邹红岩 作品数:140 被引量:398 H指数:10 供职机构: 深圳市血液中心 更多>> 发文基金: 深圳市科技计划项目 广东省医学科学技术研究基金 广东省科技计划工业攻关项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 政治法律 农业科学 更多>>
中国造血干细胞捐献者资料库HLA分型数据质控抽检中错误标本概况及原因分析 目的对中华骨髓库HLA分型数据质控抽检中发现的错误分型情况进行归纳总结,探讨其产生的原因及解决策略。方法采用SSP、SSOP及SBT基因分型方法,对中华骨髓库中随机抽取的5656份标本进行复检。统计采用计数法。结果质控抽... 邹红岩 金士正 周丹 李桢 王大明 程曦 吴国光文献传递 广东汉族HLA-A、C、B、DRB1和DQB1基因的高分辨多态性及连锁不平衡分析 被引量:12 2009年 目的研究广东汉族人群的人类白细胞抗原(HLA)-A、C、B、DRB1和DQB1基因的高分辨多态性和等位基因间的连锁不平衡关系。方法PCR-测序分型方法(sequence-based typing,SBT)对144名随机广东汉族造血干细胞捐献者的HLA-A、C、B、DRB1和DQB1基因进行序列分析,并采用PyPop软件计算等位基因频率、单体型频率和连锁不平衡参数。结果发现1个新等位基因HLA-Cw*0340;HLA-Ⅰ类基因中,A、C、B基因座分别检出27、24和54个等位基因,其中频率>0.05常见等位基因包括A*1101、A*2402、A*0207、A*0201、A*3303、A*0203、Cw*0102、Cw*0702、Cw*0304、Cw*0801、Cw*0302、B*4601、B*4001、B*1301、B*5801和B*1502;HLA-Ⅱ类基因中,总共观察到30个DRB1和15个DQB1等位基因,频率>0.05的常见等位基因见于DRB1*0901、DRB1*0301、DRB1*1501、DRB1*1202、DRB1*0803、DRB1*1101、DRB1*1602,DQB1*0303、DQB1*0301、DQB1*0502、DQB1*0601、DQB1*0201、DQB1*0302和DQB1*0501;除A-DQB1最常见单体型为A*1101-DQB1*0301外,其它所有两座位单倍型以及A-C-B、A-B-DRB1和A-C-B-DRB1-DQB1扩展单体型的最常见型均由A*0207、Cw*0102、B*4601、DRB1*0901和DQB1*0303组合而成。任意2个HLA基因间均具有强的连锁不平衡,而21.99%—31.63%的有价值连锁不平衡单倍型具有统计学意义(χ2>3.84,P<0.05),其中频率≥0.01的有156条。结论获得了广东汉族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1基因的等位基因和单体型多态性及连锁不平衡分析数据,为HLA基因的相关研究和应用提供了更加详细的参考资料。 朱为刚 金士正 邹红岩 李桢 蓝欲晓 鲍自谦 王大明 程曦 程良红关键词:HLA等位基因 汉族 慢性乙型肝炎患者外周血中树突状细胞的分离、纯化与扩增 2007年 目的探讨从慢性乙型肝炎(CHB)患者外周血中分离、纯化与扩增树突状细胞(DC)的有效方法。方法分别从健康自愿者(10例,对照组)和CHB患者(10例,实验组)外周血中分离出单核细胞(Mo),然后将实验组的Mo与GM-CSF、IL-4共同培养,于倒置显微镜下观察计数细胞,以流式细胞仪检测培养前、后的DC数量及其表面CD40、CD80、CD86和MHC-DR的表达水平,并与对照组比较。结果与对照组相比,实验组DC表面CD40、CD80、CD86和MHC-DR表达水平较低(P<0.01);经GM-CSF、IL-4联合培养5d后,其Mo中的DC数较培养前明显增多(P<0.01),且DC表面CD40、CD80、CD86和MHC-DR表达水平较培养前明显增高(P<0.01),与对照组相比则无明显差异(P>0.05)。结论GM-CSF、IL-4联合应用能有效地从CHB患者外周血中制备出大量具有功能活性的DC。 