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张建国
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供职机构:
北京华大基因研究中心
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相关领域:
生物学
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合作作者
韩玉军
北京华大基因研究中心
倪培相
北京华大基因研究中心
黄显刚
北京华大基因研究中心
于军
北京华大基因研究中心
李松岗
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1篇
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一种基于重复序列识别的全基因组测序数据的拼接方法
本发明涉及一种基于重复序列识别的全基因组测序数据的拼接方法,首先计算散弹法测序数据中非重复片段和重复片段出现的概率分布,并根据这一概率分布确定重复序列的识别标准,然后用该标准屏蔽重复序列,再根据目标基因组的大小进行分组拼...
李松岗
王俊
盖伊·王
于军
汪建
杨焕明
倪培相
韩玉军
黄显刚
张建国
胡咏武
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水稻中受体激酶的系统树分析
2004年
植物受体激酶(RLKs)在植物细胞内的反应中发挥着重要作用。为了比较拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)和水稻(Orvza sativa L.)中受体激酶的进化关系,作者通过对北京华大基因研究中心(BGI)的籼稻蛋白质数据库进行BLASTP搜索,找到267个受体激酶类似基因,根据它们的胞外结构域可以将这些基因分为不同的类型。与拟南芥中受体激酶的系统树比较分析表明,不同类型的受体激酶具有不同的序列保守性,说明在植物进化过程中,不同类型的受体激酶具有不同的进化关系。水稻受体激酶与拟南芥受体激酶BRI1的多序列匹配结果也表明二者可能具有不同的磷酸化位点。
董亿
张建国
王永军
张劲松
陈受宜
关键词:
受体激酶
系统树
磷酸化位点
水稻
一种基于重复序列识别的全基因组测序数据的拼接方法
本发明涉及一种基于重复序列识别的全基因组测序数据的拼接方法,首先计算散弹法测序数据中非重复片段和重复片段出现的概率分布,并根据这一概率分布确定重复序列的识别标准,然后用该标准屏蔽重复序列,再根据目标基因组的大小进行分组拼...
李松岗
王俊
盖伊·王
于军
汪建
杨焕明
倪培相
韩玉军
黄显刚
张建国
胡咏武
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