李琦
- 作品数:4 被引量:9H指数:2
- 供职机构:宁夏大学物理电气信息学院更多>>
- 发文基金:宁夏回族自治区自然科学基金宁夏回族自治区科技厅科技攻关项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响被引量:7
- 2012年
- [目的]探讨当前主要的DNA序列映射方法对蛋白质编码区的预测准确率的影响,寻找有效的映射方法。[方法]以AC(Approxi-mate Correlation)为碱基层的预测准确率的测度,采用FIR(Finite Impulse Response)窄通带滤波器预测算法研究各种映射方法对预测准确率的影响。[结果]在ALLSEQ和HMR195 2个DNA序列集上,Voss法和Z-curve方法是较PN(Paired Numeric)法、EIIP(Electron-IoInteraction Potential)法和复数法更为有效的映射方法。[结论]该研究结果为用预测结果的AC值来验证新映射方法的有效性奠定了基础,对利用生物信息学方法正确揭示DNA序列的结构具有重要意义。
- 马玉韬张成杨泽林李琦杨婷
- 关键词:蛋白质编码区映射方法加窗
- DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响(英文)
- 2011年
- [目的]探讨当前主要的DNA序列映射方法对蛋白质编码区的预测准确率的影响,寻找有效的映射方法。[方法]以AC(Approximate Correlation)为碱基层的预测准确率的测度,采用FIR(Finite Impulse Response)窄通带滤波器预测算法研究各种映射方法对预测准确率的影响。[结果]在ALLSEQ和HMR195 2个DNA序列集上,Voss法和Z-curve方法是较PN(Paired Numeric)法、EIIP(Electron-Io Interaction Potential)法和复数法更为有效的映射方法。[结论]该研究结果为用预测结果的AC值来验证新映射方法的有效性奠定了基础,对利用生物信息学方法正确揭示DNA序列的结构具有重要意义。
- 马玉韬张成杨泽林李琦杨婷
- 关键词:蛋白质编码区映射方法加窗
- 基于SSR分子标记的宁粳28籼粳成分分析被引量:2
- 2011年
- [目的]为杂交水稻育种提供科学依据。[方法]以水稻品种宁粳28为试验材料,选取分布于水稻12个连锁群上的136对SSR引物,以2个测序品种日本晴和9311分别为典型粳稻与籼稻标准,利用SSR分子标记技术分析3个品种在DNA水平上的多态性差异,研究宁粳28粳稻与籼稻成分在染色体上的分布。[结果]宁粳28叶片DNA的PCR扩增产物经5%琼脂糖凝胶电泳后,16个标记位点为偏籼稻带型(大多数位点分布于3、5、8号染色体上),4个标记位点无多态性,8个标记位点为籼粳中间型,其余107个标记位点为偏粳稻带型。[结论]宁粳28为典型的粳稻,其籼稻成分只占被抽查位点的9.56%。
- 陈晓军李琦王敬东马洪文殷延勃宋玉霞
- 关键词:SSR分子标记籼粳稻
- 新型植物生长调节剂PROHYDRKJASMON(PDJ)对肉苁蓉寄生生长影响的研究
- 陈晓军李苗马洪爱甘晓燕陈虞超张丽税军峰郭生虎关雅静王敬东石磊李琦李霞宋玉霞马永清
- 该项目通过与日本国宇都宫大学合作,引进了新型植物生长调节剂Prohydrojasmon(PDJ),研究了PDJ对肉苁蓉种子萌发的影响及对促进肉苁蓉寄生、提高寄生率的作用;确定了肉苁蓉种子的萌发、寄主树龄的选择、最佳接种时...
- 关键词:
- 关键词:调节剂植物生长肉苁蓉寄生