罗钟琳
- 作品数:4 被引量:7H指数:1
- 供职机构:复旦大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金上海市科学技术发展基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生化学工程生物学更多>>
- 蛋白质折叠的全原子非连续分子动力学模拟
- 蛋白质折叠是当前科学研究的一个热点,随着各类基因工程的开展和人类基因组计划的完成,对蛋白质的结构、功能以及它的病变机制的理解就变得更加迫切。目前,计算机模拟成了一种重要的理论或“计算机实验”方法。蛋白质是一种生物高分子,...
- 罗钟琳
- 关键词:蛋白质折叠
- 文献传递
- SARS病毒E蛋白的计算机模拟的初步研究被引量:6
- 2003年
- 以粗粒化的多肽链模型进行了 SARS病毒包膜中 E蛋白的计算机模拟 ,描述了该蛋白质空间构象的概貌 .首先扩展了多肽链的 HP模型 ,使之能够用于研究在水或脂环境下蛋白质折叠的行为 ,并且考虑了全部氨基酸残基疏水相互作用能的差异 .相关格子链的 Monte Carlo模拟显示了很高的计算效率 .模拟再现了蛋白质的 coil-globule转变 ,验证了蛋白质序列分布的重要性 .结果表明 ,在水环境中 ,E蛋白质空间结构由紧致的疏水内核和部分向外延伸的亲水片段组成 ;在脂环境中 ,中部疏水片段会成为向外延伸的环 ,而当两侧紧致的亲水片段分开时 ,则形成桥 .
- 陈彦涛罗钟琳丁建东
- 关键词:SARS病毒E蛋白计算机模拟蛋白质折叠非典型肺炎
- 医用高分子材料的研究
- 可降解高分子在医用材料领域有广泛应用.我们的工作主要针对合成高分子材料.组织工程支架、药物缓释载体以及细胞/生物材料相互作用是我们课题组在可降解医用高分子材料方面的三个研究方向.本论文着重介绍在组织工程材料方面的工作.同...
- 丁建东景殿英罗钟琳段世锋孙建国张欢吴林波张洪王标兵张颖朱文张俊川纪仕辰Stefan GRAETER
- 关键词:高分子材料医用材料药物载体生物材料
- 文献传递
- 非连续分子动力学模拟方法及其在大分子研究中的应用被引量:1
- 2007年
- 计算机模拟技术已成为大分子构象等基础研究的一种重要手段。非连续分子动力学模拟(DMD)与传统的分子动力学模拟(MD)方法有所不同,基于不连续势能和相关的模拟编程方法,运行速度大大提高。本文讨论了DMD方法的特点,总结了DMD方法的应用,重点以蛋白质折叠为例介绍了如何使用DMD方法,最后对DMD方法的发展前景进行了展望。
- 闫策罗钟琳丁建东
- 关键词:计算机模拟蛋白质折叠