张柳
- 作品数：12 被引量：40H指数：4
- 供职机构：云南农业大学农学与生物技术学院更多>>
- 发文基金：中国烟草总公司科技项目国家烟草专卖局基金云南省烟草专卖局(公司)科技项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- RNAseq转录组分析烟草叶片衰老机制
- 叶片衰老在所有植物中是一个重要的生理过程，它是一种基因所控制的分解程序能够使植物有效再活化营养物质到新的生长叶片中.烟草(Nicotiana tabacumL.)是重要的模式植物，也是植物学研究中的常用材料，烟草的叶片发...
- 张柳林春张鹏刘正杰文国松毛自朝
- 关键词：烟草叶片衰老转录组
- 不同移栽时间对烤烟发育和生理代谢的影响被引量：3
- 2016年
- 云南清香型烟区,根据各地气候特征,又分为4种不同亚型,其中清香II型主要位于宁洱、红河、保山、临沧及文山等地。为探索烟草清香Ⅱ区不同移栽处理对云87烟草发育及代谢的影响,在典型清香Ⅱ宁洱烟区,以云烟87为品种,设置3个处理(T1:提前14 d移栽、T2:正常移栽、T3:延迟14 d移栽),分析不同移栽处理的气候变化;取样观测不同处理烟叶农艺性状、内部显微结构、生理指标、产量和经济性状及烟叶转录组改变。结果表明:不同移栽处理导致气候环境的改变,引发烟株形态和发育改变,其中T2处理株烟具有最高的株高、茎围、有效叶数及叶面积等农艺性状;T2处理的叶片最厚,旺长期栅栏组织大小、细胞数、栅栏和海绵组织比适中;转录组分析表明变化的气候环境改变烟株的基因表达,在烟株发育的旺长期,T2烟株光合相关基因表达增强,相对于T1和T3呼吸与逆境相关基因也较高表达;成熟期则相反,T2处理的烤烟光合、呼吸、逆境相关基因表达量较T1、T3处理低,这种变化有利于提高T2烟叶产量与品质。本研究表明:目前宁洱栽培模式下的移栽时间,为云烟87适宜的移栽期。
- 瞿晓东张鹏张柳李军营林春陈严平毛自朝
- 关键词：移栽时间气候条件转录组
- 降雨量对‘云烟87’叶片基因表达影响的分析被引量：3
- 2018年
- 降雨量作为植物生长过程中的水分补给条件,影响着植物的生长和发育。为了研究烟草在降雨量降低的逆境胁迫下的基因表达情况,本研究对室内模拟条件下和室外大田环境下的不同发育期的烟草叶片进行了转录组分析。根据初步的分析和通过趋势分析(STEM)研究发现,随着降雨量的减少,干旱胁迫的产生,烟草叶片内部的生命活动受到影响,与水分运输和物质转运相关的基因下调表达,信号转导的能力减弱,但是钙信号传导途径上调表达。同时发现一些与抗旱、离子运输以及次生代谢产物合成相关的基因上调表达。研究中还发现ABC转运体蛋白、CIPK基因、转录因子以及次生代谢相关基因,随着水分的减少,烟草植株的生命活动受到影响,但是研究为进一步选育抗旱品种提供了科学支持,从而能够深入了解降雨量与叶片基因调控的关联。
- 张柳何晓健林春李军营杨焕文毛自朝
- 关键词：降雨量水分抗旱
- 烟草叶片衰老过程变化的蛋白质组和转录组研究
- 衰老是植物生长发育的最后阶段,是一个复杂且高度调控并涉及到细胞、器官和个体的形态和生理变化的过程。烟草(Nicotiana tabacum L.)作为重要的经济作物,也是植物学研究的模式材料。烟叶生产中有打顶打叉的环节,...
