吉彦莉
- 作品数：40 被引量：265H指数：10
- 供职机构：北京市西城区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金首都卫生发展科研专项广西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 猪戊型肝炎病毒株swGX32全基因组序列分析被引量：3
- 2008年
- 目的分析从广西地区分离的1株猪戊型肝炎病毒swGX32全基因组序列并比较其与其他分离株的差异。方法设计PCR引物，用巢式反转录聚合酶链反应法（RT—nPCR）分段扩增戊型肝炎病毒（HEV）株swGX32全基因序列，用cDNA末端快速扩增法（RACE）扩增其末端序列，对扩增产物进行克隆和测序，并对拼接后的基因组进行序列和进化分析。结果除3’polyA尾巴外，swGX32全长7240nt，ORF1与ORF2重叠4nt，ORF3包含在ORF2序列中。swGX32全基因序列与HEV1—4型核苷酸序列的同源性分别为：73％-74％、73％、74％-75％，83％-94％，其中与中国人源HEV株JKO—ChiSai98C同源性最高，达94％。全基因序列进化分析显示，swGX32位于HEV基因4型分枝上，ORF2部分核苷酸序列进化分析显示，swGX32与JKO—ChiSai98C同在HEV4a亚型分枝上。结论猪HEV swGX32在全基因组结构及分子进化上均与人HEV JKO—ChiSai98C有密切关系，为揭示戊型肝炎是一种人兽共患病提供了分子生物学依据。
- 吉彦莉李凌君韦献飞王玲常义斌唐荣兰朱永红庄辉
- 关键词：戊型肝炎病毒基因型人畜共患病
- 2009年西城区国家级流感网络实验室的监测情况与分析被引量：1
- 2010年
- 目的:对西城区两家哨点医院采集的流感样病例咽拭子标本进行监测,以掌握2009年西城区流感流行情况。方法:提取咽拭子标本中的病毒核酸,采用荧光定量PCR方法检测甲型H1N1三个主要基因infA、SWinfA、SWH1以及质控RNP基因,然后采用三对基因FluB、FluH1、Flu H3进行季节性流感分型。结果:在监测1220件流感样病例咽拭子标本的核酸检测中,共检出279件甲型H1N1,以10、11月为高峰;A(H3)检出113件,以8、9月为流行高峰;乙型检出28件,在12月出现上升趋势;A(H1)只检出7件,9月后未检出;A未分型32件。结论:甲型H1N1在2009年是西城区的优势流行株,但也伴随着不同时间不同数量的季节性流感的流行。
- 张晶波李达胡晓芬吉彦莉王永全崔京辉苗芳
- 关键词：甲型H1N1流感病毒核酸荧光定量PCR
- 北京市西城区2009年手足口病病原学监测结果分析被引量：10
- 2011年
- 目的:了解2009年北京市西城区手足口病的病原学特征,为手足口病的防控提供病原学依据。方法:用实时荧光RT-PCR方法,对哨点医院定期采集的手足口病临床诊断病例标本进行肠道病毒核酸检测和型别鉴定。结果:2009年4月-2009年12月共收集咽拭子标本280份,84.29%的病例年龄在5岁以下。实时荧光RT-PCR检测结果显示,肠道病毒核酸阳性207例,阳性率为73.93%。EV71、CoxA16及其他型别肠道病毒核酸阳性数分别为61例(29.47%)、114例(55.07%)和33例(15.94%)。男性病例肠道病毒阳性检出率高于女性(2χ=8.728,P=0.0031)。4月-12月的病原构成呈动态变化特征。结论:2009年北京市西城区手足口病病原以CoxA16和EV71为主,CoxA16为优势流行型别。
- 王永全吉彦莉
- 关键词：手足口病EV71COXA16实时荧光RT-PCR
- 北京市西城区2009年-2010年B型流感监测分析被引量：5
- 2011年
- 目的：了解北京市西城区B型流感的流行状况,为制定预防控制措施提供依据。方法：由两家哨点医院每周随机采集流感样病例的咽拭子共40~60份,提取病毒RNA,应用real-time PCR法和MDCK细胞分离法进行检测。结果：2077件流感样标本中有373件real-time PCR检测B型流感阳性,总阳性率为18.0%。阳性率最高的是2010年1月,为81.6%。西城区于2010年1月-2010年2月出现一次B型流感小规模社区暴发,流行呈波浪进程,于2010年第1周至第8周出现一次流行高峰。儿童和老年人B型流感阳性率比较高。373件real-time PCR法阳性标本经MDCK细胞培养后,共有91件阳性,阳性率为24.4%（91/373）。结论：应加强监测管理,并尽快采取预防控制措施以保护广大人群身体健康。
