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樊红: 作品数：88 被引量：105H指数：5; 供职机构：东南大学更多>>; 发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金江苏省高等教育教改立项研究课题更多>>; 相关领域：医药卫生生物学文化科学农业科学更多>>

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DNMT 3A在肿瘤发生中表遗传调控作用的研究进展被引量：1: 2012年; DNA甲基化(DNA methylation)是基因组表观遗传修饰的重要组成部分,在细胞正常功能维持、个体胚胎发育及人类疾病发生等方面起到重要作用。在肿瘤发生中,DNA甲基转移酶3A(DNMT 3A)可以与细胞内的转录因子、组蛋白甲基转移酶以及MicroRNA作用,共同完成对肿瘤相关基因的调控。作者对近年DNMT 3A与三者间关系方向的研究作一综述。; 崔鹤樊红; 关键词：DNA甲基化肿瘤基因表达调控

DNA甲基转移酶3A siRNA真核表达载体的构建和鉴定: 2008年; 目的:构建DNA甲基转移酶3A(DNA methyltransferases 3A,DNMT3A)siRNA重组质粒稳定表达载体,为进一步探讨DNMT3A在多种生物学过程及肿瘤发生发展中的机制提供工具。方法:依据DNMT3A基因的cDNA序列,利用siDESIGN软件获得RNAi靶位点后设计出对应的siRNA寡核苷酸模板,体外合成寡核苷酸片段经退火形成短双链,克隆到真核表达载体pSUPER-EGFP1中,构建DNMT3A siRNA重组质粒载体,经酶切鉴定后转染人肝癌细胞系SMMC-7721,荧光实时定量PCR初步分析DNMT3A经RNA干涉后的沉默效应。结果:成功构建了靶向DNMT3A基因的siRNA重组稳定表达载体,此载体有效地降低了肝癌细胞系中DNMT3A基因的表达水平。结论:通过该方法初步确定了沉默DNMT3A基因的较佳靶点。; 赵主江樊红单云峰张建琼; 关键词：SIRNA

DNMT3A siRNA稳定表达载体的构建及其沉默效率的鉴定: ＜正＞构建能在肝癌细胞系中稳定抑制DNMT3A表达的RNA干扰载体。利用Dharmacon siDESIGN软件设计DNMT3A基因特异性的siRNA序列及对照序列,人工合成后插入pSUPER-GFP载体,构建三个DNM...; 赵主江单云峰樊红程欲超成建权艳梅张建琼谢维; 关键词：DNMT 肝癌细胞系 RNA干扰; 文献传递

胃癌化疗药物敏感性的检测方法、试剂盒及NSUN2检测的应用: 本发明涉及生物技术领域，尤其是胃癌化疗药物敏感性的检测方法、试剂盒及NSUN2检测的应用，现提出如下方案，胃癌化疗药物敏感性检测试剂盒包括针对NSUN2基因的扩增引物和NSUN2基因的干扰序列，试剂盒中的试剂还包括顺铂和...; 樊红沈小慧李懿萍; 文献传递

DNMT3B基因启动子C46359T多态性与食管癌易感性的关联分析被引量：4: 2008年; 目的：探讨DNMT3B基因启动子C46359T单核苷酸多态性与江苏汉族人群食管癌易感性的关系。方法：提取195例食管癌患者及189例健康体检人员外周血基因组DNA，采用PCR—RFLP结合DNA测序技术检测DNMT3B基因启动子C46359T单核苷酸多态性。结果：正常对照DNMT3BC46359T等位基因TT／CT基因型频率为98．9％／1．1％，病例组为97．9％／2．1％，在对照组与病例组中均未检测到DNMT3B 46359 CC基因型。携带DNMT3B 46359 CT等位基因的个体与对照组相比，其患食管癌的易感性未见明显升高（P=0．43，OR=1．96，95％CI：0．35—10．82）。对比江苏汉族人群和英国、美国白种人群，DNMT3B C66359T单核苷酸多态性频率分布有明显差异（P〈0．01）。结论：DNMT3B基因CA6359T多态性可能不适合作为中国汉族人群食管癌易感性的一个独立风险因素，此位点多态性的分布在不同人种间有显著差异。; 刘东声张淑红胡嘉波张凤赵主江樊红; 关键词：DNA甲基转移酶3B 食管癌单核苷酸多态性