- 张柳
- 关键词：烟草叶片衰老蛋白质组学转录组学
- 文献传递
- 烟草叶片衰老期过程中的蛋白质组学分析被引量：19
- 2014年
- 大田烟叶生产过程中因打顶打叉的处理,改变了烟叶正常的衰老模式。为研究这一特殊的衰老机制,我们自旺长期开始,对‘云烟87'不同发育阶段烟株的中部叶片,进行形态观测、生理生化分析及蛋白质组学检测。结果显示:随着烟叶的逐渐成熟和衰老,烟草的叶色逐渐变黄,叶片逐渐变短、变窄,厚度减少;解剖结构清晰看到栅栏组织和海绵组织从最初的整齐排列到逐渐排列紊乱,组织细胞间轮廓不明显,细胞间隙明显增大;亚显微观测表明,淀粉粒在叶绿体中逐渐积累,类囊体片层结构被挤散,叶绿体膜被撑破。生理与生化分析表明衰老过程伴随着光合作用速率下降,光合色素降解加速,呼吸代谢的增加,这可能与衰老叶片中叶绿体逐渐崩塌和细胞膜透性增加相一致。iTRAQ标记方法共检测到不同发育阶段432个差异表达蛋白质,其中注释到308个与多种生命过程相关。蛋白差异富集分析表明,烟草叶片衰老过程中与光合作用等合成代谢相关蛋白多下调表达,而逆境反应及呼吸作用等分解代谢相关蛋白多上调表达。
- 张柳王铮张亚婕林春陈严平李军营毛自朝
- 关键词：蛋白质组学ITRAQ叶片衰老
- 云南清香Ⅲ型烟区不同移栽期对烤烟代谢和发育的影响
- 2017年
- 【目的】为探索云南清香Ⅲ型烟区不同移栽期对烟草生理代谢及生长发育的影响。【方法】在云南省丽江市永胜县永北镇,在相同栽培管理条件下对不同移栽期的云烟87进行薄膜覆盖栽培,分别为提前14 d移栽(T1)、正常移栽(T2)和延迟14 d移栽(T3),并取样进行农艺性状、产量、物质代谢分析。【结果】不同移栽期对应不同的气候环境,导致烟株形态、代谢及发育的改变。相对于提前14 d移栽(T1)和延迟14 d移栽(T3),正常移栽(T2)旺长期和成熟期烟株叶片最厚、栅栏和海绵组织比适中,烟株具有最好的株高和叶面积并收获较高的烟叶产量与单位产值。【结论】清香Ⅲ型烟区以云烟87为品种,5月初为最佳移栽期。
- 张鹏张柳王乐李军营普中华林春毛自朝
- 关键词：移栽
- 不同气候条件对“云烟87”旺长期叶片光合速率及蛋白表达的影响被引量：4
- 2015年
- 为揭示烟草植株对不同气候环境响应的分子机理,采用相同土壤栽培和管理,在云南3个不同气候试验点盆栽烤烟品种"云烟87",测定烟株旺长期农艺性状、SPAD值和净光合速率,以iTRAQ标记技术开展叶片差异表达蛋白分析,并对部分差异表达蛋白基因的转录进行q-RT-PCR验证。结果表明:在不同实验点间农艺性状、SPAD值和净光合速率有显著差异;不同生态点间烟叶差异蛋白富集到碳、氮代谢和逆境响应等途径。与昆明烟叶相比,丽江金庄试验点烟叶中光合光反应相关的蛋白上调表达,而与糖呼吸消耗相关的酶类下调表达;丽江片角试验点烟叶糖合成途径相关的酶类上调表达而与呼吸代谢相关酶类则下调表达。丽江片角和金庄试验点烟叶中,蛋白质和氨基酸等含氮化合物合成酶类下调,而与其分解酶类上调表达。随机选取6个差异表达的蛋白质,用q-RT-PCR进行其转录表达水平的间接验证,表明与iTRAQ分析的差异蛋白在mRNA水平上有相似的表达趋势。本研究初步阐明丽江烟叶通过提高碳含量和降低氮含量来形成高"碳氮比"烟叶的气候因子诱发机制。
- 蔡永占周普雄张柳王铮徐琼华杨焕文毛自朝
- 关键词：气候条件旺长期蛋白质组学ITRAQ
- 烟草与黑胫病菌亲和互作的数字基因表达谱分析
- 2017年
