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付中民

作品数:116 被引量:187H指数:10
供职机构:福建农林大学更多>>
发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金福建省自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学医药卫生生物学轻工技术与工程更多>>

文献类型

  • 71篇期刊文章
  • 33篇专利
  • 8篇会议论文
  • 1篇学位论文

领域

  • 74篇农业科学
  • 4篇生物学
  • 4篇医药卫生
  • 2篇经济管理
  • 2篇轻工技术与工...
  • 2篇文化科学

主题

  • 72篇蜜蜂
  • 25篇意大利蜜蜂
  • 25篇基因
  • 19篇中华蜜蜂
  • 16篇蜜蜂球囊菌
  • 14篇工蜂
  • 13篇养蜂
  • 13篇蜜蜂幼虫
  • 12篇肠道
  • 11篇养蜂生产
  • 10篇巢框
  • 9篇球囊
  • 9篇转录
  • 9篇蜂蜜
  • 8篇幼虫
  • 8篇转录组
  • 8篇胁迫
  • 8篇蜂箱
  • 7篇调控网络
  • 7篇中肠

机构

  • 113篇福建农林大学
  • 7篇广东省生物资...
  • 2篇福建农业职业...
  • 1篇徐州师范大学
  • 1篇中国农业科学...
  • 1篇吉林省养蜂科...

作者

  • 113篇付中民
  • 62篇陈大福
  • 33篇熊翠玲
  • 27篇郭睿
  • 26篇郑燕珍
  • 20篇郭睿
  • 19篇周冰峰
  • 19篇刘彩珍
  • 16篇徐新建
  • 14篇缪晓青
  • 12篇朱翔杰
  • 11篇周姝婧
  • 9篇杜宇
  • 8篇徐国钧
  • 8篇张璐
  • 7篇梁勤
  • 7篇吴珍红
  • 6篇张其康
  • 5篇杨文超
  • 5篇李江红

传媒

  • 11篇中国蜂业
  • 9篇中国农业科学
  • 9篇昆虫学报
  • 6篇福建农林大学...
  • 5篇应用昆虫学报
  • 4篇上海交通大学...
  • 4篇环境昆虫学报
  • 3篇微生物学报
  • 3篇中国养蜂
  • 3篇中国农业大学...
  • 2篇四川大学学报...
  • 2篇安徽农业大学...
  • 1篇安徽农业科学
  • 1篇食品科技
  • 1篇微生物学通报
  • 1篇养蜂科技
  • 1篇蜜蜂杂志
  • 1篇西南农业学报
  • 1篇浙江农业学报
  • 1篇中国高校科技...