肿瘤发生中的表遗传学机制研究进展被引量：1: 2004年; 表遗传学现象广泛地存在于各种生物中,而DNA甲基化作用引起基因转录沉默是表遗传现象形成的重要机制。现发现肿瘤中存在的表遗传改变主要包括普遍性低甲基化、个别基因的低甲基化、区域性CpG岛的高甲基化以及印记丢失。这些改变的最直接的原因为DNMTs的高表达和甲基化作用下游作用因子的参与。因此,研究肿瘤中DNA甲基化转移酶及其相互作用因子,将为肿瘤表遗传学的研究揭开新的一页。; 樊红单祥年; 关键词：肿瘤表遗传学 DNA甲基化转录调控基因沉默

PITX1的表达减低促进胃癌细胞的5-FU耐药作用研究: 目的：PITX1为转录因子,对肿瘤细胞的生长起抑制作用.本研究探讨PITX1表达降低与胃癌细胞5-FU治疗效果的关系.方法：应用6株胃癌细胞系,确定5-FU药物的IC30工作浓度,随后分组处理胃癌细胞系AGS、BGC-8...; 沈小慧乔凤昌樊红; 关键词：胃癌凋亡 PDCD5 5-FU

粘附分子EPCAM表达的表遗传调控机制的研究: 很多肿瘤的发生发展都与原癌和/或抑癌基因的异常功能状态有关,DNA甲基化和组蛋白甲基化作用等表观遗传修饰通过调控肿瘤相关基因的表达,参与了肿瘤发生发展的过程.DNA 甲基转移酶3A2(DNMT3A2)作为甲基转移酶在个体...; 胡莹崔鹤张少丹赵主江樊红; 关键词：EPCAM

结合消减杂交筛选肝癌细胞系中差异甲基化位点: 2006年; 为探索有效分离两样品间差异甲基化片段的方法,以DNMT1(DNAmethyltransferase1,DNMT1)表达抑制前后的肝癌细胞系7721-sMT1和7721-pMT1为研究对象,结合消减杂交和磁珠分离的方法,在两细胞系全基因组DNA范围内进行扫描差异性甲基化片段;将这些片段进行生物信息学分析,发现所获38条差异甲基化片段分布于不同的染色体上,但集中于重复序列、基因的启动子区,此特点符合DNA甲基化位点分布规律。实验结果证明消减杂交结合磁珠分离的方法,能筛选出两样品间的差异甲基化片段,该方法的建立为筛选肿瘤细胞中特异性差异甲基化片段作为肿瘤诊断的标志物提供了可能性。; 樊红程欲超赵主江权艳梅成建; 关键词：消减杂交表观遗传学 CPG岛 DNMT

转录因子AP-4基因真核表达载体构建及表达分析: 2019年; 本研究利用生物信息学分析AP-4与胃癌患者临床病理信息的相关性,根据GenBank中人AP-4基因cDNA序列设计并合成特异性引物,以胃癌细胞总RNA逆转录的cDNA为模板,利用高保真酶扩增AP-4基因CDS (Coding DNA sequence)序列并构建入pcDNA3.1+载体,并通过限制性内切酶酶切分析和测序法进行进一步验证;脂质体法将AP-4重组表达载体及对照pcDNA3.1+载体转染胃癌细胞,qRT-PCR(Quantitative real time polymerase chain reaction)和Western blotting检测分别检测AP-4在m RNA和蛋白水平的表达。生物信息学分析发现,AP-4的表达与胃癌分期及预后显著相关;酶切及测序分析表明,转录因子AP-4真核表达载体构建成功,并能够在胃癌细胞中实现转录和蛋白水平的高效表达。此研究为深入研究转录因子AP-4在胃癌等肿瘤发生发展中的作用及分子机制奠定了基础。; 吴华彰公丕海吴涛赵云利汤必奎陈文静刘牧林樊红; 关键词：转录因子真核表达