王瑞
- 作品数：9 被引量：3H指数：1
- 供职机构：兰州大学第二医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金甘肃省科技计划项目甘肃省科技重大专项计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- BAIAP2L2在肝癌中的表达及临床意义
- 2022年
- 脑特异性血管生成抑制剂1相关蛋白2样2(brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2-like 2,BAIAP2L2)是一种上皮特异性BAR结构域蛋白,近年来被发现在多种肿瘤中高表达,然而在肝癌中的角色尚不清楚。本文通过生物信息学方法,探讨了BAIAP2L2在肝癌中的表达、生物学意义及潜在的临床应用价值,旨在为BAIAP2L2作为肝癌的新型标志物提供理论依据。文中首先从TCGA和ICGC数据库下载肝癌m RNA-seq、mi RNA-seq、DNA甲基化数据及临床病理资料,从HPA数据库获取蛋白质表达数据,以比较癌组织和癌旁组织中BAIAP2L2的表达差异,分析BAIAP2L2表达与肝癌临床病理特征的关系。随后,采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估BAIAP2L2表达水平在肝癌诊断中的性能,通过绘制生存曲线比较不同BAIAP2L2表达组患者的生存差异,并利用Cox回归计算风险比(hazard ratio,HR)。最后,利用mi RWalk数据库预测BAIAP2L2的潜在调控因子,采用TIMER数据库分析BAIAP2L2表达与肝癌组织中浸润免疫细胞的相关性,借助基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探讨BAIAP2L2涉及的功能通路。结果显示:BAIAP2L2在肝癌组织中的表达水平显著高于癌旁组织(P<0.001),对肝癌具有较好的诊断价值(AUC=0.891,P<0.001),且BAIAP2L2的表达水平与患者性别、T分期、甲胎蛋白(alpha fetoprotein,AFP)、临床分期和存活状态均显著相关(P<0.05);BAIAP2L2高表达患者预后更差(P<0.05),且BAIAP2L2是肝癌患者独立预后的危险因素(HR:1.522,95%CI:1.044~2.219,P<0.05);BAIAP2L2甲基化与其表达水平呈显著负相关(P<0.001),且BAIAP2L2低甲基化患者的预后更差(P<0.05);hsa-miR-99a-3p是一个可以调控BAIAP2L2表达的因子;BAIAP2L2表达与肝癌组织中B细胞、CD4~+T细胞、CD8~+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突细胞的浸润水平均显著相关(P<0.05);BAIAP2L2在肝癌中参与调节细胞周期、p53信号�
- 屈才浩马腾达王瑞李晓梅李玉民
- 关键词：肝癌预后
- 基于生物信息学分析GLIS3在胃癌中表达与免疫浸润的临床意义
- 2022年
- 目的研究GLIS3在胃癌中的表达与预后价值,探索GLIS3在胃癌中免疫细胞浸润情况及其参与的生物学功能。方法从TCGA数据库中下载胃癌患者GLIS3基因表达谱数据及临床病理信息,比较胃癌组织和癌旁组织中GLIS3的表达差异,分析GLIS3表达与胃癌患者临床病理特征的关系。利用Kaplan-Meier法和Cox回归分析GLIS3表达与胃癌患者临床预后相关性。运用miRWALK、TargetScan及TCGA数据库,预测调控GLIS3异常表达的miRNA。利用GSEA富集分析预测GLIS3在胃癌中可能参与的信号通路。使用TIMER2.0分析GLIS3表达与免疫细胞浸润之间的关系。结果GLIS3在胃癌组织中表达明显上调,且GLIS3的表达与肿瘤组织学分级相关(P<0.05)。生存分析显示GLIS3高表达患者比低表达患者预后更差,差异有统计学意义(P<0.05),是胃癌的独立预后因素(HR=1.288,95%CI:1.004~1.653,P<0.05)。miR-204-5p在胃癌中表达明显下调,且与GLIS3表达负相关(P<0.05)。富集分析结果显示:GLIS3基因主要富集在细胞外基质(ECM)受体相互作用、钙、黏着斑等信号通路。免疫浸润分析结果显示GLIS3表达与CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞相关(P<0.05)。结论GLIS3在胃癌中表达上调,可作为胃癌的诊断和预后的标志物,且与免疫浸润有关。
- 王瑞马腾达屈才浩李玉民
- 关键词：胃癌生物信息学
- 基于生物信息学分析KNG1在胃癌中的表达变化及临床意义
- 2021年
- 目的基于生物信息学,探讨KNG1在胃癌中的表达变化及临床意义。方法利用TCGA数据库分析KNG1在胃癌中的表达及生存差异。采用Cox回归分析影响胃癌患者预后的独立危险因素,进一步纳入多因素Cox回归分析结果,构建胃癌预后列线图。运用miRWalk、TargetScanv7.2及TCGA数据库,预测调控KNG1异常表达的miRNA。通过GSEA富集分析KNG1可能参与的生物学功能。结果KNG1在胃癌组织中表达升高(P<0.01),且高表达的胃癌患者具有更差的预后(P<0.05)。多因素Cox回归分析显示,KNG1 mRNA表达、患病年龄、是否放疗及TNM分期均是影响胃癌预后的独立危险因素(P均<0.05)。纳入上述独立变量绘制的预后列线图对胃癌患者的生存时间具有较好的预测。miR-143-3p在胃癌组织中表达下调(P<0.01),与胃癌中KNG1的表达呈负相关(P<0.01)。GSEA富集分析结果显示,KNG1在胃癌中参与了mRNA分解过程中的调控、组蛋白甲基化及小RNA的产生与RNA沉默等生物学功能。结论KNG1在胃癌中表达上调,且高表达与胃癌患者不良预后相关,其可成为胃癌有前景的诊断指标、治疗靶点及预后标志物。
- 马腾达屈才浩王瑞李晓梅李玉民
- 关键词：胃癌
- 肾移植患者心脏舒张功能与肾功能对比研究
- 王小锋王瑞苗馨元马惠冯国燕
- 测量肾移植患者心功能中的舒张功能，舒张功能的测定是近年来研究的热点，肾移植术后舒张功能的研究较少，尤其是用超声心动图研究的更少。该研究采用的反应舒张功能的参数是近年来较新的的参数，测量方便，准确性及精确性都相对较高。该研...
