李嘉平
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：湖南农业大学生物安全科学技术学院更多>>
- 发文基金：湖南省科技重大专项国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 转录因子结合位点共现研究进展被引量：1
- 2012年
- 在启动子区域中,通常存在多个转录因子结合位点(transcription factor binding site,TFBS)与不同或相同的转录因子结合。这些TFBS,不但将转录因子与目标基因联系起来,还间接提供了转录因子间协同作用的线索。而转录因子间的协同作用,是转录调控网络的重要组成部分。因此,识别在一个启动子区域同时出现的多个TFBS是构建转录调控网络的重要途径。在启动子区域成对出现的TFBS,通常用配对模体(motif pair)来表示。由多个TFBS构成的调控区域则通常被称为顺式调控模块(CRM,cis-regulatory modules)。配对模体与CRM的识别算法利用了它们的保守性、位置与距离偏好性以及调控基因共表达等特性提高识别的准确性。根据TFBS的共现构建转录调控网络仍然具有较大的局限性,多种不同数据来源的整合是未来的研究方向。
- 李嘉平张先文陈信波
- 关键词：转录因子结合位点转录调控网络
- GEO水稻相关基因表达数据研究现状
- 2012年
- 水稻基因表达数据为深入研究水稻基因的表达调控提供了必要的条件。GEO(Gene Expression Omnibus)数据库目前已经积累了相当数量的水稻基因表达数据,但没有相关的数据统计信息。针对GEO数据库中与水稻相关的平台、样品、系列数据进行了统计和总结,综述了目前的研究动态,以及未来的发展趋势,为新研究的开展提供了参考。
- 李嘉平张先文陈信波
- 关键词：GEO水稻基因表达数据
- 基于芯片数据的水稻非生物逆境相关基因筛选及其启动子分析
- 干旱、盐、高温与低温等水稻非生物逆境可严重影响水稻的生长发育并降低水稻的品质和产量。表达基因芯片分析是在转录组水平研究基因表达情况的最佳工具。GEO数据库中已经累积了海量的基因表达数据,本文探讨了如何将这些数据整合起来,...
- 李嘉平
- 关键词：基因芯片顺式调控元件水稻启动子
- 文献传递
