陈小林
- 作品数：28 被引量：38H指数：4
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- 相关领域：农业科学更多>>
- 基于特异序列的亚洲炭疽菌PCR检测引物及快速检测方法
- 本发明公开了基于特异序列的亚洲炭疽菌PCR检测引物及快速检测方法。本发明通过比较亚洲炭疽菌(Colletotrichum asianum)和其他种炭疽菌基因组的方法所得到的亚洲炭疽菌的特异性分子靶标序列SEQ ID NO...
- 李其利鲁萌萌唐利华黄穗萍陈小林马立安郭堂勋莫贱友
- 水稻响应白叶枯病菌侵染的转录组分析被引量：1
- 2023年
- 【目的】分析白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryae,Xoo)侵染不同时间点的水稻转录组数据,了解其响应侵染过程中抗病相关基因的表达情况,为明确水稻对白叶枯病菌感病机制以及培育新的抗白叶枯病水稻品种提供理论参考。【方法】以含有广谱抗性基因Xa23的水稻品系CBB23为试验材料,对其叶片接种高致病性的野生型Xoo菌株N3-1,将接种0、48和72 h水稻样品总RNA进行转录组测序(RNA-Seq)。以|log2Fold Change|≥1,且错误发现率(False discovery rate,FDR)<0.01为标准筛选差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),并进行GO功能注释和KEGG通路富集分析;通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证RNA-Seq结果的可靠性。【结果】RNA-Seq转录组测序结果共获得约54.63 Gb Clean data,样品平均数据量约为6.07 Gb,Q30碱基准确率在94.34%及以上。与对照组0 h相比,水稻CBB23在接种48和72 h两个时间点分别鉴定出2361和2117个DEGs,其中48 h上调基因1650个、下调基因711个,72 h上调基因1440个、下调基因677个。GO富集结果表明,水稻的DEGs显著富集于芳香族氨基酸的代谢及二萜类的生物合成。KEGG通路富集结果表明,DEGs富集于苯丙氨酸和苯丙素类的生物合成。DEGs的分析结果表明,SWEET基因家族中的OsSWEET14基因在接种后表达明显升高,而白叶枯病抗性基因Xa23在接种后几乎没有表达。对转录因子中的WRKY家族进行分析,发现与Xoo抗病相关的WRKY转录因子表达明显下降。钙依赖蛋白激酶(CDPK)表达明显升高,丝裂原活化激酶(MAPK)表达不变。qRT-PCR的基因表达检测结果与RNA-Seq结果趋势基本一致。【结论】水稻CBB23在抵御白叶枯病菌菌株N3-1侵染过程中的氨基酸代谢及次级代谢过程明显增强;感病基因OsSWEET14在侵染过程中被诱导表达,可能是水稻中被调控的关键感病基因之一。与抗病相关的转录因子表达既有上调也有下调。表明水稻在响应病原
- 张宇张宇陈小林陈小林李其利唐利华郭堂勋郭堂勋
- 关键词：水稻转录组白叶枯病
- 水稻白叶枯病抗性基因Xa21的分子生物学研究进展被引量：7
- 2014年
- 由黄单胞杆菌水稻致病变种Xanthomonas oryzae pv.oryzae(Xoo)引起的白叶枯病是水稻重要细菌性病害之一。迄今,已有7个水稻白叶枯病抗性基因被克隆。Xa21是第一个被克隆的白叶枯病抗性基因,因具有广谱抗性而受到广泛的关注。对Xa21的发现、定位及克隆、表达特征、编码产物XA21的生化特性、作用与调控以及XA21介导的免疫反应模式等方面的研究结果进行综述,并对今后的研究方向进行展望。
- 陈小林颜群高利军高汉亮
- 关键词：水稻白叶枯病抗性基因XA21
- 二甲基三硫醚在抑制火龙果溃疡病菌中的应用
- 本发明涉及二甲基三硫醚在抑制火龙果溃疡病菌中的应用。本发明通过室内毒力测定确定了二甲基三硫醚对不同病原菌表现出不同程度的抑制作用，其中对玉米立枯丝核菌和葡萄灰霉病菌抑制效果最好，其次为火龙果溃疡病菌和水稻稻瘟病菌，因此说...
