窦岳坦
- 作品数：12 被引量：80H指数：4
- 供职机构：中国农业科学院生物技术研究所更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 固氮斯氏假单胞菌铵载体amtB基因的功能和结构分析被引量：1
- 2007年
- 固氮斯氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501是分离自水稻根际的联合固氮细菌,属变形细菌γ亚族。全基因组序列分析表明该菌含有2个紧密连锁的的铵载体蛋白编码基因amtB1和amtB2,位于同一个操纵子中glnK基因下游。铵载体蛋白AmtB1和AmtB2分别包含12和11个跨膜结构域。为研究amtB的功能,构建了amtB极性双突变株(PKOB1)。amtB极性双突变导致菌株生长缓慢;在铵浓度分别为3.3和10mmol/L条件下,其固氮酶活仍保持在0.01mmol/L的最佳固氮条件的87%和74%,而野生型已经基本尚失固氮能力。以硝酸盐为唯一氮源时,突变株细胞培养液的铵浓度可达到3.4mmol/L,而野生型并未检测到铵,表明AmtB可能参与了P.stutzeriA1501的铵离子转运,并与固氮酶活和氮代谢相关。
- 侯胜强何升窦岳坦平淑珍林敏陈明
- 关键词：斯氏假单胞菌A1501跨膜结构AMTB
- 新疆地区盐湖的中度嗜盐菌的数值分类被引量：11
- 2002年
- 对来自新疆地区盐湖的 2 9株中度嗜盐菌与 9株相关的参比菌株进行了数值分类。这些菌株是革兰氏阴性菌 ,能在 0～ 2 5 %NaCl中生长。结果表明 ,所有菌株在 76 %的相似性水平上分为 2个表观群。群I为新分离的菌株共 2 5株 ,群II为 9株参比菌株和 4株新分离的菌株。在 86 %的相似性水平上 ,供试菌株分为 3个亚群。亚群 1由 1 0株新分离的菌株组成 ,亚群 2由 8株新分离的菌株组成 ,亚群 3由 1株新分离的菌株和 5株参比菌株组成。大部分新分离的菌株聚在独立的亚群中 ,说明分离自新疆地区盐湖的中度嗜盐菌是区别于参比菌株的新类群。
- 曾静窦岳坦杨苏声
- 关键词：中度嗜盐菌
- 斯氏假单胞菌Pseudomonas stutzeriA1501氧胁迫下基因表达谱研究被引量：3
- 2008年
- 斯氏假单胞菌Pseudomonas stutzeri A1501分离自我国南方水稻田,在低铵和微好氧条件下能紧密结合在水稻根表,并侵入根内生长和固氮.为探讨氧对A1501基因组表达的影响,利用全基因组芯片技术,研究不同氧浓度(0.5%,21%)下A1501基因组表达谱,结果表明:(ⅰ)67个基因在高氧浓度下表达上调2倍以上,其中17个基因的功能未知;(ⅱ)68个基因在高氧条件下表达,其中约50%的基因参与固氮或反硝化.实时定量RT-PCR验证结果表明,4个编码氧化还原酶的基因和7个编码胞外夹膜多糖和抗原寡糖合成的基因在高氧下表达上调,其中sodC在高氧下表达上调2.7倍、编码黄素单胺氧化酶相关蛋白的基因PST1610表达上调2.2倍、编码α-酮戊二酸-铁氧化酶族氧化还原酶的基因PST3584表达上调3.2倍、编码NAD依赖型氧化还原酶的基因PST2179表达上调2.9倍.这些基因及其表达产物可能在A1501氧保护机制中发挥作用.
- 窦岳坦燕永亮平淑珍陆伟陈明张维王忆平金奇林敏
- 关键词：斯氏假单胞菌PSEUDOMONASSTUTZERIA1501氧胁迫联合固氮
- 新疆地区盐湖的中度嗜盐菌的16S rDNA PCR-RFLP分析被引量：15
- 2000年
- 对来自新疆地区艾丁湖、艾比湖和玛那斯盐湖等盐湖的２８株中度嗜盐菌与９株相关的参比菌株， 进行了１６Ｓ ｒＤＮＡ ＰＣＲ－ＲＦＬＰ分析，这些菌株是革兰氏阴性杆菌，能在０～２５％ＮａＣｌ中生长。在实验中， 选用４种限制性内切酶ＡｌｕＩ、ＨｉｎｆＩ、ＲｓａＩ和ＨａｅⅢ，将供试菌株的１６Ｓ ｒＤＮＡ的ＰＣＲ产物进行酶切，用３％ 的琼脂糖电泳分析酶切产物。结果表明，在７４％的相似性水平上分为３群。群Ⅰ包括新分离的菌株ＣＩ和 参比菌株死海色盐杆菌（Ｃｈｒｏｍｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｍａｒｉｓｍｏｒｔｕｉ）和Ｎｅｓｔｅｒｅｎｋｏｎｉａ ｈａｌｏｂｉａ；群Ⅱ包括伸长盐单胞（Ｈａｌｏｍｏｎａｓ ｅｌｏｎｇａｔａ）在内的７株参比菌株和８株新分离的菌株;群Ⅲ包括１９林新分离的菌株。
- 曾静窦岳坦杨苏声
- 关键词：中度嗜盐菌RDNAPCR-RFLP
- 固氮斯氏假单胞菌A1501的PST1305(arsC)基因遗传进化及表达调控的研究
- 固氮斯氏假单胞菌A1501(Pseudomonas stutzeri)是国际上第一株完成全基因组测序的联合固氮菌。其中一长度约49kb,编码59个基因(PSTl302～PST1359)的基因岛中含有大部分与固氮相关的基因...
