段紫英
- 作品数：6 被引量：8H指数：2
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- 黄瓜EST-SSR特征分析及标记开发
- SSR标记是目前被广泛使用的分子标记之一,它具有数量丰富、分布广泛、多态性高、重复性好以及呈共显性等优点。随着大量的基因组被测序、EST被开发以及公共序列数据库的出现,都为SSR标记提供了宝贵的资源。黄瓜属于甜瓜属,是一...
- 段紫英
- 关键词：黄瓜EST-SSR
- 文献传递
- 15,665个黄瓜EST-SSR位点的引物设计及多态性检测被引量：1
- 2012年
- 目前,国际公共数据库中黄瓜EST序列数量的迅速增加为SSR标记的开发提供了极为便利的资源。本研究从葫芦科基因组数据库下载513,801条黄瓜EST,经EST-trimmer软件和CD-HIT程序预处理,共获得381,022条非冗余EST。利用Perl程序MISA搜索到SSR位点15,665个,检出率为4.11%。利用Primer3软件成功设计了9,145对黄瓜EST-SSR引物,随机抽取10对引物对5个黄瓜品种进行多态性分析发现,其中仅2对引物能检测到多态性。该数据为下一步开发新的黄瓜EST-SSR标记奠定了一定的基础。
- 段紫英胡丽芳黄长干蒋伦伟刘世强
- 关键词：黄瓜ESTSSR
- 黄瓜EST中SSR的分布特征分析被引量：2
- 2012年
- 从葫芦科基因组数据库下载513 801条黄瓜EST,经EST-trimmer软件和CD-HIT程序预处理,共获得381 022条非冗余EST。利用Perl程序MISA搜索到SSR位点15 665个,检出率为4.11%。单、二和三核苷酸重复为主导类型,占EST-SSR总数的95.98%。A/T、AG/CT和AAG/CTT作为单、二和三核苷酸的优势重复基元,分别占EST-SSR总数的21.43%、15.68%和19.27%。
- 段紫英胡丽芳黄长干蒋伦伟刘世强
- 关键词：黄瓜ESTSSR
- 蛇足石杉内生菌的分离与鉴定被引量：5
- 2010年
- 从蛇足石杉的培养组织中分离内生真菌,利用传统方法,观察菌落的外观形态,对照《真菌鉴定手册》对其进行鉴定.通过马铃薯培养基(PDA)培养菌体,通过三点接种、分区划线的方法进行分离纯化,利用显微摄影的技术进行形态观察和鉴定.从蛇足石杉的茎尖培养组织中分离出7株内生真菌,经鉴定它们分别属于盘菌属、镶孢霉属、瓶梗青霉属、青霉属、沙卡氏属、曲霉属.
- 张琳段紫英耿欣李克刚魏宗胡颂平
- 关键词：蛇足石杉内生菌
- 黄瓜EST-SSR分子标记
- 本发明公开了黄瓜EST-SSR分子标记，该方法以15个黄瓜种或品种的基因组DNA模板为研究对象，根据公布的黄瓜EST序列，采用Primer3.0引物设计软件，设计EST-SSR引物。经过PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选...
- 胡丽芳段紫英刘世强黄长干贺浩华刘秋圆贺晓鹏
- 文献传递
- 黄瓜EST-SSR分子标记
- 本发明公开了黄瓜EST-SSR分子标记，该方法以15个黄瓜种或品种的基因组DNA模板为研究对象，根据公布的黄瓜EST序列，采用Primer3.0引物设计软件，设计EST-SSR引物。经过PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选...
- 胡丽芳段紫英刘世强黄长干贺浩华刘秋圆贺晓鹏
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