董丹凤
- 作品数：18 被引量：72H指数：5
- 供职机构：上海交通大学医学院附属瑞金医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市科委择优委托项目上海市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 急诊重症监护室患者与社区健康人群肠道假丝酵母构成的比较与分析
- 2017年
- 本研究旨在分析社区正常人群与急诊重症监护室(intensive care unit,ICU)患者肠道假丝酵母(又称念珠菌)的组成,比较两组人群肠道念珠菌构成的差异。2014年5—7月,收集1 732名上海社区健康人群的粪便标本;2014年2月—2015年1月,收集191名上海交通大学医学院附属瑞金医院急诊ICU患者的粪便或肛周拭子标本。经真菌培养收集单个菌落,通过内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列分析进一步鉴定菌种,分析两组人群肠道定植真菌的组成特点。结果显示,社区健康人群的肠道标本中检测到9种念珠菌,定植率为13.16%;同时有两种和三种念珠菌定植的比例分别为3.81%和0。急诊ICU患者肠道标本只检测到5种念珠菌,但定植率高达37.17%;同时有两种和三种念珠菌定植的比例分别为9.95%和2.09%。社区健康人群和急诊ICU患者肠道中常见念珠菌分别为白念珠菌(5.25%vs.27.23%)、光滑念珠菌(5.83%vs.13.61%)、热带念珠菌(0.52%vs.7.33%)、近平滑念珠菌(4.16%vs.2.09%)、Candida metapsilosis(1.10%vs.1.05%)。结果显示,急诊ICU患者的肠道念珠菌定植率显著高于社区人群(P<0.001),同时有两种(P=0.001)和三种(P<0.001)念珠菌定植的比例也显著高于社区人群。这种肠道念珠菌的高度定植及多重定植可能增加急诊ICU患者发生念珠菌感染的概率。
- 李贞章黎华董丹凤江岑彭奕冰
- 关键词：真菌假丝酵母肠道菌群重症监护室
- 光滑假丝酵母PDR1基因敲除菌株的建立被引量：1
- 2013年
- 目的:构建光滑假丝酵母ATCC2001菌株PDR1基因敲除突变株。方法:用PRODIGE同源重组技术,以pY24GAL10为模板,设计80 bp长引物合成PDR1-URA3基因敲除组件,并将其转化入URA3已发生突变的ATCC2001/ura3菌株,经SD-URA选择性平板筛选后获得稳定敲除PDR1的ATCC2001/ura3 pdr1Δ菌株。结果:成功构建光滑假丝酵母PDR1基因敲除菌株ATCC2001/ura3 pdr1Δ。结论:此法可用于精确敲除光滑假丝酵母目标基因。ATCC2001/ura3 pdr1Δ菌株的构建将为进一步研究该基因在光滑假丝酵母中的功能及其作用机制奠定基础。
- 俞焙秦江岑董丹凤彭奕冰
- 关键词：同源重组基因敲除
- 患者数据指数加权移动平均法在血清离子项目室内质量控制中的应用被引量：2
- 2021年
- 目的探讨患者数据实时质量控制(PBRTQC)的指数加权移动平均法(EWMA)在血清离子项目室内质量控制(IQC)中的应用价值。方法收集2019年10月—2021年5月上海交通大学医学院附属瑞金医院门诊及住院患者血清离子项目检测结果,基于PBRTQC专业智能软件系统进行检验数据正态分布检验、参数设置、程序建立、实时运行及性能验证。统计纳入分析的患者群体的每个检测结果的EWMA估计值,统计12个月的累积变异系数(CV),并比较累积CV与精密度质量标准和IQC的CV;统计EWMA质控程序在血清离子检测中的预警情况,并分析预警原因。