宋娟
- 作品数：4 被引量：34H指数：3
- 供职机构：南京农业大学园艺学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 果梅PmKNAT2基因全长cDNA克隆及表达分析被引量：4
- 2014年
- 【目的】从‘大嵌蒂’果梅中克隆PmKNAT2,并对其结构特征及表达模式进行分析,为研究果梅雌蕊败育的分子机理和分子育种奠定基础。【方法】在NCBI中查找与果梅相似性很高的桃KNOPE2(KNAT2的同源基因)序列(EF093491),根据桃的KNOPE2序列设计特异引物;采用改良CTAB法提取‘大嵌蒂’果梅花芽总RNA;通过RT-PCR和RACE技术获得基因cDNA序列全长;使用DNAMAN软件进行序列拼接;利用NCBI数据库中的BLASTn和BLASTp程序进行相似性分析;通过生物信息学方法分析结构特征;用DNAMAN软件分析基因的ORF和氨基酸序列;MEGA4.0软件进行系统进化树的构建;利用Bioxm2.6推测分析蛋白分子量和等电点;根据NCBI中Conserved Domains程序进行蛋白质保守域结构预测;用ExPaSy提供的在线SOPMA程序进行蛋白质二级结构预测;构建PJIT166-PmKNAT2-GFP的融合亚细胞定位表达载体,采用基因枪法转化洋葱表皮细胞,经暗培养后在激光共聚焦显微镜下观察;利用实时荧光定量RT-PCR研究其表达模式,分析其在‘大嵌蒂’花芽发育不同时期、不同器官中的表达特性。【结果】在‘大嵌蒂’果梅中获得一个KNAT2的同源基因,命名为PmKNAT2,其cDNA全长为1 402 bp,5'UTR47 bp,3'UTR 293 bp,编码区全长为1 062 bp,编码353个氨基酸,预测蛋白质分子量为40.41 kD,理论等电点为4.85。蛋白结构分析表明该基因编码的氨基酸具有2个结构域,MEINOX结构域(KNOXⅠ和KNOXⅡ2个亚结构域)和HD(homomeodomain)结构域,属于KNOX蛋白;相似性分析发现该基因与GenBank中其它来源的KNOX蛋白序列的相似性为50%—100%;系统进化树分析显示果梅PmKNAT2与桃KNOX聚为一类,表明与其亲缘关系最近。二级结构预测结果表明PmKNAT2所编码蛋白由47.14%的α-螺旋(Alpha helix)、3.43%的β-转角(Beta turn)、3.14的β-折叠(Extended strand)和46.29%的随机卷曲(Random coil)组成。亚细胞定位结果显示该基因编码的蛋白定位于细�
- 孙海龙宋娟高志红倪照君章镇
- 关键词：果梅雌蕊败育基因克隆
- 果梅PmARF基因及其应用
- 本发明属于基因工程领域，提供一种果梅PmARF基因及其应用，具体涉及包括该基因的重组载体和工程，以及在植物花器官形态培育和改良中的应用。该基因序列如SEQ ID NO.1，该基因不仅参与花器官的形态建成，还参与调控植物、...
- 高志红宋娟倪照君侍婷
- 文献传递
- 果梅PmARF基因的克隆及功能分析
- 果梅(Prunus mume Sieb.et Zucc.)原产于中国，为蔷薇科李属植物。梅花具很高的观赏价值，梅果实营养丰富。果梅中雌蕊败育现象严重，并且严重影响果梅产量。本研究通过生物信息学方法鉴定和识别了梅基因组中A...
- 宋娟
- 关键词：果梅基因克隆生物信息学
- 植物生长素响应因子ARF与生长发育被引量：28
- 2017年
- 本文根据国内外最新研究成果详细介绍了几种模式植物、果树、蔬菜、花卉、粮食作物、林木等植物生长素响应因子(ARF)基因家族的鉴定、分子结构、信号转导机制、时空表达模式以及ARF在生长发育中的生物学功能,并在不同物种ARF家族间进行了多方面比较,以期总结出ARF家族共有的特征和差异,为揭示ARF在植物生长发育中的调控机制提供参考。综述相关研究表明,ARF在信号转导途径中受光信号、生长激素、环境条件、microRNA及ta-siRNA等的变化影响植物的内源性反应,从而调控植物的生长发育。最后,分析了在植物ARF研究中存在的问题,并对其未来研究方向进行了展望。
- 李艳林高志红宋娟王万许侍婷
- 关键词：生长素信号转导生长发育