- 唐利华李其利苏映丹赵江郭堂勋黄穗萍莫贱友陈小林
- 广西水稻白叶枯病菌致病型的初步鉴定被引量：8
- 2015年
- 【目的】明确广西水稻白叶枯病菌致病型的分布和分化,为生产上该病害的综合防控提供理论依据。【方法】采用水稻白叶枯病菌中国鉴别寄主(金刚30、特特普、南粳15、爪哇14、IR26)对2013年从广西南宁、东兴、防城港、钦州、岑溪等地水稻病区分离得到的29株水稻白叶枯病菌进行致病型初步鉴定,同时采用部分近等基因系对5株南宁分离菌株致病性进行进一步分析。【结果】29株菌株在5个鉴别寄主上均出现感病反应,均为SSSSS模式,为强致病菌;5株南宁分离菌株能使目前抗谱最广的水稻材料CBB23感病。【结论】广西水稻白叶枯病菌致病力出现极大分化,需加强对该病害的防控及水稻抗病材料的筛选利用工作。
- 陈小林颜群高利军韦善富李道远高汉亮
- 关键词：水稻白叶枯病菌致病型
- 产挥发性物质芽孢杆菌对芒果炭疽菌的抑制作用及对芒果炭疽病的防病效果被引量：1
- 2023年
- 本研究从健康的芒果表皮分离得到10株对芒果炭疽菌具有抑菌活性的菌株,通过形态学观察、生理生化测定和分子生物学鉴定,6株菌株被鉴定为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis),3株菌株被鉴定为解淀粉芽孢杆菌(B.amyloliquefaciens),1株菌株被鉴定为贝莱斯芽孢杆菌(B.velezensis)。采用平板对峙法和平板对扣法测定了10株芽孢杆菌的抑菌活性,结果表明,供试的10株菌株的发酵液和挥发性物质对芒果炭疽病菌均具有一定抑制作用,其中菌株N-16-2的抑制效果最好,其发酵液和挥发性物质抑菌率均达79%以上。在干燥器中测定了10株拮抗细菌产生的挥发性物质对芒果采后炭疽病的防治效果,结果表明,10株菌株对芒果采后炭疽病的防病效果均在60%以上,其中菌株YM-11-C对采后炭疽病的防效最佳,高达70%。采用固相微萃取气质联用测定细菌产生的挥发性物质的成分,结果表明,10株拮抗细菌挥发性物质成分主要为以下6种化合物,Diethyl Phthalate,Hexanedioic acid,bis(2-ethylhexyl)ester,Butylated Hydroxytoluene,Squalene,2-Dodecanone,2,5-Cyclohexadiene-1,4-dione,2,6-bis(1,1-dimethylethyl)-,对这6种挥发性化合物进行抑菌活性测定,结果表明Diethyl Phthalate,2-Dodecanone和2,5-Cyclohexadiene-1,4-dione,2,6-bis(1,1-dimethylethyl)-这3种化合物具有明显抑菌活性,其中化合物2,5-Cyclohexadiene-1,4-dione,2,6-bis(1,1-dimethylethyl)-对芒果炭疽菌的抑制效果最好。本研究是首次报道枯草芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌和贝莱斯芽孢杆菌产生的挥发性物质对芒果炭疽菌的抑制作用和对芒果炭疽病防病效果,也是首次报道化合物2,5-Cyclohexadiene-1,4-dione,2,6-bis(1,1-dimethylethyl)-对芒果炭疽菌的抑制作用和对芒果炭疽病防病效果。
- 杨芝霓鲁萌萌黄穗萍唐利华陈小林郭堂勋莫贱友张萌李其利
- 关键词：芽孢杆菌挥发性物质抑菌活性芒果炭疽病
- 暹罗炭疽菌的特异性PCR检测引物及其应用
- 本发明公开了暹罗炭疽菌的特异性PCR检测引物及其应用。特异性检测引物FS13/RS15、FS13/RS13或FS13/RS11是基于ApMAT序列设计的。本发明中的三组关于暹罗炭疽菌的特异性检测引物具有特异性强、稳定性好...
- 李其利鲁萌萌唐利华黄穗萍陈小林郭堂勋
- 基于特异序列的亚洲炭疽菌PCR检测引物及快速检测方法
- 本发明公开了基于特异序列的亚洲炭疽菌PCR检测引物及快速检测方法。本发明通过比较亚洲炭疽菌(Colletotrichum asianum)和其他种炭疽菌基因组的方法所得到的亚洲炭疽菌的特异性分子靶标序列SEQ ID NO...
- 李其利鲁萌萌唐利华黄穗萍陈小林马立安郭堂勋莫贱友
- 文献传递
- 广西番木瓜炭疽病的病原菌鉴定
- 2023年
- 番木瓜(Carica papaya L.)是番木瓜科(Caricaceae)番木瓜属(Carica)植物,在我国种植广泛,具有重要的经济价值。由炭疽菌(Colletotrichum spp.)引起的番木瓜炭疽病,是一种重要的采后病害,严重影响番木瓜果实的品质和产量[1]。2019年3月,在广西南宁西乡塘区的番木瓜种植园观察到具有典型炭疽病症状的成熟番木瓜果实,发病率达到30%。发病初期症状表现为水渍状斑点,逐渐变为深褐色,后期病部凹陷,在潮湿温暖的条件下,病变部位会出现橘红色分生孢子团。
- 张玉杰孙文秀唐利华黄穗萍莫贱友郭堂勋陈小林黄辉晔李其利
- 关键词：番木瓜果实番木瓜科病原菌鉴定采后病害
- 广西稻瘟病菌生理小种鉴定及遗传多样性分析被引量：9
- 2017年
- 【目的】明确广西稻瘟病菌生理小种组成及遗传结构,为今后水稻抗病品种的选育和布局提供依据。【方法】利用我国7个稻瘟病菌鉴别品种和SSR对广西2012~2014年分离获得的稻瘟病菌单孢菌株分别进行生理小种鉴定和遗传多样性分析。【结果】2012-2014年分离获得的142株稻瘟病菌菌株分成ZA、ZB、ZC、ZD、ZE、ZF、ZG 7群24个生理小种,其中优势种群为ZB,出现频率67.61%,优势生理小种为ZB_9和ZB_(13),出现频率均为19.01%。运用UPGMA法对其中107个菌株进行遗传多样性分析,在0.88的相似水平上划分为14个遗传宗谱。其中,宗谱L01为优势宗谱,占供试菌株比例为44.86%;其次为宗谱L03、L06和L11,占供试菌株比例分别为19.63%、13.08%和10.28%。对每个遗传宗谱所包含的菌株及对应生理小种进行统计,发现稻瘟病菌遗传宗谱与生理小种之间未存在相关性。【结论】2012-2014年广西稻瘟病菌优势种群为ZB,优势生理小种为ZB9和ZB13,其遗传宗谱与生理小种之间未存在相关性。
- 陈小林颜群李瑞芳李焜华韦善富黄凤宽韦丽丽
- 关键词：水稻稻瘟病菌生理小种SSR
