胡松年
- 作品数：3 被引量：4H指数：2
- 供职机构：中国科学院更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- HPCL2基因表达的选择性剪切分析被引量：2
- 2003年
- 2 羟基植烷酸辅酶A裂解酶 (2 hydroxypanthyl CoAlyase ,HPCL2 )是 3 甲基脂肪酸α 氧化途径中的关键酶 .采用鸟枪法测序技术 ,得到了HPCL2基因的基因组序列 .结果显示 ,HPCL2基因组大小为 40 82 9bp ,共有 17个外显子 ,16个内含子 .外显子平均大小为 116bp ,内含子平均大小为 2 42 9bp ,属于结构紧凑基因 .从dbEST数据库中筛选与HPCL2基因的mRNA (GenBankAcc .:AJ13 1753 )相互重叠表达序列标签 (EST)共有2 13个 ,分别来自 2 9个不同的组织 .将EST与基因组序列进行Blast分析 ,共检测 17个EST具有选择性剪切 ,其中 14例属外显子遗漏 (exonskipping) ,2例外显子增加 (exoninclusion)和 1例剪切位点改变 (splicingsiteshift) .外显子遗漏主要发生在 5′端的第 3到第 8个外显子 .结果表明 。
- 牛宇欣胡松年杨焕明
- 关键词：基因结构选择性剪切基因表达
- 3号染色体短臂末端两个大片段基因组区域的基因分布与GC含量分析被引量：2
- 2004年
- 运用鸟枪法测序技术 ,得到了位于 3p2 5 1和 3p2 6 1区域、大小分别为 32 8kb和 75 3kb的 2个基因组片段 ,分析各片段的GC含量及重复顺序的分布特征 ,并研究不同区域内的基因分布密度。结果表明 :位于 3p2 5 1区域的32 8kb片段具有较高的GC含量 ,在此区域内蛋白编码基因分布密度较高 ,而位于 3p2 6 1区域的 75 3kb片段平均GC含量较低 ,并且是基因贫乏区域。同时发现 :GC rich的SINE类重复顺序在GC含量较高的区域有较高的覆盖率 ,相反AT rich的LINE类重复顺序在GC较低的区域分布较多 。
- 牛宇欣胡松年杨焕明
- 关键词：GC含量
- 人类基因组3pter-p26区域的序列比较分析
- 2004年
- 对人类基因组3号染色体短臂的3pter-p26区域进行了初步分析，序列组装后整个区域全长约为8．1kb，靠近端粒区还存在一个约20∽30kb的空洞．序列比较分析表明：(i)该区域的GC含量为38．5％，为人类基因组所有近端粒区域最低；(ii)共含有42个基因，平均大小为97．5kb，以前通过基因连锁分析定位于该区域的基因Cntn3存在定位错误，应位于3p12．3；(iii)该区域散在重复序列活跃程度高于全基因组平均水平，其中(TA)n含量是全基因组平均水平的2倍；(iV)该区域在小鼠6号染色体104．1∽112．4Mb的位置有一个保守的同源序列；通过染色体进化分析推断，3pter-p26区域可能于最近的一次染色体重排之后才转移到染色体的末端，其发生时间应在人与小鼠的基因组分离之后，在这次重排过程中，染色体断裂点附近的一些序列，连同所包含的基因发生了丢失，而丢失的基因总拷贝数却在基因组的其他地方得到了增加；(v)3pter-p26区域较低的GC含量可能不利于保持染色体末端的稳定，容易发生DNA丢失，而这又可能是引发基因表达异常导致疾病的原因之一。
- 罗春清李彦张晓伟张以琳张海青陈冲吴清发徐祖元崔鹏胡松年王俊杨焕明董伟
- 关键词：人类基因组染色体DNA序列
