曹隽喆
- 作品数：13 被引量：28H指数：2
- 供职机构：大连理工大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国博士后科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学理学医药卫生更多>>
- 基于时空数据模型的城市级PM2.5浓度预测方法
- 本发明属于多学科和技术相互交叉结合的应用领域，具体涉及一种基于时空数据模型的城市级PM2.5浓度预测方法。首先利用开发的在线数据采集系统采集城市级PM2.5浓度数据；综合考虑模型可解释性、数据易获得和模型复杂度，确定最佳...
- 秦攀陈丽顾宏曹隽喆
- 文献传递
- 基于机器学习的多定位点蛋白质亚细胞定位预测方法研究
- 蛋白质的亚细胞定位信息对于推断蛋白质功能、了解细胞的生命活动、药物发现、以及疾病诊断等方面的研究具有重要的作用。近十年间蛋白质序列数量迅速增长,基于智能计算的蛋白质亚细胞定位预测方法已成为系统生物学和生物信息学等领域的一...
- 曹隽喆
- 关键词：蛋白质亚细胞定位预测
- 文献传递
- 基于最近邻区间的不完整基因表达数据多目标聚类算法被引量：1
- 2021年
- 针对不完整基因表达数据的聚类问题,提出了一种多目标NSGA-Ⅱ框架下缺失值填补与聚类协同优化的算法.算法根据欧式距离确定不完整基因的近邻基因,以缺失值的最近邻区间为约束,采用混合编码将缺失值填补与聚类中心优化融入NSGA-Ⅱ进化过程,通过将数据集的统计信息与聚类结果共同作为缺失值填补因素,提升不完整基因表达数据的填补准确度及聚类性能.在多个基因表达数据集上的实验结果表明,所提算法得到了更接近真实表达值的填补结果及更紧凑的聚类效果,且聚类结果具有统计显著性.
- 常巧珍曹隽喆顾宏李丹
- 关键词：基因表达数据缺失值
- 一类宏观经济系统及其线性二次型最优控制
- 应用现代控制理论和方法来研究经济系统的演变规律和最优控制的学科称为经济控制论，是控制论的一个重要分支。经济控制论的内容包括经济系统的建模、仿真、辨识、估计以至最优控制或次优控制。它强调用整体的、动态的、相互联系和协调发展...
- 曹隽喆
- 关键词：经济控制论宏观经济系统最优控制线性二次型
- 文献传递
- 一种基于基因突变频率的癌症驱动基因的筛选方法
- 本发明公开了一种基于基因突变频率的癌症驱动基因的筛选方法，属于癌症医学领域。该方法包含如下步骤：(1)肿瘤基因突变数据获取；(2)突变数据预处理；(3)筛选每个基因的邻近基因；(4)计算每种突变的背景突变数据；(5)根据...
