王方军
- 作品数：88 被引量：44H指数：4
- 供职机构：中国科学院大连化学物理研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院科研装备研制项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学医药卫生生物学轻工技术与工程更多>>
- 基于质谱的蛋白质激酶-小分子相互作用研究进展
- 2018年
- 蛋白质激酶在生命过程中起着关键的调节作用,蛋白质激酶的异常往往会导致恶性疾病如癌症的发生。靶向蛋白质激酶的小分子抑制剂为相关疾病的治疗提供了切实可行的方案,因此研究蛋白质激酶-小分子的相互作用对于靶向药物的开发具有重要作用。质谱作为一种高精度、高通量、高灵敏度的分析仪器,在蛋白质-小分子相互作用研究领域的应用得到了快速发展。本综述总结了质谱技术应用于蛋白质激酶-小分子相互作用研究的主要策略和最新进展,探讨比较各种方法的优缺点。基于质谱的分析方法将有助于从分子水平上深刻揭示蛋白质激酶-小分子的相互作用机理,为靶向药物的设计开发提供新的思路。
- 陈津陈津
- 关键词：蛋白质激酶小分子抑制剂相互作用激酶质谱
- 蛋白质组糖基化高灵敏度分析新技术新方法
- <正>蛋白质组糖基化分析对于研究免疫应答、细胞通讯等生物学过程和癌症等重大疾病的诊断、治疗意义重大。现有的蛋白质组糖基化分析技术和方法基本上还是针对大量的毫克级蛋白质样品,对微量蛋白质样品还没有成熟稳定的糖基化组学分析技...
- 王方军邹汉法
- 关键词：糖基化
- 整体柱制备技术的新进展及其在蛋白质组学中的应用被引量：12
- 2009年
- 整体柱是通过在柱管内原位聚合或固化的方法制备得到的具有多孔结构的整体棒状固定相,与传统的填充柱相比,具有通透性好、传质速率快、容易制备等优点,因此在分离分析领域特别是生物分离分析中发挥的作用日益增大。整体柱的制备及应用近年来也得到了快速发展,层出不穷的新型整体柱已被广泛用于色谱高效分离分析、固相萃取及酶反应器等方面,大大推动了分离分析科学的发展。本文主要总结了近五年来整体柱的制备技术及其在蛋白质组学应用中的一些最新研究进展。
- 邹汉法吴明火王方军吴仁安叶明亮
- 关键词：整体柱色谱分离蛋白质组学
- 蛋白质组修饰谱分析新方法
- 翻译后修饰大多发生在具有重要生理调控功能的低丰度蛋白质分子上,其分析鉴定面临诸多技术上的挑战。为此我们发展了多种蛋白质组修饰谱分析的新技术新方法。为了实现规模化定量分析正常和肝癌人肝组织的N-糖基化蛋白组的表达差异,在利...
- 叶明亮孙珍朱俊边阳阳王方军邹汉法
- 关键词：糖基化磷酸化质谱色谱
- 一种磁性纳米材料及其制备与应用
- 本发明涉及到糖基化蛋白样品的预处理过程。具体来讲就是是一种用于糖基化蛋白样品预处理的新型磁性纳米材料。该方法基于磁性纳米材料的制备，后续糖肽树枝状大分子的修饰，以及利用亲水作用色谱对糖基化多肽的富集作用。所述的方法灵敏度...
