宋文倩
- 作品数：28 被引量：131H指数：5
- 供职机构：大连市血液中心更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术农业科学更多>>
- 基于二代测序的mini-STR分型技术应用于无创产前亲权鉴定的可行性研究
- 2021年
- 目的探讨基于二代测序技术(next generation sequencing,NGS)检测孕妇血浆中胎儿短串联重复序列(short tandem repeat,STR)基因座的方法应用于无创产前亲权鉴定的可行性。方法收集28组家庭样本,首先用毛细管电泳(capillary electrophoresis,CE)法检测每组家庭STR基因型,验证父-母-婴儿的亲子关系。然后,用Illumina平台NGS测序技术检测母亲血浆中游离胎儿DNA(cell free fetal DNA,cffDNA)的23个mini-STR基因座的等位基因,筛选适合的mini-STR基因座,用于胎儿的亲权鉴定。结果对同一家庭的父亲、母亲和婴儿的STR分型结果证实28组家庭全部具有亲子关系。cffDNA样本的NGS检测结果在排除母亲DNA干扰后,与婴儿CE方法分型结果进行比对,结果显示D5S818、D19S253和D21S1270三个基因座符合率低于50%。针对余下符合率高于60%的20个基因座,将基于NGS的cffDNA的STR分型结果分别与生物学父亲和随机男性进行比对,结果显示两组一致率有显著性差异(P<0.0001),分别为75%~100%和25%~70%。结论基于NGS技术检测cffDNA的STR分型方法可应用于无创产前亲权鉴定。
- 宋文倩肖南陈玫段莹潘凌子王霓邵林楠周世航于卫建刘铭
- 慢性儿童免疫性血小板减少症差异表达基因的生物信息学分析被引量：2
- 2019年
- 目的:探究慢性儿童免疫性血小板减少症(ITP)的关键基因和信号通路,为研究慢性ITP的潜在分子机制提供新的思路。方法:从GEO数据库获得mRNA表达芯片数据集GSE46922,利用GEO2R筛选出DEGs,并利用DAVID对DEGs进行GO功能富集分析和KEGG信号转导通路富集分析。随后,构建PPI蛋白互作网络,筛选核心靶标。结果:筛选出274个表达上调基因,主要参与细胞骨架组构,基于肌动蛋白丝的过程,肌动蛋白纤维组织等生物过程。筛选出496个表达下调基因,主要参与动作电位和肌肉收缩等过程。KEGG分析发现,上调基因主要参与HIF-1信号通路。下调基因主要涉及焦点黏附、Rap1信号通路、PI3K-Akt信号通路、神经信号传递通路、肌动蛋白细胞骨架调控等信号通路。获得11个核心靶标:VEGFA,CCND1,ESR1,MYH14,ERBB2,CDKN3,PVALB,CDC20,CHEK1,MTOR和CFTR。结论:本研究通过生物信息学分析获得慢性ITP的关键基因和信号通路,为研究慢性ITP的发病机制提供了新的思路。核心靶标基因可作为诊断和预后评估的生物标志物。
- 夏悦昕王霓张力宋文倩邵林楠戚凝于卫建
- 关键词：生物信息学分析差异表达基因血管内皮生长因子A
- Duffy血型不同表型对红细胞储存及清除趋化因子的影响
- 2023年