年份

  • 4篇2024
  • 5篇2023
  • 8篇2022
  • 7篇2021
  • 2篇2020
  • 9篇2019
  • 25篇2018
  • 9篇2017
  • 7篇2016
  • 3篇2015
  • 5篇2014
  • 3篇2013
  • 5篇2012
  • 1篇2011
  • 4篇2010
  • 2篇2009
  • 3篇2008
  • 2篇2007
  • 2篇2006
  • 3篇2004
116 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
蜜蜂病毒的传播方式
病毒传播方式的研究一直是一个发展较为快速的领域.在最近十年间,对于病毒在蜜蜂中的传播和流行病学的探究已经取得一定程度的突破.在本综述文章中将对这方面的研究成果作个简要的叙述.通常情况下,蜜蜂中的病毒可通过水平和垂直两个途...
陈大福付中民
关键词:蜜蜂养殖病毒传播流行病学
利用第三代纳米孔长读段测序技术构建和注释蜜蜂球囊菌的全长转录组被引量:12
2021年
【目的】利用第三代纳米孔(nanopore)长读段测序技术对蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis,简称球囊菌)的纯化菌丝(Aam)和孢子(Aas)进行测序,构建和注释球囊菌的高质量全长转录组。【方法】通过Oxford Nanopore PromethION平台对Aam和Aas进行测序。利用Guppy软件对原始读段(raw reads)进行碱基识别(base calling),通过过滤短片段和低质量原始读段得到有效读段(clean reads)。通过识别两端引物鉴定全长转录本序列。通过比对Nr、Swissprot、KOG、eggNOG、Pfam、GO和KEGG数据库获得全长转录本的注释信息。分别利用CPC、CNCI、CPAT、Pfam 4种方法对长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)进行预测,取四者的交集作为高可信度的lncRNA。【结果】Aam和Aas的纳米孔测序分别测得6321704和6259727条原始读段,经质控得到5669436和6233159条有效读段,其中包含的全长有效读段分别为4497102(79.32%)和4963101(79.62%)条。共鉴定到9859和16795条非冗余全长转录本,N50分别为1482和1658 bp,平均长度分别为1187和1303 bp,最大长度分别为6472和6815 bp。Venn分析结果显示有6512条非冗余全长转录本为菌丝和孢子所共有,分别有3347和10283个非冗余全长转录本为二者特有。此外,在球囊菌菌丝和孢子中共鉴定到20142条全长转录本,其中分别有20809、11151、17723、12164、11340和9833条全长转录本可注释到Nr、KOG、eggNOG、Pfam、GO和KEGG数据库。注释全长转录本数量最多的物种是球囊菌、Polytolypa hystricis和荚膜组织胞浆菌(Histoplasma capsulatum)。GO数据库注释结果显示,上述全长转录本可注释到45个功能条目,涉及细胞组件、细胞和细胞器等细胞组分相关条目;催化活性、结合和转运器活性等分子功能相关条目;以及细胞进程、代谢进程和单一组织进程等生物学进程相关条目。KEGG数据库注释结果显示,上述全长转录本还可注释到抗生素的生物合成、核糖体、氨基酸的�
杜宇祝智威王杰王秀娜蒋海宾范元婵范小雪陈华枝隆琦蔡宗兵熊翠玲郑燕珍付中民陈大福付中民
关键词:蜜蜂蜜蜂球囊菌
不同龄期意蜂消化道酶谱带分布及糖转化酶的研究
2001年
采用聚丙烯凝胶电泳对不同日龄的意大利蜜蜂 (Apismelliferaligustica)的消化道酶进行谱带分析 ,不同日龄意大利蜜蜂消化道酶带分布和对糖转化酶的活性有差异。 7~ 1 8日龄意大利蜜蜂糖转化酶活性最高 ,而 1~ 3日龄最低。相同日龄意大利蜜蜂消化道不同部位糖转化酶活性大小依次为中肠、前肠、后肠。
缪晓青王建鼎李江红王英林道密吴珍红付中民刘玉梅张其康
关键词:意大利蜜蜂龄期消化道酶
蜜蜂规模化饲养管理技术被引量:3
2019年
我国蜜蜂饲养管理技术在世界养蜂中非常独特,主要特征是饲养管理精细,在蜜粉植物资源不是很理想的条件下仍能获得较高的产量。由于片面追求单群产量,导致养蜂生产机械化程度低、投入劳动多、产品质量差和养蜂收益低,改变我国蜜蜂饲养技术模式已成为当前蜂业发展的主要任务。一、规模化蜂场和蜜蜂规模化饲养技术定义规模化蜂场与蜜蜂规模化饲养技术的概念虽然有关系但有所不同,规模化蜂场重点在蜂场的蜂群数量规模,蜜蜂规模化饲养技术重点在一个人能饲养蜜蜂的数量。
周冰峰朱翔杰周姝婧徐新建付中民
关键词:饲养管理技术规模化蜜蜂养蜂生产机械化程度植物资源
意大利蜜蜂工蜂中肠的长链非编码RNA的预测、分析及鉴定被引量:4
2018年
