耿帅锋
- 作品数：41 被引量：11H指数：2
- 供职机构：中国农业科学院作物科学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金博士科研启动基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- CIMMYT新引进合成小麦株高性状全基因组关联分析被引量：6
- 2021年
- 株高是影响小麦产量的重要农艺性状。本研究对从国际玉米小麦改良中心(CIMMYT)新引进的152份合成小麦在3个环境下的株高进行了观察和统计,并利用55 K单核苷酸多态性(SNP,single nucleotide polymorphism)芯片进行全基因组关联分析(GWAS,genome-wide association study),以挖掘与株高相关的新的遗传位点。结果表明:合成小麦株高呈正态分布,变异丰富。不同环境下的平均株高为97.9 cm,显著高于栽培小麦(70.5 cm),但低于黄淮麦区农家小麦(114.8 cm)。方差分析显示3个环境下,株高在基因型之间都表现出极显著的差异。3个环境下联合方差分析发现株高表型在基因型、环境以及基因型环境互作方面表现出极显著的差异。对获得的55K SNP标记经最大杂合率、最小等位基因频率及最大等位基因频率过滤,在合成小麦群体中发现37916个有效SNP,其中A、B和D 3个亚基因组上各有14404个、14566个和8946个。群体结构分析结果表明,152份合成小麦可分为3个类群。利用混合线性模型(MLM,mixed liner model)对不同环境下平均株高和最佳线性无偏预测值(BLUP,best linear unbiased prediction)进行GWAS分析,筛选到24个显著标记(P≤0.0001),分别位于1A、3B、4A、4B、4D、5A、5B、6A、6D和7B染色体上,单个标记可解释12.33%-20.10%的表型变异。BLUP值分析共获得10个显著标记,对标记物理位置3 Mb左右距离内的669个基因进行转录组数据筛查,得到131个在茎或叶中高表达(TPM≥5)。通过与水稻同源基因的比较,明确其中5个基因可能与小麦株高发育有关。鉴于这些位点与以往已定位的株高数量性状位点并不重叠,本研究的工作可为小麦株高改良提供新的种质和分子标记。
- 张红杰邓中印陶姝孙国梁贾美玲王振玉廖如意郑兴卫李爱丽毛龙郑军耿帅锋
- 关键词：株高全基因组关联分析
- 小麦TaFBX113基因在调控粒厚发育中的应用
- 本发明涉及小麦TaFBX113基因在调控粒厚发育中的应用，属于作物分子生物学领域。本发明提供小麦TaFBX113蛋白及其编码基因或TaFBX113蛋白的编码基因的抑制因子在调控植物粒厚中的应用。本发明在EMS诱变库中证实...
- 耿帅锋廖如意李爱丽毛龙
- 文献传递
- 小麦TaAGO4a-D抗体、蛋白及其编码基因和应用
- 本发明公开了一种小麦TaAGO4a-D蛋白及其编码基因，其中，所述TaAGO4a-D蛋白为：（1）SEQ ID No.3所示的氨基酸序列组成的蛋白质；（2）SEQ ID No.3所示的氨基酸序列经取代、缺失或添加一个或几...
- 毛龙李爱丽耿帅锋武亮
- 小麦TaCPK2蛋白在植物抗病育种中的应用
- 本发明公开了小麦TaCPK2蛋白在植物抗病育种过程中的应用。本发明的优点在于，本发明的小麦TaCPK2基因，其属于CDPK基因家族参与植物对病原防卫的基因，在小麦中抑制TaCPK2基因的表达能够明显影响小麦对白粉病抗性，...
- 毛龙李爱丽武亮汤丽川耿帅锋
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- 小麦TaSPL6基因及其应用
- 本发明提供了小麦TaSPL6基因及其应用，属于作物分子生物学领域。本发明设计特异性引物从中国春小麦叶的cDNA中克隆TaSPL6的编码区序列，利用缺体四体将TaSPL6定位在小麦第五同源群上，TaSPL6基因编码区序列在...
- 毛龙李爱丽王炳南耿帅锋冯楠
- 文献传递
- 小麦TaPRR95-B蛋白或其编码基因在调控植物株高中的应用
- 本发明涉及涉及基因工程技术领域，尤其涉及小麦TaPRR95‑B蛋白或其编码基因在调控植物株高中的应用。本发明研究发现小麦TaPRR95‑B蛋白在调控植物株高存在关键作用，当敲除植物中小麦TaPRR95‑B蛋白的编码基因时...
- 李爱丽陶姝毛龙耿帅锋
- 文献传递
- 小麦TaSPL3基因及其应用
- 本发明提供了小麦TaSPL3基因及其应用，属于作物分子生物学领域。本发明设计特异性引物从中国春小麦叶的cDNA中克隆TaSPL3的编码区序列，利用缺体四体将TaSPL3定位在小麦第六同源群上，TaSPL3基因编码区序列在...
- 毛龙李爱丽王炳南耿帅锋冯楠
- 文献传递
- 小麦TaCPK2蛋白在植物抗病育种中的应用
- 本发明公开了小麦TaCPK2蛋白在植物抗病育种过程中的应用。本发明的优点在于，本发明的小麦TaCPK2基因，其属于CDPK基因家族参与植物对病原防卫的基因，在小麦中抑制TaCPK2基因的表达能够明显影响小麦对白粉病抗性，...
- 毛龙李爱丽武亮汤丽川耿帅锋
- 文献传递
- 小麦TaCPK7启动子及其应用
- 本发明提供了一种小麦过氧化氢诱导型启动子TaCPK7P及其应用，该启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。利用本发明提供的启动子构建重组表达载体，然后将所述表达载体通过农杆菌介导的方法瞬时转化烟草，启动下游重组基...
- 毛龙李爱丽耿帅锋赵永亮
- 文献传递
- 小麦中成对钙依赖性蛋白激酶的保守性和亚功能化研究
- 小麦是世界上重要的粮食作物之一,世界上大约35%的人口以小麦为主食。在我国,小麦是第二大粮食作物,环境胁迫和各种病害严重影响小麦的产量和质量。钙依赖性蛋白激酶(calcium-dependent protein kina...
- 耿帅锋
- 关键词：CDPK小麦
- 文献传递
