卫军营
- 作品数：17 被引量：36H指数：4
- 供职机构：北京蛋白质组研究中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学生物学医药卫生一般工业技术更多>>
- 18O同位素标记定量肽段串联体蛋白质结合同位素稀释-多反应监测质谱的蛋白质绝对定量新方法被引量：2
- 2013年
- 建立了定量肽段串联体蛋白质(concatamers of Q peptides,QconCATs)结合18O同位素标记-多反应监测质谱的蛋白质绝对定量新方法。首先对QconCAT重组蛋白质进行了纯度表征,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)表征结果表明重组蛋白质的纯度在99%以上,相对分子质量约为63.4 kDa。对QconCAT重组蛋白质酶切后的肽段混合物进行质谱分析,并经pFind和pLabel软件处理,验证了目标肽段。还考察了QconCAT重组蛋白质的酶切效率和18O标记效率,并对QconCAT蛋白质结合18O标记-同位素稀释-多反应监测质谱方法进行了评价。实验结果表明,采用该方法对腾冲嗜热厌氧菌(Thermoanaerobacter tengcongensis,TTE)中选定蛋白质的肽段进行绝对含量测定时,相对标准偏差小于20%,准确度较高,说明该方法可用于复杂生物样本中蛋白质的绝对定量。更重要的是所建方法不仅解决了细胞培养氨基酸稳定同位素标记(SILAC)技术的重标试剂价格昂贵的问题,也为定量蛋白质组学提供了一种新的方法。
- 李楠楠周廉淇毛心丽张姣卫军营林虹君李佳斌田芳张养军钱小红
- 关键词：同位素稀释
- 稳定同位素18O标记蛋白质组双重定量新策略及其在YHB1基因敲除的酵母亚硝基化差异蛋白质组研究中的应用
- 规模化蛋白质组研究中的准确定量问题是目前蛋白质组研究中的难点和热点。本研究提出了一种基于稳定同位素18O标记的蛋白质组双重定量新策略。本方法是建立在N端肽段和C端肽段普遍标记的基础之上，通过18O化学标记与酶切标记结合的...
- 刘慧玲张养军孟令燕李晓峰卫军营杨淑华蔡耘钱小红
- 关键词：蛋白质组基因敲除
- 文献传递
- 质谱智能选择反应监测用于蛋白质绝对定量中母子离子对确证的方法研究被引量：2
- 2012年
- 质谱选择反应监测(SRM)技术在蛋白质绝对定量分析中的应用越来越广泛,其成功应用的关键是肽段母子离子对的正确选择与确证。触发采集二级图谱是目前常用的母子离子对确认方法,但分析效率有待于提高。质谱智能选择反应监测(iSRM)是新近发展的高通量分析方法。为了考察该方法用于通量化母子离子对确证时的效果,选用牛血清白蛋白(BSA)和酵母蛋白提取物作为样品进行分析。结果表明,该方法具有更高的分析灵敏度,可以对低至1 fmol BSA样品中的母子离子对进行确证,而且相对于触发采集二级图谱方法而言,具有更高的分析通量,为规模化母子离子对选择与确证提供了一种新的策略。
- 卫军营张养军赵炎陈希曙马岩应万涛钱小红
- Fe_3O_4/TiO_2纳米材料靶上脱盐的基质辅助激光解析/电离质谱新方法研究被引量：6
- 2007年
- 建立了一种简便、高效的靶上脱盐新方法。利用Fe3O4/TiO2磁性纳米材料对肽段的吸附作用,将其作为载体用于靶上肽段富集和脱盐。在对纳米材料使用量、浸洗条件进行优化的基础上,成功地鉴定了溶于10mol/L尿素溶液的100fmol的肌红蛋白样品,也对溶于3mol/L尿素溶液中的10fmol的肌红蛋白样品进行了成功地分析鉴定。通过对肌红蛋白样品进行预处理和质谱分析重复实验,表明该方法重现性好,且简便、高效,所需时间短,一次可同时处理多个样品,易于实现通量化,为有效地解决目前蛋白质组分析中所面临的基质辅助激光解析/离子化飞行时间质谱耐盐性差的问题提供了一种新的手段。
- 卫军营张养军谭峰刘慧玲王京兰蔡耘钱小红
- 一种两维短梯度高效蛋白质组分离鉴定方法
- 本发明公开了一种两维短梯度高效蛋白质组分离鉴定技术。本发明的蛋白质组分离鉴定方法，包括以下步骤：1）从离体的细胞或组织中提取蛋白质混合物；2）采用蛋白酶将待分离鉴定的蛋白质混合物酶切成肽段混合物；3）将酶切获得的肽段混合...