结果患者血清离子总体截断浓度范围为:钾3.40~5.00 mmol/L、钠135~145 mmol/L、氯99~110 mmol/L、钙2.10~2.36 mmol/L、镁0.74~0.98 mmol/L、磷0.90~1.31 mmol/L。钾、钠、氯最适加权系数为0.02,钙、镁、磷最适加权系数为0.05;12个月内6个项目EWMA实际累积精密度(CV)均小于精密度质量目标。EWMA质控程序失控报警13次,钾、钠、氯、钙、镁、磷报警数分别为3、1、2、2、3、2次;其中血清钾、镁和磷各有1次假报警。结论基于PBRTQC专业智能软件工具建立的患者数据EWMA程序可作为日常质控品质量控制的补充,能较早提示离子项目分析性能的微小变化,并早期预警,避免潜在质量风险的发生。
- 杨帆董丹凤陆怡德
- 临床分离光滑假丝酵母菌唑类药物耐药机制研究
- 2014年
- 目的了解光滑假丝酵母菌临床分离株中唑类耐药株的耐药机制。方法收集2009年和2010年5家医院28例患者的38株光滑假丝酵母菌,根据CLSI M27-A3指南采用微量肉汤稀释法测定5种常用抗真菌药物(两性霉素B、5-氟胞嘧啶、氟康唑、伊曲康唑和伏立康唑)的最小抑菌浓度。采用Real-Time PCR法检测CDR1、CDR2及SNQ2等外排泵基因以及ERG11和转录因子PDR1的表达;流式细胞仪分析罗丹明6G外排能力,考察细胞膜外排泵功能;同时,PCR扩增ERG11基因全长以及PDR1基因主要功能区并测序比对。结果 38株光滑假丝酵母菌对两性霉素B和5-氟胞嘧啶均敏感,其中17株为唑类耐药菌。唑类耐药株CDR1基因表达明显高于敏感株(P=0.001),并且对罗丹明6G外排能力也显著强于敏感菌(P=0.001)。光滑假丝酵母菌敏感和耐药菌株ERG11表达差异无统计学意义(P=0.283),且ERG11基因未发现突变。此外,17株光滑耐药菌株PDR1基因表达量与敏感菌株比较差异无统计学意义(P=0.086),但每株耐药菌株PDR1基因均分别发现1处有义突变。结论转录因子PDR1突变、外排泵基因CDR1表达上调以及外排泵功能增强是目前临床上光滑假丝酵母菌唑类药物耐药的主要机制。
- 董丹凤江岑章黎华李贞彭奕冰
- 关键词：光滑假丝酵母菌外排泵ERG11基因
- 体内外光滑假丝酵母菌氟康唑耐药机制的比较研究被引量：2
- 2012年
- 目的研究比较临床分离和体外诱导的耐氟康唑光滑假丝酵母菌的耐药机制。方法选取临床分离的4对氟康唑敏感一耐药配对的光滑假丝酵母菌，其中4株敏感株在体外氟康唑的作用下均被诱导为耐药株。利用罗丹明6G试验比较敏感株与两种耐药株的外排泵作用，实时荧光定量RT-PCR检测外排相关基因CDRl、CDR2、SNQ2和ERG11的表达。同时，对PDRl基因进行PCR扩增和测序，对比分析临床耐药株和体外诱导耐药株的突变位点。结果临床耐药株和体外诱导耐药株外排泵的功能均明显强于敏感株；两者CDRl表达均显著升高，而CDR2和SNQ2则无明显变化；ERGl1在敏感与耐药菌株之间的表达水平也无显著差别；两种耐药株的PDRl均发现错义突变位点，其中P927S、L543P及$947L突变尚未被报道过。结论光滑假丝酵母菌在体内外氟康唑作用下PDRl均产生突变，引起外排相关基因，尤其是CDRl的表达增加从而增强了外排泵的作用导致耐药。
- 江岑董丹凤俞焙秦王学锋彭奕冰
- 关键词：光滑假丝酵母菌外排泵ERG11氟康唑
- 体内外光滑假丝酵母菌氟康唑耐药机制的比较研究
- 近二三十年来,由于免疫抑制类药物和广谱抗生素的广泛使用,老龄化社会的加剧以及导尿管或深静脉插管等侵入性操作,在很大程度上都增加了机会性真菌的感染率。假丝酵母菌是临床真菌感染的主要致病菌,尤其在免疫功能低下的患者中易被分离...
