肖国辉 作品数:7 被引量:5 H指数:2 供职机构: 浙江农林大学 更多>> 发文基金: 浙江省自然科学基金 国家自然科学基金 浙江省科技攻关计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 经济管理 更多>>
新开发的禾本科通用性分子标记的检测与评估 被引量:2 2014年 为开发更多的适用于禾本科Poaceae植物通用性分子标记,丰富竹类植物的遗传信息,依据禾本科单拷贝同源基因(COSⅡ)已知序列的保守区域设计了14对引物,以此引物对刚竹属Phyllostachys植物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,并对部分扩增产物进行测序。结果所有引物可以在至少1个材料中得到特异性扩增,其中7对引物在5个供试材料中均能扩增到产物,13对引物在5个样本中表现出多态性,占引物总数的92.9%。对部分扩增产物进行测序,所测序列均为特异性扩增序列。同一引物在不同样本中的扩增片段间存在单核苷酸多态性(SNP)位点,部分SNP位点会导致氨基酸序列提前终止或酶切位点变化。对有合适内切酶存在的变异位点进行PCR-RFLP验证,验证结果与测序结果一致。利用NTsys 2.10e软件,对5个供试竹种材料进行了亲缘关系分析,毛竹Phyllostachys edulis与绿粉竹Phyllostachys virdiglaucescens亲缘关系最近,紫竹Phyllostachys nigra与其他4个竹种亲缘关系最远。所开发的14个COSⅡ引物在刚竹属植物中具一定通用性,同时挖掘出更多竹类植物中的遗传信息。 李兵娟 肖国辉 许在恩 郭小勤关键词:竹类植物 COSII分子标记在刚竹属的通用性 被引量:1 2013年 应用30对COSII引物对刚竹属4个竹种及其一个栽培变型进行PCR扩增,电泳结果显示,所有引物都可以在至少3个竹种中获得特异性PCR产物,共扩增出101条带,其中88条表现出多态性,占87.13%。其中2对引物在5份材料中均扩增出一致的多拷贝条带。利用NTsys 2.10e软件,对5个供试竹种材料的亲缘关系进行了分析,从聚类结果看,当遗传系数为0.658时,5个供试材料可以分为3类,紫竹与花哺鸡竹各自单独成一类,桂竹、罗汉竹和斑竹的亲缘关系比较近,形成第3类。这一分类结果与形态学分类结果大致吻合,表明基于水稻等禾本科植物的基因组序列开发出来的COSII分子标记在竹类植物中具一定通用性,且可用于鉴定竹种间的亲缘关系。 肖国辉 钱纪梅 李兵娟 许在恩 郭小勤关键词:COS 刚竹属 亲缘关系 COSⅡ分子标记在刚竹属竹类植物中的通用性 30对COSⅡ引物对刚竹属4个竹种及其一个栽培变型进行PCR扩增,电泳结果显示,所有引物都可以在至少3个竹种中获得特异性PCR产物,共扩增出101条带,其中88条表现出多态性,占87.13%.其中几对引物表现出多拷贝的特... 肖国辉 钱纪梅 李兵娟 许在恩 郭小勤关键词:竹类植物 刚竹属 亲缘关系 新开发的禾本科通用性分子标记的检测与评估 究依据禾本科单拷贝同源基因(COSⅡ)已知序列的保守区域设计了14对引物,以此引物对5个竹种进行PCR扩增,并对部分扩增产物进行测序.结果有13对引物可以在至少1个材料中得到特异性扩增,其中7对引物在5个供试材料中均能扩... 李兵娟 肖国辉 许在恩 郭小勤关键词:禾本科 亲缘关系 雷竹PvCO基因克隆和功能分析 拟南芥CONSTANS/(CO/)是光周期途径中控制开花时间的关键基因,CO突变体在长日照条件下花期延迟,短日照对其花期没有影响。过表达CO基因的拟南芥在长日照及短日照条件下花期均可提前。本文以雷竹/(Phyllosta... 肖国辉关键词:雷竹 RT-PCR 酵母双杂交 亚细胞定位 转基因 文献传递 紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析 根据已报道的禾本科植物PPO基因的保守序列(CuA和CuB区)设计一对引物,分别从紫竹9个不同栽培变型中克隆到PPO基因片段.序列分析显示,9个序列彼此间核苷酸水平上一致性达到92.35%,氨基酸水平上的一致性达到81.... 肖国辉 王弋 娄永峰 林新春 郭小勤 方伟关键词:SNP 紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析 被引量:3 2013年 根据已报道的禾本科Poaceae植物PPO基因的保守序列(CuA和CuB区)设计1对引物,分别从紫竹Phyl-lostachys nigra 9个不同栽培变型中克隆到PPO基因片段。序列分析显示:9个序列彼此间核苷酸水平上一致性达到92.35%,氨基酸水平上的一致性达到81.83%。在某些栽培类型,一年紫和沟槽紫,该基因存在提前终止的现象。所获得的9条序列间存在明显的单核苷酸多态性(SNP)位点,多数位点引起非同义突变。根据所测得的序列对紫竹不同栽培类型的亲缘关系进行了遗传多样性分析。 肖国辉 王弋 娄永峰 林新春 郭小勤 方伟关键词:植物学