梁楠松
- 作品数：18 被引量：52H指数：4
- 供职机构：东北林业大学更多>>
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- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 水曲柳FmNAC072基因克隆及表达模式分析被引量：2
- 2019年
- 研究水曲柳FmNAC072基因在非生物胁迫及激素信号诱导下的表达特征,为深入分析FmNAC072基因功能提供参考。以水曲柳叶片为材料,用PCR法克隆目的基因,采用生物信息学软件分析其分子结构特征。通过荧光定量PCR研究FmNAC072基因在低温、盐非生物胁迫及ABA、IAA、GA 3、JA及SA激素诱导下的表达模式,并分析其时空表达特异性。结果表明,水曲柳NAC072基因序列为FmNAC072。该基因全长1011bp,含完整的开放阅读框,编码336个氨基酸。生物信息学分析表明FmNAC072为亲水性稳定蛋白,α-螺旋、延伸链和无规则卷曲分布整个蛋白,亚细胞定位预测在细胞核中,与樟子松的蛋白序列具有很高同源性。非生物胁迫处理及激素诱导下,FmNAC072基因表达量与对照组相比差异显著。时空表达检测中,FmNAC072基因在根表达量最高,5月份FmNAC072基因表达量达峰值。FmNAC072基因参与植物生长发育及逆境胁迫的平衡。
- 刘悦于磊赵兴堂梁楠松詹亚光
- 关键词：水曲柳生物信息学分析基因克隆
- 一种智能化超净工作台
- 本实用新型涉及实验设备领域，公开了一种智能化超净工作台，包括了工作台主体框架、感应式玻璃门、工作台台面，风机过滤系统、操作面板、紫外灭菌灯组件、辅助照明灯、供电插座、组培苗培育系统和组培苗给养系统，通过增加了组培苗培育系...
- 朱珠詹亚光齐凤慧付德山薛文辉何利明黄文功赵兴堂张秋博刘颖梁雪曹羊梁楠松于磊
- 文献传递
- 白桦BpHMGR基因的结构及表达模式分析
- 2016年
- 目的研究白桦Betula platyphylla 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-Co A reductase,Bp HMGR)全长基因结构特征及编码蛋白性质,揭示其节律表达模式以及对外源NO信号分子的响应机制。方法通过RACE技术克隆白桦Bp HMGR基因,应用生物信息学软件对Bp HMGR及其编码蛋白进行详细分析,利用实时荧光定量PCR定量分析Bp HMGR基因在昼夜节律变化中的表达模式。根据Bp HMGR氨基酸序列构建系统进化树,分析昼夜节律以及外源NO对白桦叶片中Bp HMGR转录水平的影响。结果 Bp HMGR基因全长1 764 bp,包含完整开放阅读框,已上传至NCBI,并获得登录号KJ452334,其编码蛋白由587 aa组成。白桦Bp HMGR基因与大豆(XP_003519474.1)、葡萄(XP_002275827.1)、苜蓿(XP_003617066.1)亲缘关系较近。结论 Bp HMGR随昼夜周期变化呈现出节律表达特性,在夜晚21:00时达到峰值。初步揭示了外源NO能诱导白桦细胞内三萜代谢途径的关键酶Bp HMGR基因上调表达,进而促进三萜产物齐墩果酸的合成。
- 李思达梁楠松周姗詹亚光曾凡锁
- 关键词：白桦生物节律一氧化氮生物信息学分析
- 水曲柳FmPLT基因家族的鉴定及表达分析被引量：1
- 2022年
- 【目的】PLT转录因子家族能够参与植物的再生过程,并且在植物的生长发育及器官建成中发挥着重要作用,本研究旨在探究PLT转录因子在水曲柳生长发育及非生物胁迫中发挥的作用,以期为林木优良基因选育工作提供更多思路。【方法】通过同源序列比对和基因克隆等方法对FmPLTs家族的成员进行鉴定及分析,之后对FmPLTs成员进行了详细的生物信息学分析,包括理化性质、系统进化关系和基因结构等;并进一步分析了FmPLTs成员在不同组织及种子萌发过程中的基因表达特征,以及其在非生物胁迫(氯化钠、聚乙二醇6000、碳酸氢钠和低温4℃)和植物激素处理脱落酸、赤霉素、生长素、水杨酸和茉莉酸甲酯下的诱导表达情况。【结果】水曲柳基因组中含有9个PLT基因家族成员,分别命名为FmPLT2、FmPLT3、FmPLT4、FmPLT4A、FmPLT5、FmPLT5A、FmPLT7、FmPLT8和FmPLT9。系统进化关系将其分为5组;其在根中表达量最高,在叶中表达量最低;在种子萌发第4天子叶变绿,下胚轴伸长,此时FmPLTs成员的表达量出现峰值;而在不同激素及非生物胁迫条件下,FmPLTs对低温、干旱、盐胁迫以及MeJA的处理响应明显。【结论】FmPLTs参与水曲柳种子萌发及器官发育,并能响应植物激素信号,同时积极参与植物非生物胁迫耐受性的调控,包括低温、高盐和干旱胁迫等;本研究初步揭示了水曲柳FmPLT家族成员响应植物激素和非生物胁迫的表达模式,同时为深入分析FmPLT基因家族基本功能及其调控机制奠定了基础。