- 关键词：
- 关键词：肾移植心脏舒张功能肾功能
- MRI和CT细胞外容积对肝纤维化分期诊断价值的Meta分析
- 2023年
- 目的:评价MR-T 1-mapping成像和CT细胞外容积诊断肝纤维化的价值。方法:计算机检索PubMed、Cochrane library、Web of Science、中国知网、维普数据库和万方医学网,查找有关MR及CT的细胞外容积对肝纤维化的诊断性试验,检索时间截止2022年2月。由2位评价员按照纳入与排除标准独立筛选文献、提取资料和评价纳入研究的方法学质量后,采用Meta-Disc 1.4软件进行Meta分析。结果:最终纳入11篇文献,包括968例患者。以肝切除或组织活检病理、磁共振弹性成像(MRE)为金标准。基于MRI的ECV对明显肝纤维化(≥F2)组合并敏感度、特异度及SROC曲线下面积AUC值分别为0.74、0.83、0.9126,对严重肝纤维化(≥F3)组的敏感度、特异度分别为0.79、0.88,对早期肝硬化(F4)组的敏感度、特异度范围分别为0.85~0.87、0.80~0.87;基于CT碘值的ECV-iodine对≥F2、≥F3、F4组的合并敏感度和特异度分别为0.73和0.72、0.70和0.78、0.80和0.68,SROC曲线下面积分别为0.8023、0.8741、0.7465;基于常规CT绝对值的ECV-HU对≥F2、≥F3、F4组的合并敏感度和特异度分别为0.73和0.68、0.71和0.73、0.70和0.70,SROC曲线下面积分别为0.7612、0.7899、0.7680。结论:基于MRI的ECV诊断肝纤维化分期的准确性优于CT,而CT碘值所得ECV-iodine的诊断准确性优于常规CT值所得ECV-HU。
- 杨品姜艳丽邹婕邹婕王瑞张静
- 关键词：细胞外基质
- APT、ASL及DCE-MRI在胶质瘤分级诊断中的应用被引量：2
- 2022年
- 目的:探讨酰胺质子转移成像(APT)、动脉自旋标记技术(ASL)、动态对比增强磁共振成像(DCE-MRI)等多模态MRI技术对胶质瘤术前分级诊断的价值。方法:前瞻性收集41例经病理证实的胶质瘤患者,其中低级别胶质瘤(LGG)18例、高级别胶质瘤(HGG)23例。由2名医生独立测量获取肿瘤实质区的平均APT(mAPT)、平均脑血流量(mCBF)、平均容积转运常数(mK^(trans)),并计算测量者之间的一致性系数(ICC)。采用受试者工作特征曲线比较各参数区分LGG和HGG的诊断效能,并对不同成像技术的AUC进行比较,最后采用二元逻辑回归的方法进行多模态联合评估。结果:测量者之间一致性良好。HGG肿瘤实质区的mAPT、mCBF、mK^(trans)均大于LGG,差异均具有统计学意义(P<0.05)。当独立应用于分级诊断时,mAPT、mCBF、mK^(trans)的AUC分别为0.96、0.91、0.93;mAPT、mCBF、mK^(trans)敏感性分别为0.91、0.91、0.83;mK^(trans)、mAPT、mCBF特异性分别为1.00、0.94、0.83。当联合应用于分级诊断时,3种成像技术联合显示出最佳诊断效能。三者联合的AUC可达1.00,mAPT联合mCBF、mCBF联合mK^(trans)、mAPT联合mK^(trans)的AUC分别为0.99、0.99、0.97;三者联合的敏感性可达1.00,mAPT联合mCBF、mCBF联合mK^(trans)、mAPT联合mK^(trans)的敏感性分别为0.96、0.96、0.91;三者联合的特异性为0.94,其中任意两者联合的特异性均可达1.00。结论:APT、ASL、DCE-MRI这3种技术对胶质瘤术前分级均显示出良好的诊断价值,其中APT诊断效能最好,ASL最差,3种技术的AUC无统计学差异。当联合应用于分级诊断时,可提高鉴别诊断的能力,其中3种技术的联合是强大的胶质瘤分级技术。
- 程秀王俊王瑞刘光耀马来阳白玉萍李洁任新颖张静
- 关键词：胶质瘤动脉自旋标记技术
- Gd-EOB-DTPA增强MRI T1 mapping技术对肝功能评估的诊断价值