【目的】预测、分析和鉴定意大利蜜蜂Apismelliferaligustica工蜂中肠的长链非编码RNA(lncRNA),探究lncRNA的作用。【方法】结合lncRNA-seq技术和链特异性cDNA建库方法对意大利蜜蜂工蜂中肠进行深度测序;利用Perl脚本对原始数据进行过滤;联用CPC和CNCI软件对测序数据进行lncRNA预测,并比较lncRNA基因与其邻近的蛋白编码基因的结构特征;通过RT-PCR对随机选取的lncRNA进行鉴定;利用相关生物信息学软件对lncRNA、的上下游基因进行GO分类和KEGG代谢通路富集分析。【结果】意大利蜜蜂工蜂中肠样品的lncRNA-seq共得到1 956 118 858原始读段,经过滤得到1 946 489 304有效读段,共预测出6 353个lncRNA,它们较蛋白编码基因含有较少的外显子数、较短的转录本长度。通过RT-PCR验证了9个lncRNA的表达。lncRNA的上下游基因富集在42个GO条目和256条代谢通路,进一步分析结果表明这些lncRNA参与调控意大利蜜蜂工蜂中肠的新陈代谢和细胞生命活动等生物学过程。【结论】研究结果丰富了蜜蜂的lncRNA信息,也为阐明lncRNA在意大利蜜蜂工蜂中肠发育及胁迫响应过程中的作用打下了基础。
熊翠玲耿四海王心蕊刘思亚陈大福郑燕珍付中民杜宇王海朋陈华枝周丁丁郭睿
关键词:意大利蜜蜂中肠长链非编码RNA
温度与PH值对中华蜜蜂(APIS CERANA CERANA)中肠消化酶活力的影响研究
本实验选择蜜蜂最佳发育温度34℃为反应温度,分别以PH值梯度为5.0、6.0、7.0、8.0、9.0的1.0%酪蛋白溶液为蛋白酶代谢底物,以PH值梯度为4.4、4.8、5.2、5.6、6.0、6.4的1.5%可溶性淀粉液...
缪晓青刘彩珍张其康吴珍红付中民朱海波苏荣
关键词:蜜蜂饲养中华蜜蜂
文献传递网络资源链接
基于第三代纳米孔测序技术的东方蜜蜂微孢子虫全长转录组构建及注释被引量:12
2020年
【目的】本研究旨在利用Oxford Nanopore测序技术组装和注释东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae的高质量全长转录组。【方法】采用Nanopore PromethION系统对东方蜜蜂微孢子虫的纯净孢子进行转录组测序。通过识别每条clean read两端引物鉴定全长转录本序列。利用Blast工具将全长转录本比对Nr,Swiss-Prot,KOG,eggNOG,Pfam,GO和KEGG数据库,获得相应注释信息。分别利用蛋白结构域分析方法CPC,CNCI,CPAT和Pfam对长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)进行预测,获得高可信度lncRNA。利用CPM(counts per million)法计算每一条全长转录本的表达量。【结果】利用Nanopore PromethION系统对东方蜜蜂微孢子虫转录组测序共测得6988795条raw reads,经质控获得6953469条clean reads,其中包含5143999条全长转录本。共鉴定到10243条非冗余全长转录本,N50和平均读长分别为1042 bp和894 bp,最大读长为4855 bp。有9342,4038,4283,2569,4859和3450条全长转录本分别注释到Nr,KOG,eggNOG,Pfam,GO和KEGG数据库。注释到东方蜜蜂微孢子虫、蜜蜂微孢子虫Nosema apis和家蚕微孢子虫Nosema bombycis的全长转录本数量最多。共鉴定到87条高可信度lncRNA,包含49条正义链lncRNA(sense lncRNA)、25条反义链lncRNA(anti-sense lncRNA)和13条基因间区lncRNA。本研究的测序量足以检测到全部表达的全长转录本,全长转录本的表达量(CPM)范围在0.1到10000以上。【结论】本研究构建和注释了东方蜜蜂微孢子虫的高质量全长转录组数据,可为病原的比较转录组分析、转录本的可变剪接和可变腺苷酸化分析、简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)位点挖掘、基因结构优化以及基因全长序列克隆及功能研究提供关键基础。
陈华枝杜宇范小雪祝智威蒋海宾王杰范元婵熊翠玲郑燕珍付中民付中民陈大福郭睿
关键词:长链非编码RNA
蜜蜂球囊菌菌丝和孢子中长链非编码RNA的比较及潜在功能分析被引量:3
2021年
【背景】蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis,简称球囊菌)是一种专性侵染蜜蜂幼虫的真菌病原,可引起成年蜜蜂数量和蜂群群势的急剧下降。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类新近发现的非编码RNA,在表观遗传、细胞周期、剂量补偿等众多生命活动中发挥重要生物学功能。【目的】明确球囊菌菌丝和孢子中lncRNA的数量、种类和表达谱差异,并探究共有lncRNA、特有lncRNA和差异表达lncRNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA)在菌丝与孢子中的潜在功能。【方法】利用基于链特异性建库的lncRNA-seq技术对球囊菌的纯化菌丝(AaM)和纯化孢子(AaS)分别进行测序。根据FPKM(Fragment Per Kilobase of per Million mapped reads)法计算lncRNA在AaM和AaS中的表达水平。通过Venn分析筛选AaM与AaS的共有lncRNA和特有lncRNA。按照P≤0.05且|log2 fold change|≥1的标准筛选AaM vs AaS比较组中的DElncRNA。