钟东
- 作品数：13 被引量：42H指数：4
- 供职机构：中国人民解放军第一军医大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术农业科学更多>>
- 论大肠肿瘤粪便基因检测方法
- 1996年
- 论大肠肿瘤粪便基因检测方法第一军医大学南方医院消化病研究所（广州５１０５１５）季代金，钟东第一军医大学政治教研室（广州５１０５１５）张小远，雷国学大肠肿瘤发病率近年来有上升趋势，死亡率较高。大肠癌起病多隐匿，早期几无典型的临床表现，因此，生存率的提高...
- 季代金钟东张小远雷国学
- 关键词：大肠肿瘤粪便检查基因检查
- 人源性大肠癌cDNA噬菌体表达文库的构建及鉴定被引量：6
- 2003年
- 目的 构建人源性大肠癌cDNA噬菌体表达文库。方法 从人大肠癌组织中提取总RNA ,RT PCR反转录合成cDNA第 1链 ,用长距离PCR技术合成cDNA第 2链 ,除去小于 5 0 0bp的小片段后与λTriplEx2噬菌体连接 ,体外包装 ,构建成cDNA噬菌体表达文库。转染E .coliXL1 Blue大肠杆菌 ,滴定文库的滴度 ,确定文库容量大小 ,测定重组率。用EXTagTM酶做PCR和SfiⅠ酶切鉴定插入的cDNA片段大小。结果 构建成含 2 .39× 10 6pfu/ml重组子的人大肠癌cDNA噬菌体表达文库 ,重组率为 97.5 %。插入的外源cDNA片段大小为 5 0 0bp～ 4kb ,平均长约 1.4kb。 结论 成功构建高质量人源性大肠癌cDNA噬菌体表达文库 ,适合于免疫筛选cDNA克隆的人大肠癌相关抗原基因。
- 刘宇虎张振书肖冰钟东武金宝王亚东赖卓胜张亚历
- 关键词：CDNA噬菌体
- 人源性大肠癌抗原基因的SEREX筛选被引量：4
- 2003年
- 目的:寻找人源性大肠癌相关抗原基因.方法:构建3个以入Tripl Ex2噬菌体作载体的大肠癌抗原cDNA表达文库,用自体或异体大肠癌患者血清应用SEREX方法进行免疫筛选.用平板法扩增阳性克隆噬菌体,提取纯化DNA,用SfiI酶切和PCR鉴定插入片段的大小.结果:构建成3个大肠癌抗原cDNA噬菌体表达文库,滴度分别为2.39×106nfu/L,2.07×106nfu/L和1.86×106nfu/L,插入片段长度为0.5-4kb,平均分别为1.4kb,1.6kb和1.3kb.筛选发现4个阳性克隆,插入cDNA片段大小分别为2.4 kb,1.8 kb,2.3 kb和2.2 kb.结论:用SEREX方法筛选大肠癌抗原cDNA表达文库,可获得有价值的大肠癌的重组抗原基因克隆,将有利于大肠癌的早期诊断和重组疫苗的研究.
- 刘宇虎张振书钟东武金宝但汉雷赖卓胜王亚东张亚历肖冰
- 关键词：SEREX大肠癌免疫筛选
- 62种细菌基因组中密码子碱基位置上碱基分布的差异性及相关性被引量：4
- 2003年
- 应用生物信息学方法 ,对已完成测序的 6 2种细菌基因组进行 :1 同一密码子碱基位置上不同碱基分布频率的比较 ;2 不同密码子碱基位置上同一碱基分布频率的比较。结果显示 :1 三个密码子碱基位置上及四种碱基的分布频率差异存在显著性 ;2 三个密码子碱基位置上的四种碱基的分布频率显著相关。结论提示 ,在细菌的进化过程中 ,任一密码子碱基位置上任一碱基的分布有可能受到所处密码子碱基位置及其他三种碱基分布的影响。
- 钟东赵贵军刘宇虎杨兴龙徐安龙张振书
- 关键词：细菌基因组碱基分布
- 初步建立真核基因调控元件模块的搜索方法被引量：1
- 2004年
- 依据基因调控知识对现有方法进行了综合及改进:(1)在序列搜索方面,结合多序列低分值查询与多个保守片段搜索两种方法获得匹配序列,然后序列相互打分,最后进行聚类分析;(2)在位点搜索方面,综合应用位置权重矩阵、成对寡核苷酸及Smith-Waterman等方法;(3)在分析系统方面,采用面向对象的程序设计方法建立跨平台、可扩展、基于数据库的分析系统。本方法对MHC基因家族的初步分析结果表明,能较准确地找到一些基因调控元件模块所在的区域。
- 钟东张振书刘宇虎郑国清刘小意卢阳赵贵军徐安龙