- 秦钧钱小红丁琛应万涛张养军卫军营宋雷江静张姣贺福初
- 文献传递
- 蛋白质组学研究技术进展被引量：3
- 2009年
- 随着人类基因组全序列测定的完成，人类基因的注释与功能确认已成为生命科学面临的最重要任务之一。蛋白质是生命活动的功能执行体，人类基因组中绝大部分基因及功能有待于蛋白质水平上的揭示与阐述。蛋白质组学（proteomics）研究全部基因所表达的所有蛋白质在不同时间与空间的表达谱和功能谱，可以全景式地揭示生命活动的本质。蛋白质组还是研究疾病发病机制和防治药物的直接靶体库。因此，蛋白质组研究已成为21世纪生命科学的重点之一。
- 卫军营钱小红
- 关键词：人类基因组生命活动全序列测定蛋白质水平
- 液质联用技术中不同蛋白质鉴定策略的比较被引量：2
- 2008年
- 在常用的多维液相色谱-质谱联用技术中,采取延长梯度洗脱时间、进行重复实验、采用质谱分段扫描等多种方法,提高对蛋白质的鉴定效率。为了系统评价这些方法在复杂生物样本分析中的效果,应用酵母的蛋白提取物作为样本,在LCQ质谱仪上进行一系列的比较实验。结果表明,在一定范围内,随着梯度时间的延长,被鉴定的非冗余肽段(unique peptide)数量显著增加,相对应的蛋白质簇(group protein)数量也随之增加。同样,进行重复实验和采用质谱分段扫描的方法均能提高蛋白鉴定的覆盖率,而采用质谱分段扫描的策略具有更为显著的效果,因此在规模化蛋白质组分析中,应当选择更为合适的、互补的研究策略以提高结果的完整性。
- 卫军营张养军陈明覃培斌王京兰蔡耘钱小红
- 关键词：酵母
- 磁性纳米材料富集结合液-质联用规模化分析磷酸化蛋白质
- 蛋白质磷酸化修饰是细胞内重要的翻译后修饰过程,对磷酸化修饰的研究已经成为蛋白质组学研究中的一个重要研究方向及研究热点。规模化识别和鉴定生物体内磷酸化蛋白质的表达及其变化, 在技术方法上还存在很大困难,其中磷酸化修饰蛋白质...
- 卫军营张养军谭峰王京兰蔡耘钱小红
- 一种基于iSRM策略的蛋白质组质谱数据分析工具
- 2013年
- 由于重复性好、定量精度高,基于质谱的选择反应监测(SRM)技术在蛋白质定量分析中的应用越来越广泛。智能选择反应监测(iSRM)是一种新型的SRM实验策略。针对该策略产生的质谱数据,开发了一个肽段定量信息提取工具——iSQuant。该工具使用MATLAB脚本语言编写,简便易用。利用重复实验数据和标准实验数据对iSQuant的性能评估表明,iSQuant具有优越的可重复性能,定量结果和理论丰度线性度很高。
- 张伟张伟卫军营徐长明徐长明张纪阳朱云平钱小红张养军
- 关键词：质谱分析蛋白质组
- 功能化磁性纳米材料制备及其在蛋白质质谱分析中的应用方法研究
- 纳米材料因其独特的理化性质,使其在生物样本分析中的应用越来越广泛,也为我们发展新的样品前处理技术提供了新的选择。基于此,本论文开展了如下研究工作:功能化磁性纳米材料的制备以及在磷酸化修饰蛋白质质谱分析中的应用研究、靶上规...
- 卫军营
- 关键词：蛋白质组学磷酸化蛋白质纳米材料质谱分析
- 文献传递