- 顾宏秦尤秦攀曹隽喆
- 基于计算方法的抗菌肽预测被引量：7
- 2017年
- 抗菌肽是由生物体免疫系统所产生的能抵抗微生物感染的一种小分子多肽,因其具有高效低毒的广谱抗菌活性且几乎无耐药性问题,被看做是抗生素的最佳替代品,对解决抗生素滥用问题具有重要的意义.抗菌肽预测是生物信息学的一个重要研究内容,对抗菌肽及其抗菌功能进行预测能有效帮助了解抗菌肽的作用机理,为抗菌肽药物的设计和改造提供理论依据.基于计算方法的抗菌肽预测是采用数学理论、计算机技术和生物信息学方法,通过对抗菌肽数据的分析来挖掘出抗菌肽的生物特征和抗菌活性之间的关联,从而自动地对抗菌肽的类别做出推断.由于不依赖于生物实验,而是依靠有效的算法和计算机的高速计算能力来完成预测工作,计算方法具有高效快捷、成本低廉等特点,且具有良好的可操作性和批量处理能力,非常适合大规模预测任务,因此已经引起了国内外学者越来越多的关注.文中对国内外的相关研究成果进行了阐述和总结,包括抗菌肽生物信息数据库、主流的预测方法和预测方法的性能检验等.抗菌肽数据库是专门针对抗菌肽建立的数据库,收录了大量的抗菌肽数据,使用者不仅可以从中提取所需要的信息,还可以使用数据库所提供的各类在线工具对数据进行处理.文中对常见的一些抗菌肽数据库进行了介绍,给出相关数据库的数据收录情况、功能特点和网址链接等,以方便读者查询使用.接着文中介绍了目前主要使用的抗菌肽预测方法,包括基于经验分析的预测方法和基于机器学习的预测方法,前者是根据已知的经验规则或者模式对某类抗菌肽的一些生化属性和抗菌活性之间的关联进行统计或建模来对该类抗菌肽进行识别,而后者则是利用机器学习技术,通过对抗菌肽的已知数据信息进行学习,建立合理的预测算法从中找出抗菌肽的特点和规律,并将�
- 曹隽喆顾宏
- 关键词：计算方法特征提取
- 基于多标签直推学习的抗菌肽及其抗菌功能预测
- 2017年
- 抗菌肽是广泛存在于生物体内的一类具有广谱抗菌作用的天然多肽,因其不易导致细菌耐药性,已成为医药界开发新型抗菌制剂的主要选择,识别出更多的抗菌肽并预测其抗菌功能具有重要意义.提出了一种基于多标签直推学习的抗菌肽及其抗菌功能的预测方法,该方法利用K-spaced氨基酸对组成方法提取多肽特征,采用多标签学习框架和加权近邻图构建直推预测模型,通过对有标签训练样本和无标签待测样本的共同学习来提升预测性能.该方法不仅能够识别多肽是否为抗菌肽,还能同时预测出抗菌肽所具有的单种或多种抗菌功能,且适用于对多效抗菌肽和普通抗菌肽的预测.数值实验表明,与已有的iAMP-2L预测方法相比,所提方法在全局预测精度和多标签预测性能上均有较大提升.
- 布晓婷曹隽喆顾宏
- 关键词：抗菌肽
- 基于深度学习和影响函数法的机翼非定常流场预测
- 2023年
- 为兼顾非定常流场求解的精度与速度,基于深度学习和影响函数法,提出了一种机翼非定常流场特性预测方法,将影响函数嵌入深度学习网络的训练过程中,并引入早停机制和Dropout机制,实现了机翼流场参数的快速预测。结果表明,该方法具有较高的预测精度并且其计算效率较CFD方法有大幅提高。
- 于煜斌落龑寿缪佶曹隽喆李京杰
- 关键词：卷积神经网络影响函数非定常流场机翼
- 一种基于基因突变频率的癌症驱动基因的筛选方法
- 本发明公开了一种基于基因突变频率的癌症驱动基因的筛选方法，属于癌症医学领域。该方法包含如下步骤：(1)肿瘤基因突变数据获取；(2)突变数据预处理；(3)筛选每个基因的邻近基因；(4)计算每种突变的背景突变数据；(5)根据...
- 顾宏秦尤秦攀曹隽喆
- 文献传递
- 一种新的蛋白质亚细胞定位预测训练集构造方法被引量：2
- 2012年
- 设计了一种新的蛋白质亚细胞定位预测训练集构造方法.该方法针对传统预测方法缺乏足够的实验标记数据的问题,基于主动学习策略从非实验标记蛋白质数据中主动选择有效数据,并与原有的实验标记数据共同训练预测模型,以提高基准分类器的预测精度.结合支持向量机分类器,该方法在病毒蛋白质独立测试集上进行了预测实验,测试结果表明,该方法能够有效地提高基准分类器的预测能力,性能优于现有的病毒蛋白质预测系统.
- 曹隽喆顾宏贺建军
- 关键词：生物信息学蛋白质亚细胞定位