- 江岑董丹凤俞焙秦王学锋彭奕冰
- 比较重复序列PCR与多位点序列分型技术用于光滑假丝酵母菌的基因分型检测被引量：6
- 2011年
- 目的评价REP-PCR基因分型技术在临床光滑假丝酵母菌株分型中的应用价值。方法收集2009-2010年上海瑞金医院、上海仁济医院、上海华山医院、安徽医科大学附属医院、深圳人民医院38株光滑假丝酵母菌。采用MLST法扩增光滑假丝酵母菌的6个管家基因内片段，扩增片段测序后与数据库数据比对得出等位基因谱，从而得到相应的序列型（sequence type，ST）。采用REP-PCR法设计Ca21、Ca22、Corn21引物扩增38株光滑假丝酵母菌重复序列，通过电泳比较分析，获得REP．PCR型。比较两种分型方法的结果和效率。结果以Ca22．Com21为引物的REP-PCR分型效果最好。REP-PCR和MIST分型结果相同，38株光滑假丝酵母菌共产生5种REP-PCR型，分别为A、B、C、D、E型，对应于MIST的S17、ST3、ST19、ST45和新型。REP-PCR比MIST耗时短。结论REP-PCR方法简单快速，且分辨率与MLST技术相同，可作为实验室大量菌株分型的首选方法。
- 董丹凤江岑俞焙秦樊绮诗彭奕冰
- 关键词：聚合酶链反应基因型
- 院内感染艰难梭菌的毒素检测及核糖体分型研究被引量：15
- 2012年
- 目的了解艰难梭菌临床分离株的毒力情况,并运用核糖体分型技术进行流行病学研究。方法采集住院腹泻患者的未成形粪便标本,无水乙醇处理后接种CDMN选择培养基行艰难梭菌分离培养,并通过革兰染色、耐氧试验和凝集试验行菌落鉴定;提取菌株DNA,选择特异性引物用PCR法扩增毒素基因tcdA和tcdB;核糖体分型针对细菌基因组16S～23S rDNA间区序列进行扩增,并根据电泳带型的多态性实现分型。结果共计分离得44株艰难梭菌,3种毒素型分别为A+B+型、A-B+型和A-B-型,分别占57%、34%和9%;18种核糖体型中以R8型和R4型为主,分别占20%和18%。结论本研究临床分离的艰难梭菌菌株中,毒素型以A+B+型为主,核糖体分型存在相对优势的型别;无证据提示存在院内艰难梭菌感染的暴发流行。
- 章黎华董丹凤江岑彭奕冰
- 关键词：艰难梭菌毒素
- GeneXpert实时荧光定量PCR快速检测艰难梭菌的临床评估被引量：9
- 2014年
- 目的对GeneXpert实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)在快速检测临床粪便标本中艰难梭菌的应用进行评估。方法采用双拭子蘸取临床未成形粪便标本,一支拭子用于GeneXpert实时荧光定量PCR检测艰难梭菌毒素基因tcdB,另一支用于常规厌氧菌培养检测;对GeneXpert实时荧光定量PCR检测结果与常规厌氧菌培养结果的一致性进行统计学分析,并计算GeneXpert实时荧光定量PCR的敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值等参数。结果临床收集到141例未成形粪便标本,GeneXpert实时荧光定量PCR检出艰难梭菌毒素基因tcdB阳性42例,其中常规厌氧菌培养阳性34例,两者一致性较好(Kappa=0.775 0,P<0.01),GeneXpert实时荧光定量PCR的敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别为87.2%、92.2%、81.0%和94.9%。结论 GeneXpert实时荧光定量PCR直接检测粪便标本中的艰难梭菌具有检测快速、操作简便等优点,有重要的临床应用价值。
- 陈旭董丹凤韩立中倪语星
- 关键词：艰难梭菌实时荧光定量聚合酶链反应
- 氨基糖苷类药物对尿液总蛋白检测的干扰分析被引量：3
- 2012年
- 目的探讨美国临床实验室标准化协会(CLSI)EP7-A2文件对于筛查、量化临床化学尿液样本分析干扰的实际应用,评价氨基糖苷类抗菌药物对尿总蛋白检测的干扰效应。方法遵循CLSI EP7-A2文件,选取尿总蛋白浓度为77、146、538、832 mg/L的新鲜尿液样本,分别加入最大治疗剂量时每升尿液中3倍浓度的硫酸依替米星溶液,采用邻苯三酚红钼法分别进行干扰筛选试验。4种浓度尿液样本中分别加入由硫酸依替米星和一级纯水配制而成的梯度浓度溶液(0、0.15、0.30、0.45、0.60 mg/mL),进行干扰效应试验。通过多项式回归分析量化干扰效应,估计在任何干扰物浓度水平下的干扰度。结果在尿总蛋白浓度分别为77、146、538、832 mg/L的尿液样本中加入0.6 mg/mL硫酸依替米星溶液,其干扰效应点估计值置信区间下限均超过医学决定水平处的允许误差。在尿总蛋白浓度分别为77、146、538、832 mg/L的尿液样本中加入5个干扰浓度(0、0.15、0.30、0.45、0.60 mg/mL)的硫酸依替米星溶液,得出的系列浓度均为线性剂量效应关系,其线性方程分别为Y=202X-1.2、Y=187.3X+4、Y=325.3X+0.6、Y=345.3X+6.4。通过回归方程分析得出尿总蛋白浓度为77、146、538、832 mg/L时,加入0.08、0.15、0.35、0.50 mg/mL硫酸依替米星溶液所引起的正干扰效应均超过临床可接受的允许误差。结论硫酸依替米星对邻苯三酚红钼法测定尿总蛋白存在正干扰;临床实验室需进行分析干扰实验,筛选潜在干扰物质、量化干扰效应、评估潜在风险,并建立对临床有意义的干扰声明。
- 陆怡德杨帆董丹凤杨迟晖彭奕冰
- 关键词：总蛋白尿液氨基糖苷类抗菌药物
