夏薇
- 作品数：19 被引量：31H指数：3
- 供职机构：中国热带农业科学院椰子研究所更多>>
- 发文基金：海南省自然科学基金国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 一种适合油棕不同组织RNA提取的方法被引量：1
- 2014年
- 获得高质量的RNA是开展油棕果实发育相关分子生物学基础研究的重要前提和保障。以油棕成熟果肉、胚乳、胚和胚芽4种组织为材料,分别采用Invitrogen公司的Trizol试剂和MRIP法提取总RNA,并比较其提取效果。结果表明:MRIP法提取的RNA质量较好,其中胚芽中的总RNA提取量高达2 139.0 ng/μL,而胚乳中的含量相比较低,仅为1 083.6 ng/μL;MRIP法的总体提取效果优于Trizol试剂,包括RNA完整性、含量、纯度等,适用于油棕及棕榈科植物总RNA提取。
- 李静王永杨耀东雷新涛肖勇夏薇
- 关键词：油棕果实
- 一种RNA的提取液、制备方法及油棕果RNA提取方法
- 本发明涉及生物技术领域，公开了一种RNA的提取液、制备方法及油棕果RNA提取方法。本发明所述的RNA提取液各组分均为常用的试剂，制备方法简单，质量稳定可控。采用本发明所述的RNA提取液提取油棕果的RNA，所得的油棕果RN...
- 肖勇夏薇周丽霞杨耀东李静
- 文献传递
- 多倍体在植物进化中的意义被引量：7
- 2013年
- 几乎所有的开花作物都为多倍体植物,其基因组至少经历1次以上的全基因组加倍事件。随着测序技术的不断革新,人们对作物的基因组以及基因组的演化历史有了全新认识。分析了全基因组加倍在物种进化中的意义:多倍化改变基因组结构,丰富物种的遗传多样性,改变重复基因表达模式,增强物种的适应性,并展望多倍化在作物遗传育种中的应用。
- 肖勇杨耀东夏薇雷新涛马子龙
- 关键词：进化多倍化重复基因多倍体
- 一种用于香水椰子种苗纯度的鉴定的特异SSR引物及鉴定方法
- 本发明涉及香水椰子种苗栽培技术领域，公开了一种用于香水椰子种苗纯度的鉴定的特异SSR引物及其鉴定方法，先提取出香水椰子种苗的DNA，再用以上的特异SSR引物进行PCR扩增，扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离条带，染色，即可...
- 杨耀东吴翼沈雁肖勇夏薇李静周立霞
- 棕榈科植物基因克隆方法的优化
- 2014年
- 【目的】优化棕榈科植物基因克隆方法,为其基因组学研究和分子育种奠定基础。【方法】通过优化DNA提取和目的片段回收步骤,检测其对提取DNA质量和纯度、目的片段回收率与阳性克隆等的影响。【结果】DNA提取方法优化后,提取获得的DNA完整性好,无杂质、无弥散现象,质量较好,其OD260/OD280在1.88-1.93;优化前不同样品提取的DNA仅为40.0-60.0 ng/μL,优化后样品DNA在104.5-214.8 ng/μL,为优化前的2-3倍;目的片段回收方法经优化后,可以从扩增的PCR产物中回收获得条带较清晰的目的片段,其胶回收率较高;对回收的目的片段进行亚克隆,以gyspy74引物鉴定阳性克隆,每个样品的菌落均在700 bp左右扩增获得清晰的目的条带,且其中3个菌落的目的条带测序结果与预期核酸序列一致。【结论】优化后的方法适用于棕榈科植物基因克隆。
- 李静王永杨耀东雷新涛夏薇
- 关键词：棕榈科植物基因克隆
- 椰子保守microRNA预测和特征分析被引量：2
- 2014年
- 根据释放的椰子转录组序列和miRBase数据库中的microRNA （miRNA）序列信息,分析椰子中保守miRNA及其相应靶基因的特征.根据miRBase数据库中植物miRNA序列,共预测了41个miRNA,分别属于22个miRNA家族.这些miRNA家族中13个家族在植物中非常保守,miRBase至少在19个物种中检测到,而miR902、miR2673和miR414这3个家族不保守,仅在1～2个物种中检测到.这些预测的miRNA的成熟序列长度大多为21个碱基（59.5％）,而前体序列的长度大多为50～100个碱基（61.9％）.分析miR396家族前体序列时发现,成熟miRNA和成熟miRNA＊（成熟miRNA形成发卡结构互补的序列）序列很保守,但是中间的序列变异很大.此外,预测miRNA的靶基因发现保守的miRNA家族的靶基因为一些重要的转录因子家族,与植物的生长发育相关,而不太保守的miRNA家族的靶基因编码与表型控制相关的蛋白.