- 樊慧俐窦岳坦燕永亮平淑珍林敏
- 文献传递
- 斯氏假单胞菌A1501固氮调节基因nifLA的表达调控机制研究
- ＜正＞斯氏假单胞菌A1501（Pseudomonas stutzeri）属于变形细菌γ亚群,能在水稻根系进行联合固氮, 这点是假单胞菌属中仅有的。同其它联合固氮菌相同,该菌固氮酶活受铵和氧的影响。基因组成上和棕色固氮菌（...
- 窦岳坦解志红侯胜强平淑珍陆伟张维陈明林敏
- 文献传递
- 盐单胞菌C6与耐盐有关基因的克隆、测序和表达
- 盐单胞菌(Halomonassp.)C6分离自新疆地区的盐湖.该菌可在NaCl浓度为0-25﹪的条件下生长,最适生长NaCl浓度为3-10﹪.该室已经从该菌分离得到了一段与耐盐有关的3.24KbDNA片段,经过开放阅读框...
- 窦岳坦
- 关键词：盐单胞菌融合蛋白PCR方法
- 文献传递
- 新疆地区盐湖的中度嗜盐菌16S rDNA全序列及DNA同源性分析被引量：60
- 2002年
- 通过数值分类和 1 6SrDNAPCR RFLP分析 ,对分离自新疆地区的中度嗜盐革兰氏阴性菌进行研究 ,发现了一个新类群。在此基础上 ,进行了中心株AI 3的 1 6SrDNA全序列分析 ,并与中度嗜盐菌已知种和相关种进行比较 ,得到系统发育树状图。在此树状图中 ,大多数参比菌株聚在一起 ,其 1 6SrDNA全序列的同源性在 96 %以上 ,而AI 3与参比菌株的 1 6SrDNA全序列相比 ,其相似性低于 75 %。但是 ,AI 3与Alcanivoraxborkumensis[1] 的 1 6SrDNA全序列的相似性为 96 % ,与Halobacilluslitoralis的 1 6SrDNA全序列的相似性为 99% ,三者构成一个独立的发育分支。这说明在系统发育上 ,AI 3与参比菌株属于不同的分支 ,是一个新的类群。在新类群内 ,菌株之间的DNA同源性大于 70 % ,而中心株AI 3与标准菌株伸长盐单胞菌(Halomonaselongata)的DNA同源性为 44% 。
- 曾静窦岳坦王磊杨苏声
- 关键词：DNA-DNA杂交系统发育嗜盐菌DNA同源性
- Pseudomonas stutzeri A1501基因组结构及功能注释被引量：4
- 2008年
- 采用全基因组"shotgun"方法完成了固氮斯氏假单胞菌A1501的全基因组序列测定,并进行了基因组结构与功能注释分析。A1501基因组全长4 567 418 bp,含有4 146个ORFs。该基因组中已鉴定了42个编码转座酶的重复序列,这些序列的存在预示着转座现象在A1501菌中非常活跃,预示该菌与其他生物之间基因交流可能比较频繁。比较基因组表明,为了适应特定的生存环境,假单胞菌在基因组结构和遗传信息容量上产生了明显的分化。此外,基因组分析鉴定了A1501环境适应的遗传基础,包括物质转运、信号传导和趋化系统等,这些系统是细菌能够在根际土壤环境中保持竞争力以及能够与水稻形成高效联合固氮体系的关键。A1501基因组的完成为进一步开展功能基因组学和蛋白质组学研究奠定了基础。
- 燕永亮杨剑窦岳坦平淑珍王忆平金奇林敏
- 关键词：基因组测序斯氏假单胞菌A1501联合固氮比较基因组学
- 固氮斯氏假单胞菌固氮调节基因ntrB的功能研究
- 2008年
- 利用三亲接合的方法将含有 ntrB 基因部分序列的自杀载体导入固氮斯氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501中,获得了 ntrB 基因的非极性突变株(AdnB)。RT-PCR实验证明,AdnB 菌株中与 ntrB 连锁的下游基因 ntrC 能正常转录;ntrB 基因的非极性突变导致细胞完全丧失固氮能力,但其突变株能在含 NH_4^+的基本培养基 K 中正常生长;在以硝酸盐为唯一氮源时,AdnB 比野生型 A1501的细胞生长延迟约14～18 h,认为 ntrB 基因与硝酸盐的氮代谢有关。功能互补实验结果表明,AdnB 的功能互补菌株能完全恢复细胞的固氮作用和对硝酸盐的利用。
- 高淼陈明何升窦岳坦侯胜强平淑珍张维陆伟王玉炯林敏
- 关键词：斯氏假单胞菌A1501
