朱玉山
- 作品数：28 被引量：14H指数：2
- 供职机构：清华大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：化学工程生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 使用ProdaMatch匹配算法搜索用于酶设计的蛋白质骨架
- 计算酶设计可用于针对没有天然酶催化的化学反应来快速开发新酶。它的一个步骤是将一定的催化活性位点模型匹配到合适的蛋白质骨架中。为提高残基和过渡态安装的准确度,我们提出复杂活性位点模型（图1）。其他匹配算法无法克服多残基匹配...
- 黄小强薛靖林敏朱玉山
- 基于结构建模与分子对接的β-内酰胺酶活性位点设计研究
- 为了进一步研究蛋白质设计的原理，特别是酶催化位点的设计，本课题的研究选择TEM型β-内酰胺酶和头抱菌素作为研究对象，通过结构建模及分子对接，来研究β-内酰胺酶不同突变株与不同结构头抱菌素的结合情况，分析其活性位点突变的规...
- 金瑶华杨继朱玉山
- 关键词：Β-内酰胺酶活性位点分子对接
- 基于分段线性的原油混输调度全局优化算法研究
- 2013年
- 随着激烈的市场竞争,原油混输调度问题成为炼油企业提高核心竞争力的重要环节。有效的原油混输调度策略能够在保证成品油质量的同时,快速响应市场竞争,节约成本,提高收益。本文使用了混合整数非线性规划(MINLP)模型来描述原油混输调度问题,并且对模型进行了与实际操作更为相符的改进,提出了基于分段线性化的求解非凸混合整数非线性规划问题的算法。将非凸的双线性项进行分段线性化可以使非凸的混合整数非线性规划模型近似等价为1个凸的混合整数二次规划(MIQCP)模型,通过使用凸二次规划基于的分支定界算法得到调度问题的近似全局最优解,实现原油混输调度中从港口油轮,到输油管道或存储罐,最后到达分离单元过程的卸载、存储等过程的优化操作。本文通过6个实例验证了文中改进的模型和提出的算法的有效性。结果表明,本文改进的模型和提出的算法可以获得原油混输调度问题的有效调度方案,解决分离单元(CDU)上料不连续、罐内与上料浓度不一致的问题,而且本算法求得的近似全局最优解可以保证在12%的范围内。
- 张帆朱玉山
- 关键词：混合整数非线性规划分段线性化全局优化
- 一种杂合酶P450sca2-BMR及其编码基因与应用
- 本发明公开了一种杂合酶P450sca2-BMR及其编码基因与应用。该蛋白是如下1)或2)的蛋白质：1)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质；2)将序列表中序列2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或...
- 林章凛朱玉山巴丽娜张玲玲
- 文献传递
- 玉米赤霉烯酮水解酶ZHD101突变体及利用该突变体水解玉米赤霉烯酮的方法
- 本发明涉及玉米赤霉稀酮水解酶ZHD101突变体及利用该突变体水解玉米赤霉烯酮的方法。所述突变体是通过在野生型玉米赤霉稀酮水解酶ZHD101的三个关键位点处引入突变而得到。本发明中的ZHD101突变体与野生型ZHD101相...
- 佟毅陈博朱玉山林敏苏会波王靖唐堂杨鑫吴延东赵雪松
- 文献传递
- 基于异步时间段的原油混输调度连续时间建模研究被引量：10
- 2007年
- 采用严格的数学规划方法对沿海炼厂的原油混输调度问题进行了建模和求解,提出了一个基于异步时间段的连续时间混合整数非线性规划(MINLP)数学模型。该模型具有整型变量少,求解快的优点。采用求解一系列MILP来近似求解非凸的MINLP,避免了原油混输MILP模型产生的浓度不一致问题。文中采用提出的新模型和算法对文献中的9个实例进行了计算,相同计算条件的4个实例比离散时间模型效率提高86％-1011％。
- 胡益炯朱玉山
- 关键词：调度原油混输MILPMINLP
- 头孢菌素酰化酶的研究进展被引量：1
- 2009年
- 头孢菌素酰化酶是一类可以催化头孢菌素C(CPC)和戊二酰-7-氨基头孢烷酸(GL-7ACA)生成7-氨基头孢烷酸(7-ACA)的抗生素工业用酶。后者是工业半合成生产头孢类抗生菌素所需的重要前体。综述了该酶的分布、酶学特性、克隆和表达、分离纯化及固定化等方面的研究进展,并展望了其应用前景。
- 赵娟李晋平张建安朱玉山
- 关键词：头孢菌素7-氨基头孢烷酸
- 头孢菌素酰化酶突变体及其编码基因与应用
- 本发明公开了头孢菌素酰化酶突变体及其编码基因与应用。本发明所提供的头孢菌素酰化酶突变体为如下a1)或a2)或a3)或a4)所示的蛋白质：a1)氨基酸序列是序列表中序列2所示的蛋白质；a2)氨基酸序列是序列表中序列4所示的...
- 朱玉山田野黄小强
- 文献传递
- 重组大肠杆菌BL21(DE3)/pET-S12表达头孢菌素酰化酶的诱导条件优化
- 2012年
- 头孢菌素酰化酶AcyⅡ可以直接水解CPC生成7-ACA,后者是重要的医药中间体,用来合成头孢类抗生素。头孢菌素酰化酶S12是AcyⅡ的突变体,其催化效率比AcyⅡ高。本文通过优化头孢菌素酰化酶S12在大肠杆菌BL21(DE3)中的诱导表达条件,为确定周期短、产率高且稳定可靠的发酵工艺奠定基础。利用单因素和正交设计对装液量、接种量、诱导时间,诱导温度和IPTG浓度等发酵条件进行了考察。单因素结果表明:装液量为25mL/250mL三角瓶,接种量1%,指数生长开始加入0.05mM IPTG,28℃诱导20小时发酵液酶活最高;正交试验结果表明:装液量50mL/250mL三角瓶,接种量2%,指数生长开始加入0.05mM IPTG,诱导28℃且诱导24hours酶活最高,发酵液产酶水平达639.9U/L。方差分析结果显示,发酵时间和装液量对酶活影响极显著,诱导时机对酶活影响显著,接种量对酶活没有显著影响。验证实验发现,发酵液产酶水平最高可以达到802.9U/L。本实验为该工程菌的发酵研究提供了最佳的表达诱导条件,对下一步的研究具有指导意义。
- 任羽张建安朱玉山
- 关键词：发酵正交试验设计
- 基于氢键的蛋白质与配体的对接算法研究
- 在计算机辅助工业酶设计,药物设计,蛋白质折叠等领域的研究中,常常涉及到蛋白质与小分子对接的问题。即已知蛋白质与配体小分子的结构,需要计算蛋白质与配体小分子能否对接,以及结合能的高低。一个好的对接计算方法必须要满足两方面的...
- 罗文嘉母斌朱玉山
- 关键词：氢键蛋白质药物设计
- 文献传递