- 李达胡晓芬张晶波王永全苗芳吉彦莉
- 关键词：荧光定量PCR
- 北京市西城区2009年-2011年H3N2甲型流感病毒HA1基因特性分析被引量：4
- 2013年
- 目的:了解2009年6月-2011年6月期间北京市西城区H3N2甲型流感病毒HA1基因的变异情况。方法:采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增分离到的H3N2甲型流感病毒HA1基因,对基因片段进行测序,获得的序列与WHO推荐的疫苗株进行基因进化特性分析。结果:HA1基因进化树分析表明2009年、2010年、2011年基本上分为三个分支,并且每个分支与当年的疫苗株都不在同一分支上;HA1氨基酸变异中,抗原决定簇约有10.6%发生了变化,受体结合位点194位有改变。结论:2009年-2011年北京市西城区分离到的H3N2亚型流感病毒的抗原性及基因特性发生了变化,这种变化与世界各地的变化趋势大体吻合。
- 张晶波张家淮胡晓芬李达苗芳王永全吉彦莉
- 关键词：HA1基因基因序列分析
- 2018-2019年北京市西城区6起学校急性胃肠炎聚集性疫情的GⅠ诺如病毒病原鉴定与溯源研究被引量：1
- 2022年
- 目的 分析2018-2019年北京市西城区6所学校发生的急性胃肠炎疫情GⅠ诺如病毒的基因型别特征。方法 收集2018-2019年西城区6所学校急性胃肠炎病例的粪便标本37份。采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(real-time RTPCR)对提取的GⅠ和GⅡ诺如病毒核酸进行检测。采用RT-PCR进行GⅠ诺如病毒聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分片段的扩增和测序。用诺如病毒在线分型工具对测序成功的毒株进行初步鉴定和基因分型,用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对,用MEGA 6.06软件构建进化树。结果 6所学校(18,S1~S4和19,S5~S6)发生的诺如病毒急性胃肠炎疫情均为聚集性疫情,GⅠ诺如病毒核酸阳性率为83.78%(31/37),GⅡ诺如病毒未检出;聚合酶区和衣壳蛋白VP1区进化分析分别显示,1起疫情的4株诺如病毒毒株分别与GⅠ.Pd参考株和GⅠ.3b参考株在同一分支,5起疫情的19株诺如病毒毒株与GⅠ.Pb参考株和GⅠ.6a参考株在同一分支;每所学校毒株相似性为100.0%。双区分型合并结果,1起疫情由GⅠ.Pd-GⅠ.3b引起,该重组株与GⅠ.3[P13]/Hu/MT008455/2018/Shanghai/CHI相似性高达99.6%;5起疫情由GⅠ.Pb-GⅠ.6a引起,这重组株与GⅠ.6[P11]/Hu/MZ227264/2016/US相似性高达98.1%。结论 2018-2019年北京市西城区6所学校诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情分别由GⅠ.Pd-GⅠ.3b和GⅠ.Pb-GⅠ.6a重组株引起。应加强对诺如病毒重组株分子流行病学监测,为诺如病毒疫情提供预警预测的依据。
- 王永全崔海洋吉彦莉靳博李伟红刘白薇沈玲羽高志勇严寒秋
- 关键词：诺如病毒急性胃肠炎
- 北京地区与手足口病相关的非EV71、非CoxA16型肠道病毒的分子特征分析被引量：34
- 2011年
