邹枚伶
- 作品数：35 被引量：81H指数：6
- 供职机构：海南大学更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 蓖麻EST资源的SSR信息分析与功能注释被引量：1
- 2012年
- 将NCBI公共数据库62 592条蓖麻EST序列进行拼接,得到无冗余Unigene 11 708条,总长度921 kb。在无冗余序列中发现含有SSR的EST序列2 471条,共3 271个位点。SSR发生频率为27.94%,平均分布距离为2.81 kb。在1～6 bp的重复基元中,单核苷酸重复基元出现频率最高(37.51%),其次是三核苷酸重复基元(34.63%)、二核苷酸重复基元(25.61%)。出现较多的重复基元是A/T(36.32%),其次是AG/CT(18.28%)。蓖麻的EST-SSR出现频率较高、类型较丰富、多态性潜能较高,具有较高的利用价值。对蓖麻的EST-SSR功能注释(COG,SwissProt,KEGG),有9条序列注释到脂肪酸合成与代谢相关的基因,为后续有针对性开发EST-SSR标记提供重要依据,也为进一步开发蓖麻EST-SSR标记奠定基础。
- 邹枚伶夏志强陈俊荣王文泉
- 关键词：蓖麻EST-SSR微卫星
- 一种基于最小熵算法的基因表达网络分析方法
- 本发明提供一种基于最小熵算法的基因表达网络分析方法，包括以下步骤：数据收集及预处理；基因间相关性获取；转换数据格式；基于基因相关性矩阵建立基因表达网络；使用Infomap多级网络聚类模型对基因表达网络进行聚类，利用随机游...
- 夏志强江思容邹枚伶
- 白木香SRAP-PCR反应体系的建立被引量：13
- 2009年
- 本实验对白木香SRAP-PCR反应体系的影响因素(模板DNA,Taq酶,Mg2+,dNTP,引物)在4个水平上进行优化试验,筛选出各反应因素的最佳水平,建立白木香SRAP-PCR反应的最佳体系(20μL):模板DNA50ng、引物0.30μmol/L、Mg2+1.5mmol/L、dNTP0.4mmol/L和Taq DNA聚合酶1.0U。适用于白木香的SRAP-PCR反应体系迄今未见报道,这一优化系统的建立为今后利用SRAP标记技术对白木香进行基础研究提供了一个标准化的程序。
- 邹枚伶夏志强吉家敏陈新王海燕曾长英王文泉
- 关键词：白木香SRAP-PCR反应体系
- 基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性的方法
- 本发明涉及一种基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性的方法，是选取目标物种提取DNA后选择酶切位点进行酶切；设计连接接头、标签，合成带有选择标签的EcoR？I酶切位点接头；分别用EcoR？I与Msp？I、EcoR？...
- 夏志强邹枚伶王文泉
- 文献传递
- 一种用于构建荔枝SNP指纹图谱的SNP位点组合、应用及鉴定方法
- 本发明提供一种用于构建荔枝SNP指纹图谱的SNP位点组合、应用及鉴定方法。所述SNP位点包括位于染色体Chr1～Chr15上的100个SNP位点。本发明提供的SNP位点组合，可用于构建荔枝SNP指纹图谱和荔枝品种的快速鉴...
- 夏志强田阳阳邹枚伶江思容王文泉肖建加
- 一种与荔枝果实直径相关的SNP分子标记及其应用
- 本发明公开了一种与荔枝果实直径相关的SNP分子标记及其应用。本发明通过运用全基因组关联分析的方法，获得了与荔枝果实直径性状相关的SNP分子标记，该SNP分子标记为位于荔枝第3号染色体的内含子区，位置为第Chr3：2515...
- 邹枚伶安鹏良夏志强肖建加王文泉江思容
- 一种用于构建甘蔗DNA指纹图谱的分子标记组合及其应用
- 本发明提供一种用于构建甘蔗DNA指纹图谱的分子标记组合及其应用。以292个甘蔗样本为研究对象，获得100个甘蔗核心SNP/Indel位点，通过遗传算法原理计算其获得的核心SNP/Indel位点，从而获得了相关甘蔗样本的指...
- 夏志强余芬邹枚伶王文泉彭明
- 一种胞嘧啶甲基化挖掘的方法
- 本发明公开了一种胞嘧啶甲基化挖掘的方法，包括步骤：A)、目标数据获得：对同一来源的基因组由HpaII与MspI甲基化敏感酶切后扩增通过高通量测序；B)通过AFSM技术建库：对同一样品构建HpaII与MpaI酶切DNA文库...
- 夏志强邹枚伶王文泉张圣奎冯素彬
- 文献传递
- DNA指纹图谱的构建方法、构建装置及终端设备
- 本申请适用于数据处理技术领域，提供了一种DNA指纹图谱的构建方法、构建装置及终端设备，包括：获取目标物种的M个单碱基多态性位点以及每个单碱基多态性位点上的碱基信息；根据所述每个单碱基多态性位点上的碱基信息，从所述M个单碱...
- 邹枚伶王文泉江思容夏志强张辰笈孙倩
- 文献传递
- 一种全基因组高效基因区富集测序方法
- 本发明提供一种全基因组高效基因区富集测序方法，包括步骤：A）样品进行全基因组DNA的提取；B）全基因组mRNA的提取；C）全基因组mRNA反转录为cDNA；D）全基因组cDNA的碎片化；E）分批回收短序列片段；F）进行单...
- 夏志强邹枚伶王文泉张圣奎冯素彬
- 文献传递