- 目的 探讨Duffy血型不同表型对红细胞储存及清除趋化因子的影响。方法 收集24份红细胞标本,用抗人球蛋白试验法检测Duffy血型表型,使用ELISA法检测红细胞CCL2、CCL5、CXCL8以及CCL11含量及其趋化因子清除功能。使用流式分析仪检测红细胞上Duffy抗原的表达。结果 Duffy血型Fy(a+b-)与Fy(a+b+)表型的红细胞裂解液CCL2含量(41.1±14.7) pg/mL vs(63.1±20.8)pg/mL有差异(P<0.05),而CCL5(794.5±320.1)pg/mL vs(846.9±359.4)pg/mL、CXCL8(59.5±34.2)pg/mL vs(49.1±11.9)pg/mL及CCL11的含量(109.1±25.1)pg/mL vs(158.6±56.0)pg/mL均无差异(P>0.05)。Duffy血型Fy(a+b-)与Fy(a+b+)表型对于CCL2(1 471±202.1)pg/mL vs(1 860±267.5)pg/mL及CCL5清除功能(848.5±461.7)pg/mL vs(1 797±546.1)pg/mL均有差异(P<0.05),而对于CXCL8(1 851±180.7)pg/mL vs(1862±248.3)pg/mL及CCL11(691.0±125.7)pg/mL vs(781.7±293.8)pg/mL的清除功能无差异(P>0.05)。Duffy血型Fy(a+b-)与Fy(a+b+)表型的红细胞上的Duffy抗原表达平均荧光强度:(105.3±20.45)vs(111.9±18.30)无差异(P>0.05)。结论 Duffy血型Fy(a+b+)和Fy(a+b-)表型对红细胞储存及清除趋化因子的影响存在差异,Fy(a+b+)表型要比Fy(a+b-)表型红细胞能够储存更多的趋化因子以及具有更强的趋化因子清除功能。
- 周世航潘凌子宋文倩邵林楠范亚欣
- 关键词：DUFFY血型表型趋化因子红细胞
- 补体激活对EDTA抗凝血和促凝血交叉配血的影响
- 目的通过1例补体引起的疑难交叉配血,研究EDTA抗凝血和促凝血在补体激活的情况下配血结果不一致的原因。方法调查临床资料,应用血型鉴定、直接抗球蛋白试验、不规则抗体鉴定、交叉配血等血清学方法检测标本。结果当患者血浆在抗-I...
- 宋文倩
- 文献传递
- 大连地区152例RhD阴性孕妇的RHD基因分型及Rh表型分析
- 目的对大连地区152例RhD阴性血孕妇的RHD基因进行分型,并分析不同RHD基因型的RhC、c、E和e表型特征。方法分别应用单克隆抗C、抗c、抗E和抗e抗体鉴定孕妇的Rh表型;用PCR-SSP法对孕妇的RHD基因进行分型...
- 王霓邵林楠于卫建周世航夏悦昕宋文倩
- 文献传递
- 大连地区1例Bmh类孟买血型的基因分析
- 目的鉴定1例正反不符ABO血型,分析基因变异情况。方法使用标准血清学方法鉴定患者血型;对ABO基因的第6和第7外显子进行PCR扩增及测序;对FUT1基因的第4外显子和FUT2基因的第2外显子进行PCR扩增及测序分析。结果...
- 王霓宋文倩段莹于卫建周世航
- 文献传递
- 孕妇血浆中检出IgM类抗-E抗体1例
- 2017年
- 对孕妇进行抗体筛查和抗体特异性的鉴定,可预测胎儿可能受到的影响。采用抗体筛选试验测定患者血浆中是否存在不规则抗体,利用谱细胞确定抗体特异性,盐水试管法测定抗体效价。检出患者血浆中含有IgM类抗-E抗体,抗体效价为1∶2。认为该患者经过免疫刺激产生IgM类抗体,该抗体不会通过胎盘,对胎儿不会造成危害。
- 夏悦昕周世航邵林楠宋文倩于卫建
- 关键词：IGM抗-E妊娠
- 血液病患者输血前免疫血液学检查情况分析与探讨被引量：2
- 2015年