陈月 马云 邹红岩 陈洪涛关键词:慢性乙型肝炎 树突状细胞 细胞因子 CD分子 HLA测序分型中模棱两可结果的分析及其解决策略 被引量:7 2015年 目的探讨无关供-受者器官移植人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)高分辨分型确认实验中,HLA测序分型模棱两可结果的种类、比例及高效解决方法。方法采用美国Atria公司的HLA测序分型试剂盒,对650人份无关供一受者样本的HLA-A、B、C基因第2、3和4外显子,HLA-DRB1第2外显子及HLA—DQB1第2、3外显子进行常规检测,统计常见模棱两可等位基因种类及比例,再应用PCR-序列特异性引物(squeneespecificprimer,PCRSSP)高分辨试剂盒或增加常规检测区外的外显子进行再测序分型(sequencing—basedtyping,SBT),以获得精确的HLA高分辨分型结果。结果650人份供-受者的HLA-A、B、C、DRB1及DQ引基因的直接测序分型出现模棱两可比例分别为76.31%(496/650),91.08%(592/650),97.69%(635/650),88.62%(576/650)和43.38%(141/650)。共发现常规检测区内模棱两可等位基因型组合36种,常规检测区外模棱两可等位基因组合22种。依据中国常见及确认的(common and well-documented,CWD)HLA等位基因表(1.01版),排除罕见等位基因后,共有9种模棱两可CWD组合,除了HLA—B、C位点包括等3种外,其余的3个位点各出现1种;检测区外模棱两可等位基因组合减少为10种,其中HLAA、B位点各1种,HLA-C、-DRB1位点各4种。所有模棱两可结果采用高分辨PCR—SSP或PCR—SBT方法进行必要的复核确认。结论分析了HLA5个位点测序分型中模棱两可结果的常见种类,采用相应的解决策略,可以达到高效、低耗、精确分型的目的。 王大明 何柳媚 邹红岩 高素青 邓志辉关键词:人类白细胞抗原 测序分型 HLA全长序列测定及测序分型试剂的研制和应用 邓志辉 徐筠娉 杨宝成 喻琼 王大明 邹红岩 高素青 曾健强 何柳媚 金士正 程良红 李桢 魏天莉 人类白细胞抗原(HLA)为人类主要组织相容性系统,具有高度的分子遗传多态性、种族特性、单倍体连锁遗传和连锁不平衡等特点。PCR-SBT技术为全球公认的HLA基因分型“金标准”,然而,国内使用的HLA测序分型试剂尚依赖于国...关键词:关键词:试剂盒 人类白细胞抗原 测序分型 HLA-B*2736等位基因的序列分析 被引量:3 2007年 使用FLOW-SSO、PCR-SSP以及测序等分型技术,发现一个与HLA-B*270401基因相关的未知基因。设计基因特异性引物单独扩增B*27基因的外显子2-5,包括内含子2-4,并进行双向测序,分析与B*270401基因序列的差异。该基因的扩增产物为1815bp。与B*270401相比在外显子3和4共有10个碱基的改变,从而使相应氨基酸发生错义或同义突变。碱基634A→C(密码子130丝氨酸→精氨酸);670A→T(密码子142苏氨酸→丝氨酸);683G→T(密码子146色氨酸→亮氨酸);698A→T(密码子151谷氨酸→缬氨酸);774G→C(密码子176谷氨酸→天冬氨酸);776C→A(密码子177苏氨酸→赖氨酸);781C→G(密码子179谷氨酰胺→谷氨酸);789G→T(密码子181丙氨酸同义突变);1438C→T(密码子206甘氨酸同义突变);1449G→C(密码子210甘氨酸→丙氨酸)。在IMGT/HLA数据库中B*27组只有3个基因(B*270502/2706/2732)提交了内含子序列。该未知基因的内含子2序列与B*2706相同,显示了与B*27组基因的同源性,但其同源性在内含子3、4均未得到支持,与B*27组基因相比,内含子3的第106个碱基C→G,碱基168缺失,碱基179G→A,碱基536G→A;内含子4中碱基82T→C。但其内含子3、4序列却与B*070201完全相同。该基因序列已提交GenBank,编号为被DQ915176,被WHO确认为HLA-B*2736等位基因。 李桢 邹红岩 邵超鹏 唐斯 王大明 程良红关键词:人类白细胞抗原 基因 外显子 内含子 第2代测序技术鉴定人类白细胞抗原等位基因A^*24:353及基因频率分析 被引量:1 2021年 背景:人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)高分辨确认工作是造血干细胞移植前必不可少的步骤之一,随着工作的不断深入开展及被检测人群的持续增加,人类白细胞抗原新等位基因不断涌现。