刘雨佳 作品数:12 被引量:57 H指数:5 供职机构: 首都医科大学中医药学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家杰出青年科学基金 北京市属高等学校高层次人才引进与培养计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 化学工程 农业科学 轻工技术与工程 更多>>
雷公藤乙酰CoA酰基转移酶基因全长cDNA克隆及表达分析 被引量:11 2015年 研究根据雷公藤悬浮细胞转录组数据库设计引物,对雷公藤悬浮细胞乙酰辅酶A酰基转移酶(acetyl-Co A C-acetyltransferase)基因Tw AACT进行全长c DNA(Gene Bank:KP297934)克隆以及生物信息学分析和基因表达分析。克隆得到Tw AACT c DNA全长为1 704 bp,编码405个氨基酸,等电点为6.10,相对分子质量为41.20 k Da,在线预测表明Tw AACT具有2个催化活性位点。雷公藤悬浮细胞经茉莉酸甲酯(Me JA)外源诱导后,通过荧光定量PCR表明,Tw AACT相对表达量明显增加,在24 h达到最高。研究首次克隆得到雷公藤AACT基因,为进一步阐述雷公藤萜类生物合成途径奠定基础。 赵瑜君 张萌 刘雨佳 苏平 童宇茹 胡添源 陈忻 高伟 黄璐琦关键词:雷公藤 克隆 生物信息学分析 基因表达分析 雷公藤CYP88A1基因全长cDNA的获得及生物信息学分析 研究根据雷公藤悬浮细胞转录组数据设计引物,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从雷公藤悬浮细胞中克隆得到一条CYP45088A1全长cDNA,并对其进行多重序列比对、蛋白结构预测及构建系统进化树等生物信息学分析,同时... 陈上 张萌 刘雨佳 高伟 王秀娟雷公藤磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸肌醇3-磷酸酶基因全长克隆及表达分析 根据雷公藤悬浮细胞转录组数据设计引物,对雷公藤悬浮细胞磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸肌醇3-磷酸酶(Phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase,PTEN)... 周家伟 刘雨佳 胡添源 高伟 黄璐琦关键词:雷公藤 克隆 生物信息学分析 雷公藤单加氧酶基因全长克隆及表达分析 被引量:1 2018年 目的:单加氧酶(Monooxygenase,MO)是一类通过在底物上加一个氧原子的加氧酶,在动植物体内参与多种代谢途径。本实验致力于从雷公藤转录组数据中克隆得到单加氧酶基因c DNA全长,并对克隆得到的MO基因进行初步的功能分析。方法:通过对雷公藤转录组数据中筛选得到MO基因片段设计特异性引物,克隆MO基因c DNA全长,通过生物信息学方法对得到的MO基因进行分析,主要包括多重序列比对,蛋白结构预测和构建进化树分析等。结果:根据分析结果Tw MO基因全长为2 193 bp,共编码507个氨基酸,等电点为8.84,相对分子质量为55.20 k Da,多重序列比对显示它与其他植物的MO基因具有较高的同源性。雷公藤悬浮细胞经外源茉莉酸甲酯(Me JA)诱导后,实时荧光定量结果显示,TwMO的表达量明显增加,并在48 h达到最高,提示Tw MO基因与雷公藤的次生代谢产物的生成有关。结论:本研究首次从雷公藤悬浮细胞中克隆得到MO基因,为进一步研究该基因的功能奠定基础。 周家伟 刘雨佳 胡添源 张逸风 高伟 黄璐琦关键词:雷公藤 克隆 基因 单加氧酶 血小板抗原基因分型与配型在血小板输注中的应用 被引量:10 2014年 本研究建立已知HPA基因型血小板供者库,开展相同HPA基因型血小板交叉配型后输注,防止血小板抗体的产生,解决血小板无效输注。应用PCR-SSP技术对血小板献血者和患者进行HPA基因分型,采集与患者ABO血型及HPA基因型相同血小板制剂,再加以固相凝集法配型相合后输注。结果表明,牡丹江地区HPA血型分布的遗传特征具有本地区人群特点,具有最高杂合度的是HPA-15,其次是HPA-3。采用ABO血型及HPA基因型均相同加固相凝集配型相合血小板输注有效率94.4%。采用ABO血型相同随机血小板固相凝集配型相合输注有效率77.8%。结论:牡丹江地区HPA血型分布的遗传特征具有多态性,采用血小板HPA同基因型供者采集加配型输注可防止血小板免疫性抗体及输注无效的发生,采用ABO同型随机血小板加配型输注是提高血小板输注的效果、防止输注无效发生的既经济又简便的方法。 