- 2023年
- 目的探讨Gd-EOB-DTPA增强MRI T_(1)mapping技术评估肝功能的价值。方法前瞻性搜集42例符合纳入排除标准患者的临床及影像学资料,按照Child-Pugh分级分为3组,Child-Pugh A级(LCA组)23例、Child-Pugh B级(LCB组)13例、Child-Pugh C级(LCC组)6例。测量肝组织增强前T1弛豫时间(T1_(pre))和信号强度(SI)、肝胆期T1弛豫时间(T_(1)HBP)和SI,分别计算增强前及肝胆期的肝脏/竖脊肌SI比值(SI_(pre),SI_(HBP)),计算肝脏T1弛豫时间减低率(△T1%)和相对肝脏强化率(RLE)。比较不同组间SI与T1定量参数间的差异,判断不同参数评估Child-Pugh B+C级的效能。使用Pearson相关分析各参数与吲哚菁绿15分钟滞留率(ICG R15)的相关性。结果T1_(pre)、T1_(HBP)、ΔT1%、SI_(pre)、SI_(HBP)、RLE诊断Child-Pugh B+C级的ROC曲线下面积分别为0.714、0.884、0.914、0.643、0.832、0.834。T1_(HBP)与ICG R15、Child-Pugh分数呈显著正相关(r=0.677,r=0.662,P<0.05)。结论T1_(HBP)与ICG R15、Child-Pugh分数不仅显著正相关,诊断性能优于ΔT1%与SI相关参数,对肝功能评估有重要价值。
- 杨品姜艳丽王鹏飞甘铁军王瑞张静
- 关键词：肝功能
- 帕金森病患者运动网络的频率特异性静息态功能磁共振成像研究被引量：1
- 2023年
- 目的基于静息态功能磁共振成像(resting state functional magnetic resonance imaging,rs-fMRI)系统性探究帕金森病(Parkinson’s disease,PD)患者运动网络的功能连接(functional connectivity,FC)改变,并观察频率特异性FC模式。材料与方法经过严格质控,最终前瞻性纳入28例PD患者与34例性别、年龄、受教育年限匹配的健康对照者。整合来自模板的双侧小脑(Ⅳ~Ⅴ、Ⅵ、Ⅷ小叶)、黑质、基底节(尾状核、壳核、苍白球)、丘脑、运动皮层(中央前回、中央后回、中央旁小叶)共计36个感兴趣区(regions of interest,ROI)组成PD特异性运动网络,使用常规低频(0.01~0.1 Hz)以及slow-3(0.073~0.198 Hz)、slow-4(0.027~0.073 Hz)、slow-5(0.01~0.027 Hz)子频段下的FC分别构建连边。经过基于网络的统计分析,探究频率特异性FC改变模式。使用Spearman偏相关分析观察异常FC与临床运动及认知评分的相关性。结果PD患者在常规低频下展现了广泛的FC减低。在P=0.01的连边阈值与P=0.05的子图阈值下,观察到包含22个ROI和29条连边的子图(P=0.017),其中网络间连接以丘脑-小脑-基底节为著,以及黑质-壳核、中央后回-小脑的连接。网络内连接主要集中于小脑双侧Ⅵ小叶间、双侧壳核间、双侧中央旁小叶与右侧中央后回。在P=0.05的连边与子图阈值下与常规低频对比,slow-4展现了更多的丘脑-基底节的FC改变。slow-5频段的特异连边主要集中在“小脑-黑质-基底节-丘脑”的网络间连接。slow-3频段未发现异常FC。常规低频下,丘脑-苍白球及壳核间FC与统一帕金森病评分量表第三部分(Unified Parkinson’s Disease Rating ScaleⅢ,UPDRS-Ⅲ)呈负相关(P_(corrected)=0.04及P_(corrected)<0.01)。结论PD患者表现了整合运动网络复杂且广泛的FC受损,并且具有频率特异性改变模式。包含“小脑黑质-基底节-丘脑-运动皮层”多环路的脑网络功能异常可能是PD运动障碍的神经病理学机�
- 张鹏飞程秀马来阳王瑞李敏杨婷莉郭睿卿陶家欢刘光耀张静
- 关键词：帕金森病磁共振成像静息态功能磁共振成像频率特异性