- 邹汉法李吉楠王方军
- 超电荷试剂在蛋白质紫外激光解离质谱表征中的应用研究被引量：2
- 2022年
- 本文采用193 nm紫外激光解离质谱(UVPD-MS)研究非变性电喷雾条件下,超电荷试剂环丁砜对蛋白质序列、结构表征的影响。UVPD可在5 ns内对保持高级结构和非共价相互作用的不同价态碳酸酐酶进行快速激发解离,解离序列覆盖率达79.8%,具有较高的解离结构选择性。超电荷试剂环丁砜的引入可显著增加非变性电喷雾产生的碳酸酐酶离子的电荷数目,UVPD解离序列覆盖率提升至87.2%,实现对难解离区域的位点覆盖和序列、结构表征。加入环丁砜后,碳酸酐酶仍能保持高级结构谱学特征及与锌离子的非共价结合,锌离子结合区域等大部分结构区域的UVPD位点解离效率未见显著变化。但是,电荷数目的增加存在引起蛋白质局部结构变化的风险。
- 赵恒刘哲益郭永杰杨诗蕊王方军
- 关键词：蛋白质
- 类固醇激素的低温等离子体质谱研究
- 2017年
- 将自行设计和搭建的低温等离子体装置作为离子源,成功地与常压高分辨质谱结合,并将其用于类固醇样品的定性分析。与常规电喷雾质谱相比,用低温等离子体质谱检测类固醇样品具有样品前处理简单、谱图干扰少等优点。对类固醇样品进行了一级质谱以及串联质谱的表征,发现其一级谱图能够体现出类固醇化合物的结构稳定性,而在串联质谱图中则出现了较多的丢水碎片。本工作结合能量计算详细比较分析了典型类固醇样品在碰撞诱导解离(CID)碎裂过程中的丢水过程。另外,通过比较二级质谱的不同以及对其碎裂过程的分析推测,睾酮和去氢表雄酮这对同分异构体得以区分。
- 夏凯敏翁国锋王志鹏王方军肖春雷潘远江吴军
- 关键词：类固醇低温等离子体质谱同分异构体
- 一种位点注释的蛋白质数据库用于磷酸化肽段的鉴定被引量：2
- 2015年
- 磷酸化修饰的分析一直是蛋白质组学研究的热点之一。在鸟枪法的蛋白质组学研究中,通过在数据库检索中设定磷酸化为可变修饰可以直接鉴定磷酸化修饰的位点。但是翻译后修饰的引入会增加数据检索空间,造成鉴定灵敏度的降低。为了解决这一问题,我们构建了一种位点注释的数据库,这种数据库包含蛋白质的磷酸化位点信息,并开发了一种新的数据库检索策略用于磷酸化肽段的可靠鉴定。用不同类型的数据作为分析对象,通过Mascot检索软件对这种新的数据库检索策略进行了考察,证明了这种方法在保证鉴定结果可靠性的前提下提高了磷酸化肽段鉴定的灵敏度。
- 程凯王方军边阳阳叶明亮邹汉法
- 关键词：蛋白质组学磷酸化
- 一种静态微喷离子源
- 本发明涉及化学分析技术领域，尤其是涉及一种静态微喷离子源。包括承载及成像部分、调整部分及进样和离子化部分或纯手动进样和离子化部分，其中承载及成像部分固定在质谱进样锥前端；调整部分设置于承载及成像部分上，用于调整毛细管的位...
- 王方军郭永杰刘哲益肖春雷
- 基于两相预柱的在线二维分离系统用于人肝组织中磷酸肽的规模化鉴定
- 2012年
- 将C18反相(RP)填充柱和磷酸基强阳离子交换(SCX)整体柱集成于一体的RP-SCX两相预柱,成功用于RPLC-MS/MS系统的自动进样和SCX分级,完成了磷酸肽在线多维分离平台的构建,可以减少样品的损失,极大地提高了系统的集成化水平和检测灵敏度。对人肝组织酶解液富集的磷酸肽进行规模化鉴定,在假阳率小于1%的情况下,共鉴定到3 082条非重复的磷酸化肽段、3 056个磷酸化位点和1 332个磷酸化蛋白。对所鉴定到的磷酸化蛋白进行了功能分类和激酶分析。该实验结果对于了解蛋白质磷酸化在肝脏组织中发挥的生理学作用具有重要意义。
- 宋春侠王方军程凯边阳阳叶明亮邹汉法
- 关键词：蛋白质组学人肝