- 夏薇李静周丽霞杨耀东肖勇马子龙
- 关键词：椰子靶基因
- 油棕乙酰CoA羧化酶(ACC)基因的鉴定与表达分析
- 2017年
- [目的]对油棕乙酰CoA羧化酶(ACC)基因进行鉴定与表达分析。[方法]采用生物信息学方法鉴定油棕的ACC基因,并应用拟南芥的ACC基因蛋白质序列比对油棕的蛋白质库,应用已有油棕转录组信息,研究ACC基因在不同组织中的表达情况。[结果]在油棕中鉴定了2个ACC基因,命名为EgACC1和EgACC2。EgACC1不含内含子,而EgACC2含有32个内含子;EgACC1在不同组织中都没有表达,而EgACC2在所有组织中都有表达,其中在组培苗中有较高的表达量,同时,在油棕果发育21 d时有高的表达水平,RPKM值为70.6,为所有组织中最高。[结论]该研究阐述了油棕ACC基因的表达模式,为油棕ACC基因的功能分析奠定了基础。
- 肖勇雷新涛王永曹红星石鹏金龙飞夏薇
- 关键词：油棕转录组
- 一种用于香水椰子种苗纯度鉴定的特异SSR引物及鉴定方法
- 本发明涉及香水椰子种苗栽培技术领域，公开了一种用于香水椰子种苗纯度的鉴定的特异SSR引物及其鉴定方法，先提取出香水椰子种苗的DNA，再用以上的特异SSR引物进行PCR扩增，扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离条带，染色，即可...
- 杨耀东吴翼沈雁肖勇夏薇李静周立霞
- 文献传递
- 高等生物着丝粒序列更新与进化的研究进展
- 2014年
- 综述了近年来国内外在高等生物着丝粒序列更新与进化方面的研究进展,包括着丝粒序列的进化与变异、着丝粒序列变异的分子机制(插入缺失、扩增)以及着丝粒序列的选择动力等。
- 夏薇杨耀东肖勇周丽霞李静马子龙
- 关键词：高等生物着丝粒
- 高等植物着丝粒序列的结构与特征研究被引量：3
- 2014年
- 着丝粒是染色体的重要组成成分之一,在细胞有丝分裂和减数分裂中行使重要的生物学功能,着丝粒在不同的物1种中保持着一致的功能,即在细胞分裂中期,着丝粒在纺锤丝的牵引下使染色体向两级运动,从而完成细胞的分裂。如此保守的功能,是乎暗示着丝粒序列不同物种间具有一定的保守性,然而随着测序技术的发展,越来越多的物种的基因组序列被释放,分析发现着丝粒序列主要由重复序列和反转录转座子组成,然而不同物种着丝粒序列比对发现,它们之间的同源性极低,此外染色体的着丝粒的序列的组成和大小都相差甚远。文中回顾了近些年在着丝粒研究方面所取得的进展,探讨维持着丝粒功能稳定性的序列结构特征。
- 夏薇李静周丽霞杨耀东肖勇马子龙
- 关键词：着丝粒反转录转座子稳定性同源性