刘丙现 刘雨佳 高广平 王丹 周锐华 马嫱 张彦 于秀清 郑华关键词:血小板 血小板配型 血小板输注 雷公藤牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶基因全长cDNA的获得及生物信息学分析 被引量:11 2015年 该研究利用c DNA末端快速扩增(RACE)技术从雷公藤悬浮细胞中克隆得到一条GGPPS全长c DNA(Gene Bank:KM978333),并对其进行多重序列比对、蛋白结构预测及构建系统进化树等生物信息学分析。所克隆的Tw GGPPS c DNA全长1 857 bp,编码含514个氨基酸的蛋白序列,相对分子质量为57.13 k Da,等电点为7.85,具有5个保守域和2个功能域,亚细胞定位预测显示其可能位于质膜上,多重序列比对及系统进化树结果显示与其他植物GGPPS家族具有较高同源性。实验首次克隆了雷公藤GGPPS基因,为进一步研究雷公藤甲素等二萜化合物生物合成途径奠定基础。 张萌 苏平 刘雨佳 童宇茹 赵瑜君 高伟 王秀娟 黄璐琦关键词:雷公藤 生物信息学分析 药用植物萜类生物合成HMGR基因研究进展 被引量:15 2013年 药用植物中萜类次生代谢产物种类丰富,数量巨大,其现代药理活性相当突出。3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-metllylglutaryl coenzyme A reductase,HMGR)作为萜类成分甲羟戊酸(MVA)合成途径上第一个重要限速酶,对药用植物萜类活性成分生物合成过程起着至关重要的作用。文章系统综述了HMGR的生物学意义、催化机制,HMGR克隆情况、基因结构、以及在重要药用植物丹参、甘草、红豆杉等中的研究进展。 刘雨佳 张夏楠 程琪庆 黄璐琦 高伟关键词:HMGR 萜类化合物 药用植物 雷公藤甾醇C-24甲基转移酶(TwSMT2)的cDNA克隆及表达分析 被引量:3 2016年 24-烷基甾醇具有构成膜结构和调节植物生长发育的作用,本研究根据雷公藤悬浮细胞转录组数据,克隆得到雷公藤甾醇生物合成途径上的一个重要限速酶:甾醇C-24甲基转移酶(SMT),其c DNA全长1 631 bp,开放阅读框1 080 bp,编码359个氨基酸。在线预测所编码蛋白的理论等电点为6.43,分子质量为40.0 k Da。生物信息学分析结果将此SMT基因归为SMT2家族。进一步构建p MAL-c2X-Tw SMT2重组质粒并转化大肠杆菌BL21(DE3),茉莉酸甲酯诱导表达分析结果显示:相比于对照组,经诱导后的Tw SMT2基因在24 h处有显著提高。SDS-PAGE及Western blot检测蛋白表达结果显示,IPTG可诱导表达出Tw SMT2蛋白。本研究首次克隆得到Tw SMT2基因,并获得重组蛋白,为进一步阐述雷公藤甾醇生物合成途径奠定基础。 关红雨 苏平 赵瑜君 童宇茹 刘雨佳 胡添源 张逸风 张夏楠 王秀娟 高伟 黄璐琦关键词:雷公藤 生物信息学分析 蛋白表达 雷公藤CYP88A1基因全长cDNA的获得及生物信息学分析 研究根据雷公藤悬浮细胞转录组数据设计引物,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从雷公藤悬浮细胞中克隆得到一条CYP450 88A1全长cDNA,并对其进行多重序列比对、蛋白结构预测及构建系统进化树等生物信息学分析,同... 陈上 张萌 刘雨佳 高伟 王秀娟关键词:雷公藤 萜类成分 生物合成 生物信息学 雷公藤PTEN基因全长克隆及表达分析 被引量:1 2017年 目的获得雷公藤Tripterygium wilfordii磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸肌醇3-磷酸酶(Phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase,PTEN)基因的c DNA全长,并预测其生物学功能。方法根据雷公藤转录组数据设计引物,对雷公藤PTEN(TwPTEN)基因进行全长克隆;通过生物信息学方法对得到的TwPTEN基因进行分析,主要包括多重序列比对,蛋白结构预测和构建进化树分析等。结果根据分析结果 TwPTEN基因全长为2 247 bp,共编码614个氨基酸,等电点为5.84,相对分子质量为66 900,多重序列比对显示其与其他植物的PTEN基因具有较高的同源性。雷公藤悬浮细胞经外源茉莉酸甲酯(Me JA)诱导后,实时荧光定量结果显示,TwPTEN的表达量明显增加,并在12 h达到最高,提示PTEN基因与植物的次生代谢产物的产生有关。结论本研究首次从雷公藤悬浮细胞中克隆得到PTEN基因,为进一步研究TwPTEN基因的功能奠定基础。 周家伟 刘雨佳 胡添源 高伟 黄璐琦关键词:雷公藤 生物信息学分析