张艳芳
- 作品数：13 被引量：60H指数：5
- 供职机构：内蒙古农牧业科学院更多>>
- 发文基金：内蒙古自治区农牧业科技创新基金内蒙古自治区自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 向日葵盐胁迫相关基因的cDNA-AFLP差异表达被引量：7
- 2015年
- 目的:研究向日葵盐胁迫前后基因表达的变化,分离并鉴定耐盐相关基因。方法:采用c DNA-AFLP技术分析盐胁迫产生的差异表达基因片段。结果:从256对引物组合中筛选到232对有差异表达的引物组合。用其进行选择性扩增,获得差异表达的上调TDFs 845条。经二次PCR扩增及反向Northern blot验证,获得42个阳性TDFs。对其中12个TDFs进行克隆及序列测定,得到10条TDFs核苷酸序列。经Blastx比对及功能分析,10个TDFs均与应答盐胁迫相关,涉及信号转导相关蛋白、胁迫相关功能蛋白、衰老相关蛋白以及与蛋白相互作用有关的蛋白。结论:利用c DNA-AFLP技术鉴定出一批盐胁迫应答基因,为揭示向日葵耐盐分子机制及指导向日葵耐盐分子育种实践奠定基础。
- 孙瑞芬张艳芳郭树春于海峰李素萍乔慧蕾聂惠安玉麟
- 关键词：向日葵盐胁迫CDNA-AFLP差异表达基因
- 番茄特异PCR遗传连锁图谱的构建及苗期耐盐QTL定位
- 土壤盐渍化是一个世界性问题,其中由于过量施用化肥,造成土壤尤其是蔬菜保护地次生盐渍化已是一个极其严重的现象,常防碍蔬菜作物的生长、发育,导致大幅度减产,产品品质下降。番茄作为一种重要的蔬菜作物和茄科研究的重要模式经济作物...
- 张艳芳
- 关键词：番茄遗传连锁图谱QTL
- 文献传递
- 向日葵ACC氧化酶基因(HaACO1)的克隆及表达分析被引量：5
- 2015年
- 目的：克隆向日葵中的ACC氧化酶基因（HaACO1）,并对其进行生物信息学分析及盐胁迫表达分析,为理解向日葵ACC氧化酶生理功能并加强对ACO基因的利用奠定基础。方法：以前期从盐胁迫的内葵杂4号根中获得的ACC氧化酶基因片段4-4-7TDF（KM823963）为基础,通过RT-PCR和5＇/3＇RACE技术克隆ACO基因的全长cDNA序列,利用生物信息学软件对获得的cDNA序列及编码的蛋白质序列进行分析。同时采用PCR方法克隆基因组DNA（genemic DNA,gDNA）序列,并对其进行结构分析。利用实时荧光定量PCR分析Na Cl胁迫下向日葵根、下胚轴、叶中HaACO1的表达量和不同NaCl浓度及不同胁迫时间下根中Ha ACO1的表达量。结果：Ha ACO1的cDNA序列全长为1 135bp,其开放阅读框为942bp,编码313个氨基酸。预测其分子质量和等电点分别为35.84k Da和5.13,基因登录号为KP966508。HaACO1与已报道的多种植物的ACO基因核苷酸序列及其推导的氨基酸序列有较高的相似性,分别为76%~83%和77%~88%。gDNA起始密码子至终止密码子序列长1 018bp,包含2个外显子和1个内含子,基因登录号为KP988289。实时荧光定量PCR分析表明向日葵HaACO1在不同器官及不同NaCl浓度、不同时间诱导下存在特异性表达差异。结论：获得的向日葵HaACO1是植物ACO家族成员之一,该基因应答盐胁迫具有独特的表达模式。
- 孙瑞芬张艳芳郭树春于海峰李素萍乔慧蕾聂惠安玉麟
- 关键词：向日葵盐胁迫基因表达
- 向日葵E3泛素连接酶基因克隆及表达分析被引量：4
- 2016年
- 该研究从向日葵中克隆了E3泛素连接酶基因HERC2,并进行了生物信息学分析和不同胁迫条件的表达分析。序列分析表明,HERC2(登录号为KT832066)序列的CDS为1 608bp,编码535个氨基酸,预测其分子量131kD,等电点为5.03。HERC2编码的蛋白质为疏水性蛋白质,且为细胞质蛋白;亚细胞定位预测分析表明,向日葵HERC2可能定位在高尔基体中;该蛋白质有5个RCC1保守结构域。向日葵HERC2与已报道的其他植物同源蛋白有相似的保守区域,与醉蝶花亲缘关系最近,而与大豆和野生大豆的亲缘关系最远。与HERC2cDNA对应的gDNA(登录号为KT832067)的ORF长度为3 409bp,与cDNA编码序列比对结果表明,该gDNA由5个外显子和4个内含子组成。实时荧光定量PCR分析表明,向日葵HERC2基因表达受非生物胁迫调节,在不同器官及不同非生物胁迫下存在特异性表达差异。研究认为,HERC2基因应答逆境胁迫具有其特定的表达模式,研究结果为加强对HERC2的利用奠定了基础。