有些新基因由于发现较晚,相关报道较少,导致基因频率不能准确计算,在缺乏相应数据的情况下,容易造成分型结果的误判,导致配型不相合结果,影响移植配型成功率。目的:对HLA一个等位基因HLA-A*24:353进行检测确认,并对其出现频率进行分析。方法:应用聚合酶链反应-直接测序分型方法对2019年9月至2020年5月间543例临床移植配型供受者进行HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1五个位点检测,再用第2代测序技术对HLA-A*24:02/24:353模棱两可结果进行全长序列测定,得到HLA高分辨分型结果,并计算HLA-A*24:353基因出现频率。结果与结论:检出HLA-A*24:02/24:353模棱两可结果146例,采用第2代测序技术进一步鉴定后,检出HLA-A*24:353基因5例,占A*24组的比例为3.42%,在543例检测人群中出现比例为0.92%。结果提示HLA-A*24:353在中国可能并不罕见,进行临床移植配型供受者高分辨分型时,当出现HLA-A*24:02/24:353模棱两可结果时,需做进一步确认,以增加分型结果的准确性,提高移植配型的成功率。 何柳媚 陈浩 钟艳平 全湛柔 邹红岩关键词:造血干细胞 人类白细胞抗原 等位基因 移植配型 血液 6965名汉族骨髓供者HLA多态性分析 被引量:102 2004年 目的 分析中国汉族骨髓供者的人类白细胞抗原 (HLA)多态性 ,并寻找和鉴定新的HLA等位基因。方法 采用序列特异性引物聚合酶链反应、DNA测序技术以及分子克隆等以DNA为基础的HLA基因分型技术。结果 共鉴定 6 96 5人份无关汉族骨髓供者的HLA A、B、DRB1座位上的等位基因 ,其中 4 70 7人份为南方汉族个体 ,2 2 5 8人份为北方汉族个体。在受检群体中共检出 72种HLA特异性 ,包括过去很少在汉族人群中被检测到的HLA A2 5、A34、A74、B4 1、B4 2、B5 3、B73、B81等。HLA A、B、DRB1座位上尚未被检测出的空白基因频率分别小于 0 .2 0 % ,0 .2 5 %和 0 .70 %。发现 3个新等位基因 ,已被WHO命名为HLA A 0 2 5 3N ,HLA A 1114和HLA B 5 6 10。结论 在骨髓供者HLA分型中使用以DNA为基础的基因分型技术 ,可以得到精确可靠的基因频率以及发现新的等位基因。一些HLA基因在南北汉族人群中的分布有明显的差异 ,为了能最大限度地募集到带有不同HLA分型的骨髓供者 。 吴国光 邓志辉 高素青 程良红 金士正 周丹 李桢 邹红岩 张旋 魏天莉 程曦 王大明关键词:骨髓 组织相容性试验 等位基因 基因频率 南北方汉族人群HLA-Cω位点基因多态性的对比研究 目的发现HLA-Cw,等位基因在中国南北方汉族人群中的分布规律。方法所有标本均采用顺序特异性引物 PCR扩增(PCR-SSP)方法进行HLA-Cw点低分辨和高分辨分型。结果在68例南方及66例北方汉族人群中, 均检出10... 周丹 邹红岩 李桢 金士正 王大明文献传递 4例人类白细胞抗原罕见等位基因的结果分析 被引量:3 2013年 背景:虽然国内与国外关于新等位基因的报道较多,但是,因某些等位基因首次发现较晚,而后却再次被检测到,并且等位基因频率很低,此类相关文章报道甚少,这些等位基因往往被忽视。目的:检测与确认4例临床移植配型供受者携带的罕见等位基因。方法:采用快速DNA提取试剂盒从全血样本中提取基因组DNA,经人类白细胞抗原基因商品化测序分型试剂盒检测和SSP高分辨试剂盒验证,得到人类白细胞抗原高分辨分型结果。结果与结论:被检测到的4个罕见等位基因分别为B*27:15、B*51:39、C*07:66和C*08:22。对于以上4个等位基因虽被美国骨髓库列为罕见等位基因,但在中国可能并不罕见。事实证明,被美国骨髓库列为罕见等位基因的C*08:22为中国汉族人群常见等位基因。 王大明 何柳媚 邹红岩 高素青关键词:器官移植 人类白细胞抗原 测序分型 基因组DNA SSP