殷豪
- 作品数：10 被引量：73H指数：6
- 供职机构：青岛农业大学园林园艺学院更多>>
- 发文基金：山东省自然科学基金山东省农业良种工程项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 利用高分辨率熔解曲线(HRM)分析梨微卫星标记被引量：10
- 2011年
- 以西洋梨(Pyrus communisL.)‘NainVert’的一个矮生型实生系与‘茌梨’(Pyrus bretschneideri Rehd.)的F1杂交群体为试材,对分别源自梨和苹果基因组的4个微卫星(即SSRs)序列多态性进行了高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析。结果显示,在测试群体中,TsuENH042和Hi15a13存在两种分型,TsuENH081存在3种分型,而Hi08d09只有1种类型。因此,HRM分析技术可以作为筛查果树微卫星标记多态性或对其进行基因分型的有效手段在相关研究中加以应用。
- 殷豪王彩虹田义轲李节法王然戴洪义
- 关键词：微卫星
- 梨果实形状的SSR分子标记被引量：11
- 2010年
- 本研究以‘矮化梨’(Pyrus communis Linn.)×(‘茌梨’(Pyrus bretschneideri Rehd.)+‘新高梨’(Pyruspyrifolia Rehd.))F1代分离群体为试材,用分离群体分组分析法(Bulked Segregant Analysis,BSA)对梨果实形状(圆形/非圆形)进行了SSR标记分析。通过对源自梨和苹果基因组的281对SSR引物的筛选,获得了与梨果实形状相关的SSR标记CH02b10和CH02f06,其圆形/非圆形性状判断的符合率分别为91.67%和96.67%,并将所获得的标记在品种上进行分析。
- 宋伟王彩虹田义轲田伟殷豪
- 关键词：果实形状SSR标记
- 用于苹果枝干轮纹病抗性基因检测的SCAR分子标记方法
- 用于苹果枝干轮纹病抗性基因检测的SCAR分子标记方法，它涉及一种基因分子标记方法。不仅可以用来对亲本材料的抗轮纹病遗传基础进行鉴别，也可以对杂交后代进行早期的选择，从而加速苹果抗轮纹病育种的进程。例如，对本研究的杂交组合...
- 王彩虹田义轲殷豪
- 文献传递
- 苹果内根-贝壳杉烯氧化酶基因的克隆及序列分析被引量：6
- 2011年
- 内根-贝壳杉烯氧化酶(KO)是赤霉素合成代谢的关键酶。以苹果(Malus×domestica Borkh.)品种富士(Fuji)为供试材料,应用同源克隆和RACE方法从其茎尖中克隆到KO的cDNA全长序列,命名为MdKO,GenBank登录号:AY563549,其长度为1 859 bp。MdKO的开放性阅读框(ORF)编码514个氨基酸残基,推断其相对分子量为58.9 ku,等电点为7.63。氨基酸同源性分析表明,MdKO与已报道的其他植物的KO氨基酸序列具有较高的相似性;氨基酸聚类分析表明,苹果和梨首先聚类,其次是葡萄;序列结构分析表明MdKO属于细胞色素超家族P450系,具有细胞色素P450的血红素结构域FXXGXRXCXG和跨膜结构域;亚细胞定位分析发现MdKO可能位于内质网膜上。
- 田伟田义轲王彩虹宋伟李节法殷豪
- 关键词：苹果赤霉素
- 梨茎尖中PpKO基因表达量的实时荧光定量PCR分析被引量：10
- 2012年
- 以黄金梨不同发育时间的新梢茎尖为试材,应用实时荧光定量PCR技术,对18S rRNA、Actin、GAPDH和S19这4个常用内参基因在梨茎尖组织中的表达稳定性进行了评估。GeNorm软件分析显示,它们表达稳定度的平均值(M)依次是0.365,0.392,0.457和0.517,即表达稳定性从高到低的排序是:Actin>18S rRNA>GADPH>S19。选择Actin作为校正内参基因,对处于不同发育时期的新梢茎尖组织中贝壳杉烯氧化酶基因PpKO的表达量进行研究,发现该基因在新梢生长过程中出现2次表达高峰,基本与春梢、秋梢的快速生长期吻合,且秋梢中的表达量远高于春梢。
