张香娣 作品数:76 被引量:446 H指数:11 供职机构: 中国农业科学院棉花研究所农业部棉花遗传改良重点开放实验室 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 经济管理 更多>>
棉花抗黄萎病QTL初步定位 被引量:14 2010年 本研究以高抗黄萎病的海岛棉品种海7124和高感黄萎病的陆地棉品种邯郸14组配的F2群体184个株系,构建了一个分子标记遗传连锁图,包括了142个位点和30个连锁群,标记间的平均距离为8.24cM,全长1169.6cM,覆盖棉花总基因组约23.4%。用复合区间作图分析共检测到12个抗黄萎病相关QTL,其中田间抗病性检测到不同时期7个病情指数相关QTL,1个病株率相关QTL,温室苗期抗病性定位4个病株率相关QTL。从绝对量上看,各QTL加性效应从2.20到42.39,显性效应从1.65到32.25,解释表型变异1.09%~22.73%,且田间抗病性获得的QTL与温室苗期抗病性得到的QTL基本相同,其中qFDI711-30-0.01位点距MUSS294仅为0.01cM,加性效应较高解释表型变异22.32%,这对于培育优质抗病材料用于标记辅助育种具有一定的参考价值。 吴翠翠 简桂良 王安乐 刘方 张先亮 宋国立 黎绍惠 陈朝辉 王春英 张香娣 王坤波关键词:棉花 黄萎病 SSR QTL 适用于棉花荧光原位杂交的DNA纤维高效制备技术 被引量:6 2009年 棉花富含酚类和多糖等高分子次生化合物,细胞质浓厚,且染色体形态小、数目多、制片困难,至今还未见棉花DNA纤维制备方面的报道。本研究用"刀切引流法",在含有Triton X-100和PVP40的冰冷细胞核提取缓冲液中,用锋利的刀片切割发育一周的棉花黄化子叶以释放棉花细胞核,所得细胞核干净完整杂质少,不需要研磨和巯基乙醇等处理,方便快捷无毒害,成功率达到100%。细胞核在室温下经温和碱裂解去除染色质上的蛋白质后,以前端导引裂解液铺展载玻片,即"引流法"拉伸制备DNA纤维,避免了液体表面张力的影响,消除了因载玻片推抹用力不均而导致的DNA纤维堆积和断裂,所制备的DNA纤维平直完整、伸展程度均匀、背景清晰。用基因组和45S rDNA分别标记探针进行杂交,结果表明所制备的棉花DNA纤维适用于荧光原位杂交。本研究探索出一套简单、高效、快捷、无毒害的适宜于棉花荧光原位杂交的DNA纤维制备技术,必将为棉花基因组研究和全基因组序列的最终完成提供强有力的技术支持。 彭仁海 宋国立 刘方 黎绍惠 王春英 张香娣 王玉红 王坤波关键词:棉花 荧光原位杂交 DNA纤维 棉花转基因材料的获得及主要农艺性状变异分析 被引量:5 2009年 利用不同棉花受体材料进行花粉管通道法遗传转化研究。通过卡那霉素鉴定、抗虫性鉴定和PCR分子生物学鉴定,证明已成功将Bt基因转化到泗棉3号、辽棉15、中棉所19、中棉所29母本、中棉所35、中棉所36等棉花材料中。通过对转基因材料后代与非转基因材料的铃重、衣分和纤维品质等差异分析,发现花粉管通道转基因后代材料存在广泛的变异。 刘方 王坤波 宋国立 黎绍惠 王春英 张香娣 王玉红 胡育昌关键词:棉花 花粉管通道 转基因 检测与评价农作物SSR分子标记冗余性的方法 本发明涉及生物信息学领域,具体地,涉及检测与评价农作物SSR分子标记冗余性的方法。根据本发明的方法同时可以分析一对引物的正向和反向序列冗余性,另外在电泳水平及测序序列水平进行同时验证。现有方法只能分析一对引物的正向或反向... 王为 王坤波 刘方 王长彪 王春英 张香娣 王玉红文献传递 棉花新材料中G5主要特点 被引量:3 2000年 王坤波 崔荣霞 王春英 黎绍惠 宋国立 张香娣 胡绍安关键词:棉花 生物学特性 棉花BAC文库快速筛选法 被引量:2 2012年 目的:构建棉花细菌人工染色体(Bacterial Artificial Chromosome,BAC)文库的快速筛选法,以期从BAC文库中大量、快速、高效筛选出特定BAC克隆,为从事基因组测序、分离和分析特定基因、构建物理图谱及基因图位克隆等生物学技术研究奠定基础。