严立恩
- 作品数:2 被引量:18H指数:2
- 供职机构:中国海洋大学海洋生命学院更多>>
- 发文基金:青岛市医药科研指导计划山东省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:环境科学与工程医药卫生更多>>
- 南极乔治王岛陆地土壤和潮间带放线菌多样性及其抑菌活性研究被引量:5
- 2016年
- 目的系统研究南极乔治王岛陆地土壤和潮间带中放线菌的多样性,并对分离菌株拮抗临床多重耐药菌活性进行筛选。方法利用放线菌门特异引物扩增16SrDNA序列,构建放线菌16SrDNA基因克隆文库,对文库进行多样性指数分析和系统发育分析。采用琼脂块扩散法以3株临床多重耐药菌为指示菌,筛选具有高抑菌活性的潜在药用放线菌。结果土壤放线菌文库和潮间带放线菌文库的覆盖率分别为54.55%和87.2%,陆地土壤中放线菌群落以放线菌纲为优势菌,潮间带样品中酸微菌纲占据明显优势。陆地土壤中的放线菌分布于10个目16个科中,潮间带底泥中放线菌则分布于7个目13个科中。纯培养得到141株放线菌,其中从陆地样品中分离得到93株菌,分布于放线菌纲的7个属17个种中,从潮间带样品中分离得到41株菌,分布于5个属10个种中。有17株具有显著抑菌效果的菌株,其中4株菌抑菌活性最强,可强烈抑制3株多重耐药菌。结论南极乔治王岛陆地土壤和潮间带底泥环境中蕴涵着丰富且多样的放线菌资源,陆地土壤中放线菌的多样性要高于潮间带底泥中放线菌的多样性。南极链霉菌和诺卡氏菌具有较强的拮抗多重耐药菌的活性,具有深一步研究的价值。
- 严立恩陈志荣王晶晶官颖颖李静
- 关键词:放线菌多重耐药菌
- 黄河三角洲滨海湿地非培养放线菌多样性被引量:14
- 2013年
- 【目的】利用免培养技术对黄河三角洲滨海湿地土壤中放线菌多样性进行分析。【方法】提取样品总DNA,利用放线菌门特异引物扩增放线菌16S rRNA基因序列,构建放线菌16S rRNA基因克隆文库,文库经RFLP分析后挑选代表序列测序并进行多样性指数分析和系统发育分析。【结果】构建的放线菌16S rRNA基因克隆文库覆盖率(C)为96.3%,116个测序序列可化分为46个OTUs,58.7%的OTUs(27个)存在于放线菌亚纲(Actinobacteridae)放线菌目(Actinomycetales)的7个亚目中,分布于10个科中,其中弗兰克氏菌亚目(Frankineae)最多,共7个OTUs,有30.4%的OTUs(14个)存在于酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)醋微菌亚目(Acidimicrobineae)中,没有发现与红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)和科里氏杆菌亚纲(Coriobacteridae)亲缘关系较近的序列。有10.9%的OTUs序列与有效发表的所有类群无亲缘关系,在进化树上成为一个独立的进化分支,有可能代表新亚目或更高级分类单元的类群。【结论】黄河三角洲滨海湿地蕴含着丰富的放线菌物种多样性及潜在的放线菌新类群,具有深一步研究的价值。
- 冯鸽许姗姗王超严立恩张璇李静
- 关键词:黄河三角洲湿地放线菌多样性