刘海波
- 作品数：6 被引量：8H指数：2
- 供职机构：石河子大学更多>>
- 发文基金：国家重大基础研究前期研究专项国家杰出青年科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 新疆军垦型细毛羊基因组BAC文库的构建被引量：3
- 2006年
- 选用新疆特有的军垦型细毛羊为材料,构建了含有190464个克隆的全基因组BAC文库.文库的平均插入片段大小为133kb,同时文库92.5%克隆插入片段大于100kb,而且有部分克隆甚至大于300kb,这将满足大多数基因筛选的要求.假定绵羊的基因组含有3×106kb,根据文库的平均插入片段大小为133kb,计算的文库基因组覆盖率为8倍.因此,从文库筛选到目的片段的概率为98.208%.该文库中插入的外源片段来自新疆军垦型细毛羊的基因组,这对于研究新疆军垦型细毛羊的特殊性状的基因与其它绵羊品种和物种之间的差异,以及构建其全基因组物理图谱和基因图谱的完善是非常有利的.
- 李谨杨公社陈创夫刘海波马润林王金富
- 关键词：基因组BAC文库
- 绵羊钙调蛋白调节基因Calponin h1的分子克隆
- 2005年
- 在一项研究中发现,雌激素受体在胚胎发育后期对绵羊子宫平滑肌Calponin(CaP)基因的活动有明显上调作用,而CaP一直被作为观察其他基因表达水平变化的基准参照基因(ReferenceGene)。迄今为止,绵羊CaP尚未完整克隆,为进一步了解其结构和功能,根据人、小鼠和家猪的同源保守区序列设计锚定寡核苷酸引物,通过5′RACE及3′RACE方法克隆了绵羊子宫平滑肌组织全长CaPh1cDNA(GenBank登录号:AY327118),在cDNA序列的基础上,又通过PCR SSP方法获得了CaPh1基因除内含子1、2之外的其余4个内含子全部序列(GenBank登录号分别为:AY771807,AY771808,AY771809,AY771810)。DNA序列测定和分析表明,绵羊子宫平滑肌CaP h1cDNA全长1499bp,编码297个氨基酸,5′UTR及3′UTR分别为79bp和529bp。CaPh1基因组DNA的克隆和序列分析表明,绵羊CaP全长约8kb,由7个外显子和6个内含子组成。同源序列比较发现,该基因外显子在不同物种间相对保守;与人类、野猪、小鼠、大鼠和鸡CalponinmRNA同源性分别为88%、92%、81%、79%和81%,但不同物种间内含子存在较大差异(>50%)。填补了绵羊CaP基因分子克隆的空白,为进一步研究该基因的功能及子宫平滑肌收缩的调节机理奠定了基础。
- 岳作军宋俊芳黄朝峰刘海波朱朝辉张晓娟张毅谭萍萍马润林
- 关键词：绵羊CALPONIN分子克隆
- 新疆细毛羊2倍基因组BAC文库PCR筛选系统的构建与使用被引量：2
- 2006年
- 本研究所构建的BAC文库覆盖了8倍新疆细毛羊的基因组，平均插入片段的大小为133kb．同时文库92．5％的克隆插入片段大于100kb，而且有部分克隆甚至大于300kb，假定绵羊的基因组含有3×10^6kb，根据文库的平均插入片段大小为133kb，从文库筛选到目的片段的概率为98．208％。为了验证文库有较好的覆盖率．构建了2倍基因组文库PCR筛选系统，并对位于新疆细毛羊20号染色体MHC基因邻近区段的DMB_EX2、MCMA36、CP73和BM12584个分子标记进行了筛选．得到的平均阳性克隆数为1．5个，从筛选结果来看，这与文库插入片段估计的8倍基因组覆盖率相当接近并且没有偏向，这使得本文库成为研究绵羊的功能基因、位置克隆和完善基因组物理图谱的极为有用的资源。
- 李谨杨公社陈创夫刘海波马润林王金富
- 关键词：新疆细毛羊基因组BAC文库
- 新疆细毛羊基因组第20号染色体MHC邻近区段高密度物理图谱
- 陈创夫马润林王金富李瑾刘海波高剑峰刘守仁杨磊王新华杨公社柳建新郭志儒詹勇华腾文军王鹏燕
- 项目以新疆细毛羊为研究材料，成功构建了绵羊基因BAC文库，并绘制了绵羊第20号染色体MHC基因邻近区段高密度物理图谱，为今后在分子和细胞水平上进一步深入研究新疆细毛羊的遗传特性、生长发机理和筛选重要经济性状基因提供了科学...
- 关键词：
- 关键词：细毛羊绵羊分子生物学
- 小鼠Mater基因选择性剪接变异体的鉴定和分析被引量：3
- 2004年
- 位于小鼠第 7号常染色体的Mater (Maternalantigenthatembryosrequire)编码一个卵母细胞特异的自身抗原 ,与小鼠自免疫性卵巢退化疾病密切相关。在发现Mater基因存在选择性前切现象的基础上 ,通过RT PCR技术 ,在 3个近交品系小鼠 (CBA/J、SWR/J、B6 )中发现并初步验证了Mater基因mRNA的 4种选择性剪接变异体 ,分别命名为B、E、F、G型。其中B型与以前报道的一致 ,具有MatermRNA的全部外显子 ,E、F、G为新发现的剪接变异体 ,其选择性剪接位点都位于阅读框内。E变异体缺失了外显子 6 ,F变异体保留了部分内含子 8并且缺失了外显子 10 ,G变异体缺失了部分外显子 14 ,它们所有的内含子与外显子结合处的DNA序列都遵循“GT AG”剪接规则。B、E、F在B6、CBA/J和SWR/J小鼠品系中均存在 ,G仅存在于SWR/J。根据新发现的 3种剪接变异体的cDNA序列推导出对应的预期蛋白异形体的氨基酸序列 。
- 程慧张晓娟刘海波张毅黄朝峰马润林
- 关键词：RT-PCR选择性剪接
- 中国美利奴细毛羊细菌人工染色体（BAC）文库的构建及MHC区段物理图谱的绘制
- 绵羊是许多国家的国民经济中占有重要地位的家畜之一，拥有许多重要的可遗传的经济性状，同时绵羊也是重要的模式动物之一。但是，目前我们对绵羊的基因组信息知之甚少，仅有中等密度连锁图可供参考。开展绵羊全基因组的研究旨在寻找并研究...
- 刘海波
- 关键词：绵羊物理图谱细菌人工染色体
- 文献传递
