唐欢
- 作品数：4 被引量：1H指数：1
- 供职机构：江西农业大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划江西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 猪13号染色体q41区的3个功能基因STS多态性与产肠毒素大肠杆菌F4ab／ac易感性相关被引量：1
- 2008年
- 由产肠毒素大肠杆菌(Escherichia coli)F4(ETEC F4)引起的断奶前仔猪腹泻病是一种常见细菌感染病,对养猪业造成了巨大经济损失.编码ETECF4ab/ac受体的位点已被定位于猪(Sus scrofa)13号染色体(SSC13)q41区域,S0075为最紧密连锁的标记之一.本研究从S0075侧翼染色体区域选择了SLC12A8,MYLK和KPNA13个基因,建立猪特异性序列标签位点(STS).利用白色杜洛克×二花脸资源家系群体中的ETECF4ab/ac侵染抗性和易感个体,通过比较测序法,建立了这3个基因的STS,并鉴别到7个单核苷酸多态位点.进一步检测了白色杜洛克×二花脸资源家系群体祖代、亲本代和755头F2个体在SLC12A8g.159A>G,MYLKg.1673A>G和KPNA1g.306A>G多态位点的基因型.传递不平衡检测(TDT)分析表明:这些多态位点和相应的单倍型与ETEC F4ab/ac(特别是F4ac)刷状缘黏附表型存在显著相关,表明这些多态位点和单倍型与ETEC F4ab/ac受体的编码基因因果突变存在连锁不平衡.本研究进一步证实了SSC13q41存在ETEC F4ab/ac侵染易感性的遗传位点,为ETEC F4ab/ac受体基因的精细定位提供了新型多态标记.
- 黄翔任军晏学明彭秋玲唐欢张波季华员杨舒瑾黄路生
- 关键词：易感性
- 精细定位和鉴别影响新生仔猪腹泻的F4ac受体基因
- 利用183个标记的全基因组连锁分析,将影响新生仔猪腹泻的F4ac受体基因位点精细定位至SSC13q41的1.7cM染色体区域,并构建了该区域20个基因的高分辨率猪-人比较基因图谱.进一步分离和鉴别了MUC4、MUC13、...
- 任军彭秋玲杨舒瑾邹争志王怡仲黄路生晏学明黄翔张志燕欧阳婧曾维宏张波季华员唐欢
- 关键词：受体基因基因位点染色体定位新生仔猪腹泻
- 持续感染口蹄疫病毒VP1蛋白对细胞转录组的影响
- 2022年
- 【目的】通过转录组测序(RNA-Seq)方法分析持续感染口蹄疫病毒结构蛋白VP1诱导的PK-15细胞基因表达谱的变化,探索VP1蛋白对宿主细胞信号通路的影响。为后续开展VP1影响FMDV持续感染相关机制研究提供基础数据和理论支持。【方法】PK-15细胞分别转染pCAGGS-HA(对照载体)、pCAGGS-HA-Pi-VP1质粒,转染36 h后,Western blot检测VP1蛋白表达,同时提取两组细胞总RNA进行转录组测序(每组3个重复,2组6个样本)。将测序所得的序列进行过滤比对,获得差异表达基因后,对差异表达基因进行了生物信息学分析。采用qRT-PCR验证关键差异表达基因的表达。【结果】RNA-Seq共鉴定出3376个差异表达基因(DEGs)|log2(Fold Change)|>0和padj<0.05,其中上调基因1744个,下调基因1632个。许多参与免疫反应和炎症的效应基因差异表达。GO和KEGG富集分析显示,差异基因GO条目绝大部分与核糖体有关,而KEGG富集中涉及了与天然免疫相关的信号通路,如TNF信号通路、Toll受体信号通路。【结论】pCAGGS-HA-Pi-VP1转染PK-15细胞之后,改变了细胞的表达谱,获得的DEGs及其功能注释信息有助于理解其对宿主细胞的影响,为后续开展VP1影响FMDV持续感染相关机制研究提供基础数据和理论支持。
- 杨黎刘萍韦美华柯雄锋刘丽清宋静静方莹唐欢孔令保孔令保
- 关键词：转录组基因表达谱FMDVVP1
- 猪13号染色体q41区与人3号染色体q21和q29区保守区域的同线性断点分析
- 唐欢