- 宋婷婷梁楠松吕义品崔靖弘于磊赵福江徐亮詹亚光
- 关键词：水曲柳基因家族
- 硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析被引量：2
- 2013年
- 利用Tvl—copia类逆转座子逆转录酶（RT）的保守区域设计引物，优化了扩增条件后利用RT—PCR从白桦愈伤组织中得到了1条逆转录酶序列。利用硝普钠（SNP）和茉莉酸甲酯（MeJA）诱导后分别扩增克隆了11条和9条逆转录酶序列。这2l条逆转录酶序列（命名Bprtl-21）变化范围为205—290bp，一致性为71．93％，异质性为1．1％。50．9％，翻译成氨基酸的异质性为0～57．1％。经SNP和MeJA处理的样品中，获得的逆转录酶序列基本是分别聚类．初步证明不同的Tvl-copia类逆转座子能够分别响应不同的信号而被转录激活。分析所获得的21逆转录酶序列和苹果中19务逆转录转座子序列（DQ410748-DQ410766）进化关系发现．逆转录酶基本各自聚类。但是Bprt9、Bprtll和OQ4m750进化关系比较接近，Bprt15、Bprt19、DQ410751和DQ410753聚为一类，证明逆转座子存在水平传递。
- 梁楠松曾凡锁李博郭梁詹亚光
- 关键词：白桦逆转录酶转录活性
- 水曲柳WRKY40基因的克隆及表达模式分析被引量：2
- 2017年
- 从水曲柳中克隆一个WRKY基因,序列比对后命名为Fm WRKY40,基因编码区全长为936 bp,编码331个氨基酸(GenBank登录号:KU928310);含有一个WRKY保守结构域和一个C2H2锌指结构域,属于WRKY家族第Ⅱ类成员;分子进化分析表明,Fm WRKY40与芝麻WRKY40亲缘关系最近,蛋白相似性为73%;qRT-PCR表达模式分析表明:Fm WRKY40在干旱胁迫和ABA(脱落酸)胁迫下明显上调表达,该基因在水曲柳应答干旱和其他非生物胁迫中可能起重要的调控作用。
- 刘颖何利明赵兴堂梁楠松李新宇梁雪詹亚光
- 关键词：水曲柳WRKY转录因子实时荧光定量PCR干旱胁迫脱落酸
- 水曲柳结构域重新甲基化酶DRM基因片段的克隆及同源性分析被引量：1
- 2013年
- [目的]克隆并分析水曲柳结构域重新甲基化酶(DRM)基因片段。[方法]根据GenBank上已发表的DRM氨基酸序列,采取CODEHOP方法设计合成1对简并引物,采用RT-PCR技术对水曲柳DRM基因进行扩增,将PCR产物与pMD 18-T连接后转化至E.coli JM109感受态细胞,检测阳性克隆,测序并进行序列分析。[结果]克隆得到的DRM基因cDNA序列长802 bp,由267个氨基酸残基组成,命名为FmadrmA。序列比对表明FmadrmA与参考的12个物种的DRM在氨基酸水平上表现出较高的同源性,其与山葡萄、番茄、黄瓜、野草莓、大豆、苜蓿、玉米、烟草、拟南芥、毛果杨、水稻和乌拉尔图小麦的DRM同源性分别为61%、54%、51%、50%、60%、48%、43%、44%、37%、42%、42%和39%。系统进化树分析表明同源的DRM蛋白可大致聚为3类,而水曲柳与其他植物的亲缘关系较远。[结论]该试验成功获得了水曲柳FmadrmA基因片段,并对其进行了同源性分析,为进一步研究结构域重新甲基化酶基因及分析其表达特性奠定了基础。
- 曾凡锁梁楠松王璇詹亚光
- 关键词：水曲柳
- 小黑杨bHLH转录因子基因的克隆及遗传转化
- 本研究以小黑杨为实验材料，对小黑杨中2个bHLH转录因子家族的基因以及启动子进行了克隆，并分别命名为PxbHLH01和PxbHLH02。并对获得的基因编码区核苷酸序列，推定的氨基酸序列以及编码蛋白，和获得的启动子区序列进...