- 张艳芳孙瑞芬郭树春于海峰石慧芹
- 关键词：向日葵E3泛素连接酶基因克隆基因表达
- 基于RNA-Seq技术的盐胁迫向日葵转录组信息分析被引量：13
- 2015年
- 本研究采用RNA-Seq技术,进行了120 mmol/L Na Cl胁迫下向日葵耐盐品种P50和盐敏感品种P29转录组测序和De novo组装。P50和P29分别获得106 275和119 350条unigenes,平均长度分别为716 bp和685 bp。2个样品的长序列聚类后,获得了110 751条All-unigenes,总长度为96 970 017 nt,平均长度为876 nt。对获得的All-unigenes进行功能注释,注释到NR、NT、Swiss-Prot、KEGG、COG和GO数据库的All-unigenes分别是71 610、52 569、50 827、46 676、32 215和52 406个,所有注释上的All-unigenes是77 536个。基于NR和KEGG的注释结果,对All-unigenes进行GO和KEGG功能分类,分别获得55个功能小类和128个Pathways注释。研究结果为进一步进行P50和P29转录组差异表达基因分析及耐盐相关基因挖掘奠定了基础。
- 孙瑞芬张艳芳郭树春于海峰李素萍聂惠乔慧蕾安玉麟
- 关键词：向日葵盐胁迫RNA-SEQUNIGENE
- 向日葵V-ATPasea3亚基基因的克隆及表达分析被引量：2
- 2017年
- 采用RACE技术,从向日葵P50中克隆V-ATPase a3亚基基因c DNA全长,并进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR分析不同浓度、不同时间的Na Cl、ABA和PEG模拟干旱胁迫条件下V-ATPase a3亚基基因的表达特征,以及相同胁迫条件下该基因在向日葵不同器官的表达特征。序列分析表明,该基因c DNA全长2 873bp,含5'-UTR 109bp、3'-UTR 295bp及编码区2 469bp,编码822个氨基酸,其编码蛋白质的理论分子质量为204.55k Da,等电点为6.29,Gen Bank登录号为KU315054。该基因编码的蛋白质为疏水性的跨膜蛋白,亚细胞定位预测其在质膜上。向日葵V-ATPase a3亚基与已报道的10种植物的V-ATPase a3亚基的同源蛋白有高度相似的保守区域,在进化上与朝鲜蓟的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR结果表明,向日葵受到Na Cl、ABA和PEG模拟干旱三种非生物胁迫后,V-ATPase a3亚基基因均上调表达,但表达模式不同,不同器官存在特异性表达差异。研究认为,V-ATPase a3亚基基因响应了向日葵非生物胁迫的应答,为加强对V-ATPase基因的利用奠定基础。
- 张艳芳孙瑞芬郭树春侯建华
- 关键词：向日葵V-ATPASE
- 番茄遗传转化体系的建立被引量：11
- 2008年
- 研究以番茄（Lycopersicon esculentum Mill.）栽培品种“中杂9号”、“毛粉802”和“合作908”为试材,通过对番茄茎段的离体培养,研究不同基因型以及不同激素组合对植株再生的影响。结果表明：以茎段为外植体时中杂9号和毛粉802更适合诱导再生植株形成;IAA与IBA比较,IAA利于芽的形成及正常芽的发育。其中中杂9号最适宜诱导愈伤组织和芽分化培养基为MS＋6-BA2.0mg/L＋IAA0.1mg/L、MS＋6-BA2.0mg/L＋IAA0.4-0.5mg/L,分化率均高达100%,毛粉802最适宜诱导愈伤组织和芽分化培养基为MS＋6-BA2.0mg/L＋IAA0.4-0.5mg/L,分化率高达100%。茎段外植体适宜的生根培养基为MS＋IAA0.5mg/L＋6-BA0.6mg/L,生根率高达80.8%。