- 目的了解北京地区引起手足口病的非EV71、非CoxA16型肠道病毒的病原构成及优势型别VP4区遗传特征分析。方法收集2009年4月．12月检测为非EV71、非CoxA16型肠道病毒的手足口病患者咽拭子标本共45份。提取病毒核酸，用巢式RT-PCR法扩增病毒VP4区序列，对PCR阳性扩增产物进行测序，通过与GenBank收录的序列BLAST比对确定病毒型别；并对优势型别进行序列和进化分析。结果45例标本中共有32例标本巢式RT—PCR检测为阳性（71％），其中26份PCR产物测序成功，经BLAST比对后，26例标本病毒型别均得到确定：CoxA10为11例；CoxA5为5例；CoxA12和CoxA4各2例；CoxA2、CoxA6、CoxA9、CoxA16、CoxB5、Echo11各I例。CoxA10在型别确定的非EVT1、非CoxA16型肠道病毒中占44％，为优势肠道病毒型别。11株CoxA10在VP4区核苷酸序列同源性为82％-99％，氨基酸序列同源性为96％．100％。进化分析显示，10株北京株CoxA10与中国广东株在同一进化树分支上，1株与CoxA10日本株在同一分支上。结论北京地区引起手足口病的肠道病毒型别多样，CoxA10为非EV71、非CoxA16型肠道病毒中的优势型别，北京地区CoxA10株包括两个不同的基因型。
- 王永全吉彦莉曲梅
- 关键词：手足口病肠道病毒进化分析
- 西城区2009-2010年度国家流感网络实验室的监测情况与分析被引量：9
- 2011年
- 目的：对西城区两家哨点医院采集的流感样病例咽拭子标本进行监测,以掌握2009年-2010年度西城区流感流行情况。方法：提取咽拭子标本中的病毒核酸,采用荧光定量PCR方法检测甲型H1N1三个主要基因infA、SWinfA、SWH1以及质控RNP基因,然后采用三对基因FluB、FluH1、Flu H3进行季节性流感分型。结果：在监测2117件流感样病例咽拭子标本的核酸检测中,共检出263件甲型H1N1,以10月、11月为高峰;季节性流感的检测中,乙型检出393件,在12月出现上升趋势,1月、2月为高峰;A（H3）检出76件,以8月、9月为流行高峰;A（H1）只检出2件;A未分型15件。结论：西城区2009-2010年度流感流行高峰为2009年10月~2010年3月,以甲型H1N1和B型流感病毒为主,而且在不同时间里出现了不同的优势型别。
- 张晶波胡晓芬李达苗芳吉彦莉王永全
- 关键词：甲型H1N1流感病毒核酸荧光定量PCR
- 一起由柯萨奇病毒A4引起的聚集性发热的分子流行病学研究被引量：3
- 2019年
- 目的对2018年北京市一起聚集性发热疫情的病原进行鉴定,并对其进行分子流行病学分析。方法采集此次疫情4例患儿咽拭子标本,提取标本核酸,用实时荧光PCR对其进行初步病原学鉴定。用分型引物通过RT-nPCR对肠道病毒VP1区部分核苷酸序列进行扩增,通过测序和GenBank Blast比对确定肠道病毒型别,并对其进行序列和进化分析。结果 4例患儿标本均为CVA4阳性,在VP1区,其核苷酸序列同源性为100%;序列分析发现,其与2016年澳大利亚CVA4分离株MH111027同源性最高,为99%;与2004—2016年中国境内CVA4分离株同源性为83%～90%。进化分析显示,此次疫情毒株与近年来中国境内流行的CVA4优势毒株不在一个进化树分支上。结论引起此次聚集性发热疫情的病原体是CVA4,其与近年来我国流行的CVA4优势毒株具有不同的种系来源。
- 吉彦莉王永全崔海洋靳博
- 关键词：进化分析
- 2015—2018年北京市西城区5岁以下儿童病毒性腹泻流行病学特征被引量：26
- 2020年
- 目的了解2015—2018年北京市西城区5岁以下儿童病毒性腹泻的流行特征,为病毒性腹泻防控提供依据。方法采集2015—2018年北京市西城区儿童腹泻监测哨点医院门诊就诊的5岁以下病例粪便标本,用实时荧光PCR对A组轮状病毒(RVA)、诺如病毒(NV)、腺病毒(AdV)、星状病毒(AstV)进行检测。结果共采集粪便标本972份,A组轮状病毒阳性142例(14.61%),诺如病毒阳性136例(13.99%),腺病毒阳性67例(6.89%),星状病毒阳性49例(5.04%),混合感染46例(4.73%)。RVA发病高峰为冬季,NV秋季高发,AstV春季检出率最高,AdV感染无明显季节特征。2岁以内腹泻患儿RV、NV、AdV、AstV的检出率分别为80.28%、77.94%、83.58%、87.75%。结论2015—2018年北京市西城区5岁以下儿童病毒性腹泻的主要病原是轮状病毒和诺如病毒,2岁以内儿童是高发人群,冬季检出率最高。
- 吉彦莉王永全崔海洋靳博曹玮刘潇潇
- 关键词：病毒性腹泻轮状病毒诺如病毒腺病毒星状病毒