- 梁楠松
- 关键词：小黑杨基因克隆
- 水曲柳TCP4转录因子克隆及胁迫和激素下的表达分析被引量：20
- 2017年
- TCP转录因子家族是植物特异的一类调控生长发育和逆境胁迫的重要转录因子。本文揭示了水曲柳FmTCP4在非生物胁迫及激素信号诱导调控的表达特征,为该基因在水曲柳中调控生长发育以及逆境胁迫响应功能的研究奠定基础。通过前期研究克隆获得了水曲柳TCP4基因序列,并命名为FmTCP4,应用生物信息学软件对水曲柳FmTCP4基因的分子结构特征进行了分析,利用4℃低温、盐(Na Cl)以及干旱(PEG6000)进行非生物胁迫处理,利用脱落酸(ABA)和赤霉素(GA3)进行激素信号诱导,分析FmTCP4基因的表达特征。生物信息学分析表明该基因全长1 251 bp,具有完整的开放阅读框,编码416个氨基酸。FmTCP4具有螺旋-环-螺旋结构,为亲水性的不稳定蛋白,不存在信号肽,具有跨膜能力,亚细胞定位预测存在于细胞核中,并在细胞质到细胞核的调控中起作用。同源序列比对结果表明,FmTCP4与芝麻、烟草等物种的同源蛋白序列相比具有很高的同源性。非生物胁迫处理后,FmTCP4的表达量随处理时间而改变,但其变化趋势不同,表明FmTCP4明显响应了这3种非生物胁迫。激素信号诱导结果表明,外源植物激素调控了FmTCP4基因的表达,基因表达量相对于对照组具有显著性差异。非生物胁迫和激素信号诱导下的基因表达分析表明,FmTCP4响应了寒冷、盐、干旱等非生物胁迫以及激素信号,说明其参与了植物的生长发育和逆境胁迫的平衡。
- 刘春浩梁楠松于磊赵兴堂刘颖孙爽王紫晴詹亚光
- 关键词：水曲柳生物信息分析
- 水曲柳丙二烯氧化物合成酶基因FmAOS序列与表达模式分析被引量：4
- 2018年
- 茉莉酸(jasmonic acid,JA)作为一种重要的信号分子参与了植物的生长发育过程,JA生物合成途径中的关键酶为丙二烯氧化物合成酶(allene oxide synthase,AOS)。本研究克隆了水曲柳(Fraxinus mandschurica)AOS基因,命名为Fm AOS。生物信息学分析表明该基因全长1 605 bp,具有完整的开放阅读框,编码534个氨基酸。Fm AOS为两性不稳定性蛋白,不存在信号肽,具有跨膜能力,亚细胞定位预测其存在于叶绿体中。三维建模分析表明该蛋白属于混和型。Fm AOS表达模式分析表明,其响应了寒冷、Na Cl、干旱等非生物胁迫及脱落酸(ABA)、赤霉素(GA3)等植物激素信号,但表达模式各不相同,说明Fm AOS参与了植物的生长发育和逆境胁迫的平衡。本文为Fm AOS功能的深入研究提供参考。
- 刘春浩梁楠松于磊于磊曹羊赵兴堂
- 关键词：水曲柳AOS生物信息学分析