- 为探讨烟草与黑胫病菌亲和互作在转录水平的分子机制,本研究利用Solexa高通量测序技术分析感病品种红大接菌前0 h和接菌后12 h、24 h、48 h和72 h茎部组织的基因表达谱。将5个时间点样品的Unigene表达量依次进行两两相比,4个时间点分别鉴定出11 434、12 190、5 128、7 428个差异表达基因。GO功能分析表明,已注释的差异表达基因显著富集到细胞组分中的细胞壁、胞外区域和质膜上,分子功能的催化活性、激酶活性、核酸结合转录因子活性和信号转导活性,并主要参与响应刺激、响应胁迫、次级代谢、信号转导等生物学过程。Pathway分析显示,差异表达基因显著富集到多条次生代谢产物生物合成途径和碳水化合物代谢途径,以及与抗病相关的植物与病原菌互作、植物激素信号转导等途径。14类共计36个已知功能差异基因参与植物与病原菌互作Pathway,多数属于PTI途径调控基因,且基因表达量在黑胫病菌侵染中期(48 h)达到最高;仅有4类ETI途径调控基因差异表达,其中抗病负调控因子RIN4在黑胫病侵染前、中期(24 h,48 h)上调表达,信号组分HSP90接菌后24 h下调表达。由此可以推测,受黑胫病菌侵染后,红大品种中PTI途径调控基因能有效响应黑胫病菌胁迫反应,从而提高对黑胫病菌的抵抗能力,而ETI途径调控基因不能有效响应黑胫病菌胁迫反应。本研究初步揭示了烟草黑胫病感病品种在转录水平上的表达差异,为培育优质抗病新品种提供了理论基础。
- 黄飞燕叶贤文王戈何晓健何晓健张柳
- 关键词：烟草黑胫病
- 烟草NtPP2C37-like基因的克隆及表达分析
- 2019年
- 2C型丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶(PP2C-type protein phosphatases, PP2C)是ABA信号转导途径中的关键组分,在植物生长发育、细胞周期调节及应对逆境胁迫的过程中发挥重要的作用。本研究利用本实验室构建的‘云烟87’转录组数据库,从‘云烟87’烟草中克隆到一个NtPP2C37-like基因,该基因开放阅读框为1 275 bp,编码425个氨基酸残基。通过对NtPP2C37-like蛋白质进行相关分析,该蛋白不存在信号肽,可能属于非分泌蛋白;不具有跨膜结构,不属于跨膜蛋白。同源性分析结果显示,说明NtPP2C37-like蛋白与茄科植物有高度同源性。本研究获得了烟草NtPP2C37-like基因完整ORF,这为将来深入研究烟草NtPP2C37-like基因功能提供了科学依据。
- 何晓健何晓健张柳杨焕文杨焕文
- 关键词：ORF生物信息学
- 烟草黑胫病胁迫相关miRNA鉴定及功能分析被引量：2
- 2018年
- MicroRNAs是一类非编码RNA分子,通过RNA沉默在转录后水平调控基因表达,在响应非生物和生物胁迫中扮演重要角色。本研究为了阐明烟草黑胫病抗病分子机制,构建了抗病品种云87接菌前0 h和接菌后12 h、24 h、48 h和72 h茎部组织的5个小RNA文库。运用solexa高通量测序技术鉴定出565个已知miRNAs（代表63个miRNA家族）和187个新miRNAs。在黑胫病菌胁迫下,总共有156个miRNA差异表达,大部分差异表达miRNA聚类到profile 18、profile 15和profile 9等3种显著性动态表达模式,并用qRT-PCR方法验证部分差异表达miRNA表达模式。靶基因预测和功能分析表明,差异表达miRNA主要参与调控防御响应、转录因子或信号级联途径和不同生理过程相关基因表达。本研究初步揭示了烟草与黑胫病非亲和互作间在转录后水平上的调控机制,为培育抗黑胫病烟草品种提供miRNA水平的理论依据。
- 黄飞燕叶贤文王戈何晓健何晓健张柳
- 关键词：烟草黑胫病MIRNA功能分析