- 目的:回顾分析本地区ABO血型定型困难,红细胞不规则抗体与血小板抗体阳性在血液病患者中的发生状况,探讨其输血前检查的难点与重点。方法:使用试管法对标本进行ABO正反定型、抗体鉴定,使用固相凝集方法进行血小板抗体筛查。结果:血液病患者ABO血型正反定型的凝集强度易发生改变导致定型困难,自身与同种抗体常单独或同时存在导致供受者红细胞与血小板的不相配合,血型异常与抗体阳性的情况与血液病的种类有关。结论:血液病患者易发生血型异常、易产生红细胞与血小板抗体,应结合其病史和输血史分析输血前检查结果选择适合的血液,保证临床输血安全。
- 潘凌子王霓邵林楠宋文倩马杰周世航
- 关键词：血液病ABO定型不规则抗体血小板抗体
- 孕妇血浆宽热振幅抗-HI复合抗体检测被引量：1
- 2019年
- 目的探讨宽热振幅抗-HI复合抗体的鉴定及其特征。方法选择2017年3月因产前检查不规则抗体筛查结果呈阳性,于大连市血液中心血型室进行不规则抗体特异性鉴定的1例孕妇为研究对象。该例孕妇年龄为27岁,孕龄为37孕周,血型为AB型RhD阳性,既往经剖宫产育有一存活子女,无输血治疗史。采集孕妇及其丈夫肘正中静脉血各5 mL,用于血型鉴定、直接抗人球蛋白试验,以及不规则抗体筛查和鉴定。直接抗人球蛋白试验采用试管法;血型鉴定、免疫球蛋白(Ig)M性质不规则抗体筛查和鉴定,均采用盐水试管法。本研究遵循的程序符合2013年修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求,并与受试者签署临床研究知情同意书。结果①本例孕妇的ABO血型正定型为A1B型,反定型A细胞为阴性,B细胞弱凝集,O细胞凝集强度为2+。其ABO血型的正、反定型不符,并且存在不规则抗体。②本例孕妇直接抗人球蛋白试验结果显示,抗IgG和抗C3d均呈阴性。③本例孕妇不规则抗体筛查与鉴定结果显示,其血浆中存在IgM性质宽热振幅抗-HI复合抗体。结论对于携带宽热振幅抗-HI复合抗体的患者,应采用多种方法及试剂,对其复合抗体进行筛查和鉴定。以避免此类患者输注ABO不匹配红细胞。
- 邵林楠宋文倩王霓周世航于卫建
- 关键词：抗体输血抗体筛查
- 先天性纯红细胞再生障碍性贫血氧化应激相关差异表达基因的生物信息学分析
- 2023年
- 目的筛选先天性纯红细胞再生障碍性贫血(diamond-blackfan anemia,DBA)氧化应激相关差异基因,以及关键信号通路,为深入研究DBA的分子机制提供新的切入点。方法采用GEO数据库的mRNA表达芯片数据GSE14335,利用R语言limma包,筛选DBA患者和健康对照组的差异表达基因(DEGs),从Gene Cards数据库筛选氧化应激相关基因(OSGs),利用R语言VennDiagram包获得氧化应激相关差异表达基因(DE-OSGs)。应用R语言ClusterProfiler包,对DEOSGs进行GO分析和KEGG富集分析。通过Cytoscape构建PPI蛋白质相互作用网络,筛选核心基因。结果筛选出DBA患者和健康对照差异表达基因372个,与氧化应激相关的基因有40个,其中7个基因表达下调,33个基因表达上调。KEGG富集分析发现,氧化应激相关差异表达基因涉及到的信号通路主要有TNF信号通路、AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、NF-κB信号通路、Toll样受体等。获得10个核心靶标:IL6、PPARG、CCL2、PTGS2、CXCL8、ICAM1、NFKBIA、EDN1、HMOX1和CXCL1。结论本研究通过生物信息学方法,获得DBA氧化应激相关关键基因和相关信号通路,关键基因可能成为DBA研究的新的靶点,为研究DBA的发病机制提供了新的切入点。
- 夏悦昕刘志远宋文倩邵林楠梁晓华周世航
- 关键词：先天性纯红细胞再生障碍性贫血生物信息学分析差异表达基因氧化应激