通过Blast工具将共有lncRNA、特有lncRNA和DElncRNA的上下游基因比对GO和KEGG数据库,以进行功能及通路注释。根据靶向结合关系构建共有lncRNA、特有lncRNA和DElncRNA的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络并利用Cytoscape软件进行可视化。利用RT-qPCR验证测序数据的可靠性。【结果】AaM和AaS分别测得108614646和105675408条原始读段(raw reads),经严格过滤得到107780032和104621402条有效读段(clean reads),Q20分别为98.76%和98.72%,Q30分别达到95.84%和95.78%。共鉴定到850个lncRNA。AaM和AaS的共有lncRNA为701个,二者的特有lncRNA分别为39和110个。上述共有lncRNA通过顺式作用调控3992个上下游基因,它们涉及细胞进程、代谢进程和催化活性等42个功能条目,以及代谢途径、次生代谢物的生物合成和抗生素的生物合成等117条通路;AaM的特有lncRNA和AaS的特有lncRNA通过顺式作用分别调控243和672个上下游基因。AaM vs AaS比较组包含的255个DElncRNA通过顺式作用调控1
陈华枝王杰祝智威蒋海宾范元婵范小雪万洁琦卢家轩郑燕珍付中民付中民陈大福郭睿
关键词:蜜蜂球囊菌长链非编码RNA菌丝孢子
中华蜜蜂幼虫肠道中微小RNA的鉴定及分析被引量:1
2022年
【目的】利用small RNA-seq(sRNA-seq)技术和生物信息学方法对中华蜜蜂(Apis cerana cerana,简称中蜂)幼虫肠道的微小RNA(microRNA,miRNA)进行全转录组鉴定和分析,旨在丰富中蜂的miRNA信息,并为深入研究miRNA调控中蜂幼虫肠道发育的分子机理提供依据。【方法】利用sRNA-seq技术对中蜂4、5和6日龄幼虫肠道样品(Ac1、Ac2和Ac3)进行测序,通过数据质控获得有效标签序列(clean tags)。采用Blast工具将clean tags连续比对东方蜜蜂(Apis cerana)基因组和miRBase数据库,以鉴定保守miRNA和新miRNA。采用TPM法对miRNA的表达量进行归一化处理。通过GraphPad Prism7软件统计各组肠道样品中sRNA占比、miRNA长度分布及首位碱基偏向性。利用相关软件预测上述miRNA靶向的mRNA并进行GO和KEGG数据库注释。进一步根据靶向结合关系构建和分析注释到发育和免疫相关通路的基因及其靶向miRNA的调控网络,并利用Cytoscape软件进行可视化。利用茎环反转录PCR(Stem-loop RT-PCR)、分子克隆和Sanger测序验证miRNA的表达和序列的真实性。【结果】共鉴定到中蜂的371个保守miRNA和64个新miRNA;这些miRNA的长度介于18—25 nt且首位碱基主要偏向于U;上述miRNA共靶向14 750条mRNA,涉及离子结合、金属离子结合、细胞膜、细胞膜组件和单一有机体进程等2 270个GO条目,以及内吞作用、细胞凋亡、mTOR信号通路、RNA转运和昆虫激素的生物合成等332条KEGG通路。进一步分析结果显示156个miRNA与注释到Wnt、Hippo、Notch和mTOR等生长发育相关通路的67个靶基因存在调控关系,145个miRNA与注释到Toll、Imd/JNK、Jak-STAT和抗菌效应因子等免疫相关途径的21个靶基因存在调控关系。Stem-loop RT-PCR结果显示miR-8-y、miR-9-z、miR-14-y、miR-281-y、miR-283-x和miR-306-x均能扩增出预期的特异性片段;Sanger测序结果显示上述6个miRNA的序列与深度测序结果一致。【结论】提供了中蜂miRNA的数
冯睿蓉付中民付中民张文德范小雪王海朋万洁琦周紫彧康育欣陈大福郭睿史培颖
关键词:东方蜜蜂中华蜜蜂肠道微小RNA调控网络
东方蜜蜂微孢子虫的基因结构优化及新基因鉴定被引量:4
2019年
东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae是一种寄生于蜜蜂中肠上皮细胞的单细胞真菌,对蜜蜂的健康危害严重,给世界各国的养蜂业造成较大损失。本研究基于前期获得的N.ceranae孢子的转录组数据对其已注释基因进行结构优化,并对未注释基因进行预测和分析。通过将测序得到的clean reads比对参考基因组和转录本重构,共对10个N.ceranae的已注释基因的5'端或3'端进行了延长。利用Cuffcompare软件将重构转录本与参考基因组进行比对,共鉴定出27个新基因,随机挑选9个新基因进行RT-PCR验证,均能扩增出符合预期的目的片段,表明预测出的新基因真实存在。有6个新基因能够注释到GO数据库和6个基因注释到KEGG数据库。进一步分析结果显示上述新基因注释到细胞等10个GO条目上,它们可能在N.ceranae的生命活动中具有重要功能。研究结果为N.ceranae的基因结构和功能注释信息的完善提供了有益补充,也为新基因的功能研究打下了基础。
熊翠玲童新宇陈华枝耿四海庄天艺郑燕珍付中民陈大福赵红霞郭睿
关键词:RNA-SEQ结构优化新基因
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