- 关键词：真核基因基因调控搜索方法数据库
- 基因组内碱基分布整体均衡与局部不均衡的研究进展被引量：17
- 2002年
- 近年来 ,随着各种基因组计划的相继完成 ,发现在各种生物体单核苷酸链水平上存在着A≌T ,G≌C的数量关系 ,但从几千个至十几万个碱基的范围来看 ,A≠T ,G≠C。从数学上可以证明 ,如果DNA双链之间碱基的突变率一致 ,则A≌T ,G≌C成立 ,但很多实验表明 ,双链之间的突变率并不一致 ,因此这个问题的解决仍有赖于数理科学和生物学的进一步结合。
- 钟东赵贵军张振书徐安龙
- 关键词：基因组碱基分布生物信息学
- 76种细菌DNA双链碱基使用频率的比较及其意义被引量：2
- 2003年
- 应用生物信息学方法 ,对已完成测序的 76种细菌基因组进行比较 ,分析细菌基因组中编码区及密码子上碱基使用频率情况。结果显示 :1 先导链与滞后链上在编码区的碱基使用频率无明显差异且显著正相关。 2 先导链与滞后链在第一、第二、第三密码子碱基使用频率基本一致且显著正相关。结果表明 ,选择压力及自然突变对DNA双链总体碱基分布的影响相等。
- 钟东赵贵军张振书林蒋海秦棠妮徐安龙
- 关键词：细菌比较基因组学生物信息学
- 大肠癌抗原cDNA噬菌体表达库的构建及鉴定
- 2003年
- 目的 :构建人源性大肠癌抗原cDNA噬菌体表达文库 .方法 :从人大肠癌组织中提取总RNA ,纯化mRNA ,用RT PCR反转录合成cDNA第一链 ,用LD PCR合成cDNA第二链 ,除去小于 5 0 0bp的小片段 ,与去磷酸化的λTriplEx2噬菌体连接 ,体外包装 .转染E .coliXL1 Blue大肠杆菌 ,滴定文库的滴度 ,确定文库容量大小 ,用ITPG和X gal测定重组率 .用SfiⅠ酶切鉴定插入的cDNA片段大小 .结果 :构建成含 2 .39× 10 6重组子的人大肠癌抗原cDNA噬菌体表达文库 ,重组率为 97.5 % ,插入外源cDNA片段大小范围从 1～ 4kb ,平均长约 2 .4kb .结论 :成功构建人大肠癌抗原cDNA噬菌体表达文库 。
- 刘宇虎张振书钟东武金宝王亚东赖卓胜肖冰周殿元
- 关键词：结肠直肠肿瘤噬菌体CDNA文库
- 人源性大肠癌cDNA噬菌体库的构建及PCR鉴定被引量：4
- 2003年
- 为构建人源性大肠癌cDNA噬菌体表达文库 ,从人大肠癌组织中提取总RNA ,纯化mRNA ,用RT PCR反转录合成cDNA第一链 ,用LD PCR合成cDNA第二链 ,除去小于 5 0 0bp的小片段 ,与λTriplEx2噬菌体连接 ,体外包装。转化E .coliXL1 blue大肠杆菌 ,滴定文库的滴度 ,用IPTG和X gal测定重组率。用PCR鉴定插入cDNA片段大小。构建成含 2 .0 7× 10 6 pfu/ml重组子的人大肠癌cDNA噬菌体表达文库 ,重组率为 94.5 % ,插入外源cDNA片段大小从 60 0bp～ 4kb ,平均约 1.4kb。文库合符要求 。
- 刘宇虎张振书武金宝钟东崔海宏王亚东
- 关键词：结肠直肠肿瘤噬菌体CDNA文库
- 人源性大肠癌抗原基因噬菌体表达文库的构建及鉴定被引量：7
- 2003年
- 目的构建人源性大肠癌抗原基因cDNA噬菌体表达文库.方法从人大肠癌组织中提取总RNA,用RT-PCR合成cDNA第1链,用LD-PCR合成cDNA第2链,除去小于500p的小片段,与去磷酸化的λTriplEx2噬菌体左、右臂连接,体外包装,构建成cDNA噬菌体表达文库.转化E.coli XL1-B1ue感受态细胞,滴定文库的滴度,确定文库容量大小;用ITPG诱导和X-gal显色测定重组率;用Sfi Ⅰ酶切鉴定插入的cDNA片段大小.结果构建成含2.39×106pfu/ml重组噬菌体的人大肠癌抗原基因cDNA噬菌体表达文库,重组率为97.5%,插入cDNA片段大小范围从600～4000bp,平均长约1400bp.结论成功构建高质量人源性大肠癌抗原基因cDNA噬菌体表达文库,适合于大批量筛选cDNA克隆的大肠癌相关抗原基因.
- 刘宇虎张振书钟东武金宝但汉雷杨兴龙杨晓强陈学清赖卓胜肖冰
- 关键词：噬菌体结肠直肠肿瘤
