其衍生物三维定量构效关系的研究
- 2008年
- Discodermolide是一种新颖的作用于微管蛋白的抗肿瘤化合物,具有良好的药用前景.为了设计出药效更好的类似物,我们用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)对discodermolide及其衍生物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)的研究,并建立了相关的预测模型.其中,CoMFA模型的交叉验证相关系数(q2)为0.592,非交叉验证相关系数(r2)为0.982,标准偏差(SEE)为0.094,F值为119.761;CoMSIA模型的q2为0.544,r2为0.980,SEE为0.098,F值为108.715.计算结果表明,获得的CoMFA和CoMSIA模型具有良好的预测能力,可以应用于指导该类化合物的设计.
- 张伟李婕李艳妮
- 关键词:DISCODERMOLIDE三维定量构效关系微管蛋白
- 1,2-萘醌类化合物抑制PTP1B的三维定量构效关系研究被引量:4
- 2008年
- 蛋白酪氨酸磷酸酶1B(protein tyrosine phosphatase 1B,PTP-1B)是近年来发现的治疗Ⅱ型糖尿病的新靶点,1,2-萘醌类化合物对PTP-1B有较好的抑制活性,具有良好的药用前景.为了设计出本类化合物抑制效果更好的分子构型,用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)对该类化合物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)的研究,并建立了相关的预测模型.其中,CoMFA模型的交叉验证相关系数(q^2)为0.555,非交叉验证相关系数(r^2)为0.991,标准偏差(SEE)为0.049,F值为564.910.CoMSIA模型的q^2为0.558,r^2为0.991,SEE为0.050,F值为542.773.计算结果表明,获得的CoMFA和CoMSIA模型具有良好的预测能力,可以应用于指导该类化合物的设计.
- 于倩李艳妮葛志强
- 关键词:三维定量构效关系蛋白酪氨酸磷酸酶1B
- 乳酸乳球菌乳亚种YF11的非编码小RNA c263
- 本发明公开了一种乳酸乳球菌乳亚种YF11的非编码小RNA c263,乳酸乳球菌YF11的非编码小RNA c263,其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.1所示;实验结果表明:乳酸乳球菌乳亚种YF11的非编码小RNA ...
- 乔建军宋顺意赵秀丽周丹丹王斌斌财音青格乐李艳妮
- 文献传递
- 多巴胺D1和D5受体的同源模建研究被引量:1
- 2010年
- 多巴胺与其受体组成的多巴胺系统与许多疾病有关,比如帕金森病、精神分裂症等。但是,多巴胺受体的晶体结构一直没有得到解析,给相关疾病的药物开发带来难度。本文采用同源模建的方法,用与D1和D5受体同源性达到34.6%的肾上腺素能受体2vt4作为模板,构建D1和D5受体的三维模型。结果表明:经过优化和动力学模拟,然后用PROCHECK、ERRAT及PROSA程序进行构象和能量的评价,用多巴胺进行对接验证,证明模建的D1受体和D5受体模型是合理的、可靠的。
- 李奎孟戎茜李艳妮
- 关键词:多巴胺D1受体多巴胺D5受体同源模建动力学模拟
- 有机化学课程教学方法探讨——UCLA访学心得被引量:3
- 2018年
- 有机化学是化学、化工、材料、制药等相关专业的基础课,因其内容庞杂、反应众多,学生学起来普遍感到困难和乏味。本文以UCLA的有机化学课程为例,对其先进的教学方法进行了探讨,以期为国内相关课程的教学提供新思路。
- 李艳妮
- 关键词:有机化学教学方法UCLA
- HIV蛋白酶抑制剂——利迪链菌素的分子对接研究
- 用分子对接的方法,对利迪链菌素的抗HIV蛋白酶活性进行了研究. 为了更准确地反映利迪链菌素分子与酶蛋白结合的情况,充分考虑受体活性部位的柔性,采用了FlexX(初步对接)和Flexidock(精确对接)分两步将配体与受体...
- 李金涛李艳妮元英进
- 关键词:分子模拟分子对接氢键作用
- 文献传递
- 液相色谱法测定茶碱中甲酸残留量被引量:4
- 2007年
- 建立了二类溶剂甲酸在茶碱中残留的检测方法。用液相色谱法甲酸残留浓度在考察范围内线性关系良好,回收率99.54%-100.30%。该方法简便准确,重现性好,能够有效地用于茶碱成品中甲酸残留量的测定。
- 任新安李艳妮刘俊爱咸新枝
- 关键词:液相色谱茶碱甲酸
- 分子伴侣HdeA与HdeB的作用机制被引量:4
- 2014年
- 分子伴侣能够与其他蛋白质的不稳定构象相结合并使其稳定.它的功能之一是能够帮助蛋白质进行正确的折叠与组装.最新研究发现,在肠道致病菌的周质空间中存在着酸性条件下能帮助周质蛋白复性的分子伴侣HdeA和HdeB.HdeA在极端酸性的胃部环境中由二聚体迅速解离成具有伴侣活性的单体,HdeA单体能够和变性的底物蛋白结合防止它们酸诱导聚集,从而保护肠道致病菌安全到达肠道.本文对肠道致病菌的耐酸机制进行了总结,最后对HdeA和HdeB作用机制的研究近况进行综述,最后对HdeA和HdeB以后的研究方向进行了展望.
- 于延庆于志超李艳妮
- 关键词:分子伴侣