- 张艳芳霍秀文苏彩霞刘杰才马立国牛洁
- 关键词：激素组合番茄茎段植株再生
- 油葵杂交种耐盐性鉴定及幼苗对盐胁迫的生理响应被引量：1
- 2016年
- 以油葵杂交种P6、P29、P65、S13和P50为试验材料,采用土培300、350和400 mmol/L 3个不同浓度Na Cl和水培100、120和150 mmol/L 3个不同浓度Na Cl胁迫处理的植株进行形态观察,并对水培120 mmol/L Na Cl胁迫处理第9天的植株进行耐盐性鉴定;水培120和150 mmol/L Na Cl胁迫处理,测定P50和P29的可溶性蛋白含量、Pro含量、MDA含量、SOD活性和POD活性5项耐盐相关生理生化指标,探讨不同油葵杂交种间对盐胁迫的响应差异。结果表明:1)5个油葵杂交种幼苗的耐盐性表现为P50>P65>P6>S13>P29。其中P50和P65的盐害指数分别为0和5.83%,为极强耐盐类型;S13和P6的盐害指数分别为40.28%和51.39%,为中度耐盐类型;P29的盐害指数为80.83%,为盐敏感类型。2)P50和P29品种间比较,5项指标呈现极显著差异;3)同一品种的不同浓度间比较,5项指标呈现极显著差异,不同浓度Na Cl胁迫下,随处理时间的延长,P50的可溶性蛋白含量呈现升高的趋势,P29呈先升后降的趋势;P50和P29的Pro含量、SOD活性和POD活性的变化趋势相似,呈现先升高后降低的趋势;P50和P29的MDA含量呈现升高的趋势。研究表明,盐逆境对油葵幼苗的生长有明显伤害,但P50与P29受到的伤害差异程度达极显著,整体上P50表现出对盐胁迫具有较强抗性。
- 张艳芳孙瑞芬郭树春侯建华
- 关键词：油葵盐胁迫耐盐性生理生化指标
- 向日葵盐诱导HD-Zip类转录因子HB-12的克隆及表达分析被引量：3
- 2017年
- HB转录因子家族基因在植物生长、发育、生物和非生物胁迫中发挥着重要作用。根据已知序列Unigene551_All设计引物,利用SMARTer RACE技术从向日葵中克隆了一个HD-Zip类转录因子HB-12,该基因全长cDNA序列821 bp,包括长度为573 bp的开放阅读框,编码190个氨基酸。预测该蛋白的分子量和等电点分别为22.55 kD和5.58,具有一个同源异型框结构域(homeobox domain,HD)和一个同源异型框结合类亮氨酸拉链结构域(homeobox associated leucine zipper domain,HALZ),属于向日葵HD-ZipⅠ类蛋白,基因登录号为KU315052。HB-12蛋白不存在跨膜域,亚细胞定位预测其可能位于细胞核。聚类分析发现向日葵HB-12与茄科作物马铃薯和番茄HB-12基因亲缘关系较近。利用PCR技术扩增了HB-12全长cDNA对应的g DNA序列,该序列自起始密码子ATG至终止密码子TAA长度为652 bp,由2个外显子和1个内含子组成,基因登录号为KU315053。Real-time PCR结果表明,HB-12在向日葵根、下胚轴和叶中的表达存在器官特异性,且受盐、ABA及PEG的诱导表达。HB-12基因的克隆及表达分析为向日葵抗逆分子育种和功能研究奠定了基础。
- 孙瑞芬张艳芳郭树春于海峰李素萍聂惠安玉麟
- 关键词：向日葵HD-ZIP胁迫
- 向日葵rRNA基因克隆及其染色体定位研究被引量：4
- 2014年
- 该研究以内葵杂3号三交种为材料,采用同源序列法克隆了5S rRNA和18S rRNA基因并进行了序列测定,测得片段长度分别为515 bp和1 808 bp。以5S rRNA、18S rRNA和45S rRNA基因为探针,分别与内葵杂3号三交种染色体进行荧光原位杂交(FISH)分析。结果表明:45S rRNA和18S rRNA基因均得到3对杂交信号且位点分布相同,分别位于第3对和第10对染色体及第2对随体染色体的短臂末端;5S rRNA基因的信号位点共有2对,分布在第7对和第10对染色体短臂端部。
- 高猛安玉麟孙瑞芬张艳芳
- 关键词：向日葵染色体RRNA基因
