孙晓霞
- 作品数：8 被引量：11H指数：2
- 供职机构：中国科学院沈阳应用生态研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金辽宁省自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：农业科学环境科学与工程生物学更多>>
- 一种改进的亚硫酸盐测序方法
- 本发明涉及生物DNA甲基化技术，具体地说是一种改进的亚硫酸盐测序方法。将基因组DNA经酶切纯化，纯化后加入亚硫酸盐修饰液进行解链与修饰；修饰后纯化回收测序，即实现基因组DNA的测序；所述亚硫酸盐修饰液为500-550ul...
- 马珊珊赵晓辉孙晓霞刘宛孙梨宗李照令巩宗强贾春云
- 文献传递
- 铜胁迫对土壤微生物及拟南芥抗逆性的影响
- 工农业的迅猛发展,给我们带来利益的同时,也带来了严重的环境污染问题。其中污染面积最广、危害最大的环境问题是土壤重金属污染,铜已经成为我国土壤重金属污染的主要污染元素之一。土壤受到严重的重金属污染,远远超出了土壤环境的承载...
- 孙晓霞
- 关键词：铜土壤微生物抗逆性错配修复基因生物标记物
- 文献传递
- 改进亚硫酸盐测序技术研究拟南芥DNA甲基化水平被引量：1
- 2013年
- DNA胞嘧啶甲基化是一种重要的表观遗传修饰形式,在细胞增殖、分化、发育、基因组印迹、基因表达调控等过程中起着重要作用。随着对DNA甲基化研究的深入,各种DNA甲基化检测方法被开发出来满足不同类型的研究需求。通过实验建立的一种改进亚硫酸盐测序技术,将拟南芥基因组DNA经酶切纯化后,用亚硫酸盐修饰液修饰,将PCR产物克隆到pEASY-T1载体上,每个样品随机挑取15个阳性克隆,测序分析,研究拟南芥错配修复基因MutL-homologue 1(MLH1)启动子区域的甲基化水平。结果表明:与传统亚硫酸盐测序法相比,改进方法有利于DNA完全修饰,既减少了修饰时间,又提高了PCR目的片段的特异性、稳定性和重复性;MLH1基因启动子区域甲基化比率为27.3%,而不是45.6%,避免了非甲基化位点的错认。为植物DNA甲基化分析提供了一种更为理想的研究手段。
- 马珊珊孙晓霞李照令贾春云刘宛台培东赵晓辉李培军
- 关键词：DNA甲基化MLH1
- 一种改进的亚硫酸盐测序方法
- 本发明涉及生物DNA甲基化技术，具体地说是一种改进的亚硫酸盐测序方法。将基因组DNA经酶切纯化，纯化后加入亚硫酸盐修饰液进行解链与修饰；修饰后纯化回收测序，即实现基因组DNA的测序；所述亚硫酸盐修饰液为500-550ul...
- 马珊珊赵晓辉孙晓霞刘宛孙梨宗李照令巩宗强贾春云
- 文献传递
- Cu胁迫对拟南芥幼苗错配修复基因表达的影响被引量：2
- 2013年
- 采用半定量反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,以18SrRNA为内参基因,研究了Cu胁迫对拟南芥(Arabidopsis thaliana)幼苗错配修复相关基因(MLH1、MSH2、MSH3、MSH6、MSH7)表达的影响,并结合幼苗的形态和生理指标,选取Cu胁迫敏感的生物标记物。结果表明,Cu处理10d后,对拟南芥种子发芽率、地上部鲜重及叶绿素含量的影响不大;根的长度明显受到抑制;拟南芥幼苗地上部可溶性蛋白质含量随着Cu浓度增加明显降低;5个错配修复相关基因的表达均受到不同程度的抑制,Cu浓度与拟南芥幼苗上述指标之间存在明显的剂量-效应关系。以上结果表明,地上部可溶性蛋白含量变化与上述错配修复相关基因表达量的改变趋势一致,且均对Cu胁迫较敏感,可以作为检测Cu污染对植物遗传毒性效应的生物标记物。
- 孙晓霞宋有涛李照令刘宛台培东李培军
- 关键词：生物标记物错配修复基因半定量RT-PCR
- 疯牛病防治的研究进展被引量：2
- 2012年
- 疯牛病是由朊病毒引起的一种致死性人畜共患神经退行性疾病.根据近年来国际上有关疯牛病防治的研究进展,并结合本课题组最近在该领域的研究成果,以新的角度,主要从疯牛病的风险因素、演化、种间传播、防治药物和监控体系等方面做以综述,旨在为我国各级政府在"后疯牛病时期"制定相应的疯牛病的防治政策提供参考.
- 沈曼莉孙晓霞宋有涛
- 关键词：疯牛病朊病毒
- 巯基琥珀酸包被的CdTe量子点的制备及其对毕赤酵母生长的影响
- 2013年
- 以巯基琥珀酸作为稳定剂,合成CdTe量子点.通过荧光发射光谱、紫外吸收光谱对其荧光性能进行表征,结果表明在505 nm左右出现明显的特征吸收峰,在551 nm处出现一个很强的发射峰.实验又以毕赤酵母为指示生物,考察了毕赤酵母与CdTe量子点共培养后的生长曲线,结果表明CdTe量子点须控制在一定浓度(5.1μmol/L)范围内,对毕赤酵母的生长影响不大.
- 宋有涛王莹李辉董微孙晓霞
- 关键词：CDTE量子点毕赤酵母
- 镉、铜胁迫下拟南芥基因组DNA甲基化的MSAP分析被引量：6
- 2013年
- [目的]研究不同浓度Cd、Cu胁迫下拟南芥幼苗基因组DNA的甲基化水平和状态变化。[方法]以0、0.5和5.0 mg/L Cd2+、0.5和5.0 mg/L Cu2+处理21 d的拟南芥为材料,提取基因组DNA,进行甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymor-phism,MSAP)分析。[结果]0、0.5 mg/L Cd2+、5.0 mg/L Cd2+、0.5 mg/L Cu2+和5.0 mg/L Cu2+处理组DNA的MSAP比率分别为30.2%、34.7%、41.0%、33.9%、39.2%。0.5 mg/L Cd2+、5.0 mg/L Cd2+、0.5 mg/L Cu2+、5.0 mg/L Cu2+处理组的DNA甲基化多态性比例分别为2.6%、13.2%、2.4%、11.2%。[结论]Cd、Cu胁迫下拟南芥基因组DNA甲基化水平的增加及DNA甲基化多态性的提高与Cd、Cu处理浓度呈显著正相关,且Cd对DNA甲基化水平和多态性改变的作用大于Cu。
- 赵晓辉徐正进刘宛王鹤潼李照令马珊珊孙晓霞
- 关键词：拟南芥DNA甲基化镉胁迫铜胁迫MSAP