- 田义轲李节法王彩虹殷豪白牡丹
- 关键词：内参基因
- 梨果实褐皮性状的SSR标记被引量：16
- 2010年
- 以梨品种‘黄金’(Pyrus pyrifolia Nakai‘Whangkeumbae’)与‘砀山酥’(Pyrus bretschneideri Rehd.‘Dangshansu’)的F1代杂交分离群体为试材,用分离群体分组分析法(Bulked Segregant Analysis,BSA)对果实褐皮性状进行了SSR分子标记研究。通过对源自梨和苹果基因组的281对SSR引物的筛选,获得了与梨果实褐皮性状相连锁的SSR标记CH01c06和Hi20b03,遗传连锁距离分别为4.8cM和12.0cM,据此,将控制该性状的基因定位在梨公共遗传图谱的LG8上。
- 宋伟王彩虹田义轲田伟殷豪
- 关键词：SSR标记基因定位
- 基于梨贝壳杉烯氧化酶基因PpKO序列的功能性SNP标记被引量：6
- 2012年
- 基于基因序列的功能性标记是基因分型、图谱定位和相关性状标记辅助选择的理想标记。以'矮生梨'×'茌梨'的梨杂交分离群体和9个梨栽培品种为试材,以梨赤霉素合成代谢途径的关键酶基因--贝壳杉烯氧化酶基因(PpKO)的cDNA序列为基础,设计5对PCR引物,通过高通量熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析,筛选到可对基因进行良好分型的1对引物。通过对杂种后代和测试品种的测序分析表明,此对引物的扩增子是一个位于PpKO第8外显子上的长度为200bp的序列,从中共检测到两处单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)变化,且均为非同义cSNP。这两处SNP标记均可以作为适合高通量分析的遗传标记在遗传作图、基因定位或资源鉴定中加以利用。
- 田义轲王彩虹白牡丹殷豪李节法
- 关键词：单核苷酸多态性
- 梨贝壳杉烯氧化酶基因PpKO的克隆及生物信息学分析被引量：24
- 2010年
- 以黄金梨(Pyrus pyrifolia Nakai)茎尖为试材,应用同源克隆和RACE方法从梨茎尖中克隆到赤霉素合成代谢的关键酶:内根-贝壳杉烯氧化酶(KO)基因cDNA的全长序列,命名为PpKO,GenBank登录号为:HM003112,其长度为1752bp。PpKO的开放阅读框(ORF)编码515个氨基酸,相对分子量为59.007kD,等电点为7.19。氨基酸同源性分析表明,PpKO与已报道的其它植物的KO氨基酸序列具有59.4%～95.9%相似性;氨基酸聚类分析表明,梨和苹果首先聚类,其次是草莓;生物信息学分析表明:PpKO含有细胞色素P450核心功能域FXXGXRXCXG和氨基端的跨膜结构域。
- 李节法田义轲王彩虹田伟宋伟殷豪
- 关键词：生物信息学分析
- 苹果不同HRM反应体系分析效果评价被引量：6
- 2012年
- 高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析是一种新型的DNA多态性快速筛查技术。本研究以苹果品种"富士"和"舞姿"为试材,用来自苹果基因组的SSR标记CH03d11对不同反应体积、不同DNA浓度以及不同PCR退火程序下的HRM分型效果进行了测试与评估。结果表明:采用5μL反应体积可以获得与10μL或20μL反应体积相同的检测效果。在5μL反应体积中,DNA浓度小到0.25ng/μL时,PCR扩增及随后的HRM分析效果依然良好。另外,研究表明,采用降落PCR扩增模式也能取得良好的HRM多态性检测结果。
- 白牡丹王彩虹殷豪田义轲李节法
- 关键词：HRM降落PCR
- 苹果枝干轮纹病抗病性状分子标记及几丁质酶基因克隆研究
- 苹果(MalusdomesticaBorkh.)枝干轮纹病是目前我国苹果生产上危害严重、发生普遍的病害之一，在我国北方苹果产区，特别是山东地区普遍发生，并有逐渐加重的趋势。传统的杂交育种方法，周期较长，然而，通过DNA分...
- 殷豪
- 关键词：苹果枝干轮纹病SSR标记几丁质酶基因