方法:构建了整板、行、列的三维混合池,以菌液PCR为基础,从BAC文库中筛选出含有特定DNA片段的BAC单克隆。结果:从BAC文库的3 456个克隆中,共筛选出16个阳性单克隆,涉及13条染色体、11个SSR标记。结论:该文构建的棉花BAC文库筛选体系,筛选快速、准确,适合从BAC文库中大量筛选BAC单克隆。结合当前的多种BAC文库筛选方法进行探讨,根据不同的实验目的选择更合适的筛选方法和操作步骤。 程华 彭仁海 张香娣 刘方 王春英 王坤波关键词:棉花 BAC文库 棉花非冗余性EST-SSR新标记的开发及其评价 被引量:7 2012年 利用ClustalX等软件对公共数据库现有的393753条棉花EST序列分析,得到349815条非冗余EST序列,借助自主开发的SSRmine软件共发掘SSR位点11372个,分布于10507条EST中,EST-SSR的频率是3%,平均相隔21kb出现一个SSR。在2~6bp的重复基元中,三核苷酸和六核苷酸分别占34.1%、40.6%,二、三、四、五和六核苷酸基序分别以AG/CT、AAG/CTT、AAAT/ATTT、AAAAG/CTTTT和AAAAAG/CTTTTT的类型最多。利用去冗余的且在亚洲棉、陆地棉、海岛棉中没有被开发过的410条EST序列设计开发了200对非冗余性SSR引物,利用自主开发的SSRD软件通过SSR引物序列下载、预处理、Blastn、提取相似性分值≥81%的引物编号、提取引物冗余对、冗余引物写成一行6个步骤去除来源于自身部分同源序列以及与CMD释放的不同棉种相似性SSR引物,得到了非相似性引物,定名为CRIXXX(CRI即Cotton Research Institute)。并分别选用棉花12个种的代表性材料对其中100对进行引物功效评价,包括多态信息含量(polymorphism information content,PIC)及引物通用性研究。结果显示,从自主开发的100对SSR引物筛选出56对均能在12份材料间扩增出稳定明显的条带,其中多态性引物35对,多态率占35%。引物的PIC变幅为0.097~0.888,平均为0.482;1对海岛棉EST-SSR引物在12份材料间的通用性为100%,25对亚洲棉引物通用性为81%,74对陆地棉引物通用性为80.1%。 王为 王长彪 刘方 陈浩东 王琳 王春英 张香娣 王玉红 王坤波关键词:棉花 EST-SSR标记 冗余性 多态性 陆地棉QTG对杂种优势贡献的初步分析 被引量:1 2010年 利用一套陆地棉RIL群体QTL定位的结果,结合随机抽取的第116,118株系DNA重组片段来源以及它们田间性状对QTLs的关联分析,基于QTG层面探讨了纯合DNA因子对杂种优势的贡献,试图总结出"显性+超显性+上位性"的观点,即加性及加性上位性是杂种优势的遗传基础,而显性、超显性、上位性仅为杂种优势的作用方式.结合本研究检测到的杂种优势,简要总结了杂种优势的分子机理,并以该2个株系为例进行详解:在连锁群LG01和LG03上的上半部平均长度分别来自母本、父本的加性上位性QTLs,对应于2位点均来自母本的加性上位性QTLs可产生2.99~3.52的差异.单株铃数受2对加性上位性QTLs控制,存在于LG02和LG07上正反互作的加性上位性QTLs可产生0.86的差异.依据加性效应遗传特点可初步提出构建棉花"超级杂交种"的设想. 张先亮 刘方 王为 黎绍惠 王春英 张香娣 王玉红 王坤波关键词:陆地棉 杂种优势 棉花花粉管通道转基因自交方法改进 被引量:2 2003年 刘方 黎绍惠 宋国立 张香娣 王春英 王坤波关键词:棉花 花粉管通道 转基因技术 棉花显性无腺体基因的分子标记 本发明涉及一种利用RAPD技术筛选棉花显性无腺体基因的分子标记的方法,包括步骤:a)利用近等基因系显无种12株系棉花(显无中12),与中棉所12株系(中12)进行杂交,F1代自交产生F2代;b)用CTAB法提取F2(显无... 王坤波 宋国立 黎绍惠 刘方 王春英 张香娣 蒋晓燕文献传递